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全選択 タンパク質選択 リガンド選択 DNA/RNA選択 同backbone選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 糖鎖別着色： Gal，α-Glc，β-Glc，Man，Fuc，Xyl，Sia，GalNAc，GlcNAc，GlcA 水素結合表示 ｜ ｜ 背景・黒 灰 白 紺 |
1h2c（エボラウイルスのVP40タンパク質；RNAが結合した8量体リング，Chain A・R×8） 2i8b（エボラウイルスのVP30タンパク質） 3csy#（エボラウイルス糖タンパク質3量体；ヒト由来抗体結合） 同 Chain I-N（エボラウイルス由来の一部のみ；中心部） 3fke（エボラウイルスのVP35タンパク質） 3v7o（エボラウイルスのVP30タンパク質） 3vne（エボラウイルスのVP24タンパク質） 4ibb（エボラウイルスのVP35タンパク質） 同PDBsumデータ 4ibb_1DK$ 4ldd（エボラウイルスのVP40タンパク質；6量体，Chain A-C×2） ∥ 4ldm（同8量体リング，Chain A×8） ※他に2量体4ldb参照 4qaz*（エボラウイルスのヌクレオプロテイン；1976年ザイール種Mayinga株） ｜ 4qb0*（同） → PDBj情報 4u2x*（エボラウイルスのVP24タンパク質；ヒトのカリオフェリンα1が結合〈カリオフェリンαは核移行受容体インポーチンのサブユニット〉） 同 Chain A-C（エボラウイルスのVP24のみ） 4ypi（エボラウイルスのヌクレオプロテインとVP35タンパク質） A-D鎖（ヌクレオプロテイン）選択 4z9p（エボラウイルスのヌクレオプロテインのコアドメイン） → Jmolトピック 4ztg（エボラウイルスのヌクレオプロテイン-VP35複合体） VP35 21-46 peptide（一部欠落）選択 → Cell Reports論文（他に4zta・4zti公開） 5bpv（エボラウイルスのVP35タンパク質；I278A変異体） 278番アミノ酸選択（他のVP35と比較用） 5f1b（ヒトNPC1に結合したエボラウイルスの糖タンパク質〈GP1・GP2〉） A鎖（エボラウイルスの糖タンパク質GP1）選択 C鎖（ヒトのNPC1）選択 ［NPC1 - Wikipedia］ 5jq7#（エボラウイルス糖タンパク質6量体；Chain A・B×3，トレミフェンが結合） T0R（トレミフェン）選択 同PDBsumデータ 5jq7_T0R$ ［トレミフェン - Wikipedia］ ｜ PDBsumデータ 5jqb_IBP$（イブプロフェンが結合） ［イブプロフェン - Wikipedia］ 5kelのChain A・B・H・L・C・D（エボラウイルスの糖タンパク質〈GP1・GP2〉に結合した抗体のc2G4・c13C6） ｜ 5kenのChain E・F・G・H・I・J（エボラウイルスの糖タンパク質〈GP1・GP2〉に結合した抗体のc4G7・c13C6） ※抗エボラウイルス薬候補のZMappはc2G4・c4G7・c13C6の抗体カクテル ［ZMapp - Wikipedia］ 6f5u（エボラウイルス糖タンパク質6量体；Chain A・B×3，ベプリジルが結合） CQN（ベプリジル）選択 同PDBsumデータ 6f5u_CQN$ ［ベプリジル - Wikipedia］ ｜ PDBsumデータ 6f6i_8PR$ ［パロキセチン - Wikipedia］ ｜ PDBsumデータ 6f6n_SRE$ ［セルトラリン - Wikipedia］ ｜ PDBsumデータ 6f6s_CXQ[507A]$ ［KEGG DRUG: ベンザトロピン／ベンズトロピン］ 9dz2（スーダンエボラウイルス糖タンパク質とヒトNPC1-Cの複合体） [NEW!] Ile79・Ala141・Pro148選択 → 本ページ内記事 ※治療薬候補レムデシビル関連 レムデシビル（remdesivir） → 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2｜COVID-19）情報 ［Remdesivir - Wikipedia］ ※2014/08/08ニュースのファビピラビル関連 ファビピラビル（favipiravir，T-705；インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼ阻害剤） ［Favipiravir - Wikipedia］ ｜ 6-fluoro-3-oxo-4-(5-O-phosphono-β-D-ribofuranosyl)-3,4-dihydropyrazine-2-carboxamide；ファビピラビルの1リン酸体（活性体は3リン酸体） → PDBリガンド1RP ｜ ファビピラビルの3リン酸体T-705RTP（活性体） ｜ ファビピラビル，同3リン酸体T-705RTP，ブリンシドフォビルの同時表示 4kn6（ヒポキサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ；T-705-リボース-5'-1リン酸が結合） ※T-705は活性体の3リン酸体に変換されて阻害作用 同PDBsumデータ 4kn6_1RP$ ［トレミフェン - Wikipedia］ ※2014/11/14ニュースのブリンシドフォビル関連 ブリンシドフォビル（brincidofovir） ［Brincidofovir - Wikipedia］ ※2019/08の多数のニュースのエボラ治療薬候補mAb114関連 5fha（モノクローナル抗体 mAb114） → Jmolトピック |
下掲Cover Story掲載のNature表紙と当該データ3csy（ヒト由来抗体が結合したエボラウイルス糖タンパク質3量体；画像クリックで拡大）
［左］エボラ熱治療薬候補ファビピラビル（favipiravir） ［中］ファビピラビル3リン酸体T-705RTP（活性体）
［右］参考として：ファビピラビルが活性体の3リン酸体に変換されて阻害作用を示す様子のPDBsumデータ4kn6_1RP（データでは1リン酸体）
（ヒトのヒポキサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ）
ファビピラビル（T-705），同3リン酸体T-705RTP（活性体），ブリンシドフォビル（brincidofovir）の同時表示
※参考：Mechanism of Action of T-705 Ribosyl Triphosphate against Influenza Virus RNA Polymerase（Antimicrob Agents Chemother，2013/11）
GoogleドライブとChem3D for iPadで分子を見るによるファビピラビル（favipiravir）
| 年 | 病原微生物 | 種類 | 疾病 |
|---|---|---|---|
| 1973 | ロタウイルス | ウイルス | 小児の下痢 |
| 1977 | エボラウイルス | ウイルス | エボラ出血熱 |
| 1977 | Legionella pneumophila | 細菌 | レジオネラ症（在郷軍人病） |
| 1977 | ハンタウイルス | ウイルス | 腎症候性出血熱 |
| 1980 | HTLV-I | ウイルス | 成人T細胞白血病 |
| 1982 | 病原性大腸菌O157：H7 | 細菌 | 出血性大腸炎，溶血性尿毒症症侯群 |
| 1983 | HIV | ウイルス | エイズ |
| 1983 | Helicobacter pylori | 細菌 | 胃潰瘍 |
| 1988 | E型肝炎ウイルス | ウイルス | E型肝炎 |
| 1989 | C型肝炎ウイルス | ウイルス | C型肝炎 |
| 1992 | Vibrio cholerae O139 | 細菌 | コレラ |
| 1996 | 牛海綿状脳症プリオン | プリオン（タンパク質）→ 参考ページ | 変異型クロイツフェルト・ヤコブ病 |
| 1997 | トリ型インフルエンザウイルス | ウイルス | インフルエンザ |
| 1998 | ニパウイルス | ウイルス | 脳炎 |
| 2002 | SARSコロナウイルス | ウイルス | 肺炎 |
| 2019 | 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2） | ウイルス | COVID-19 |