バックボーン　二次構造 全選択　タンパク質選択　リガンド選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 　 　　 背景・黒　灰　白　紺

エタノール溶媒中のペプチド系抗生物質グラミシジンD（グラミシジンA＋C）の構造例 1alz（リガンドは座標2種のうちAのみ）
※グラミシジンA1（gramicidin A1）関連ニュース例：A natural biomolecule has been measured acting like a quantum wave for the first time（MIT Technology Review，2019/11/09）
［Gramicidin - Wikipedia］

1alz_EOH_507A（SITEにDLE含む。H原子は手動で追加） I'/O'＝0.7222（DLE除いて） CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順 背景・黒　灰　白　紺

バックボーン　二次構造 全選択　タンパク質選択　リガンド選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 　 　　 背景・黒　灰　白　紺

エタノール溶媒中の接合ホルモンER-1の構造例 2erl（リガンドは座標2種のうちAのみ）

2erl_EOH（H原子を手動で追加） I'/O'＝1.3438 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順 背景・黒　灰　白　紺

バックボーン　二次構造 全選択　タンパク質選択　リガンド選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 　 　　 背景・黒　灰　白　紺

エタノールを含むKチャネル構造例 3auwの8量体（Chain AB×4）

3auw_EOH I'/O'＝1.1538 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順 背景・黒　灰　白　紺