◆ユビキチン関連PDBデータ例
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タンパク質バックボーン 同・二次構造
DNA/RNA(ATGCU)
リガンド表示 OFF
水分子表示(*印データのみ) OFF
全選択 リガンド選択 タンパク質選択 DNA/RNA全選択 同・糖&リン酸選択
Lys選択,球棒・赤色表示
空間充填 球棒 スティック OFF
CPK色 amino色 | ラベル表示 OFF
ドット表面表示 OFF
静電ポテンシャル OFF 親油ポテンシャル OFF
水素結合(細) 同(太) OFF
S-S結合(太) OFF S原子(Protein中)空間充填
光沢表示 OFF | 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白 回転 OFF | 画像をクリップボードへコピー
酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
hydropathy index順
有機概念図I/O値順(特性基 R)| 同(アミノ酸)
等電点順
※amino表示の凡例 ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO = 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 = ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS ※極性〈酸性・塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別 SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP ※hydropathy index順 ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE ※有機概念図I/O値順(特性基 R) ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE ※同上(アミノ酸) GLY SER ASN ASP GLN THR GLU ALA ARG HIS VAL LYS CYS PRO LEU TYR ILE MET TRP PHE ※等電点順 ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP VAL GLY LEU ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG
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