日本コンピュータ化学会2014春季年会（2014/05/29-30，東京工業大学 大岡山キャンパス）において本コンテンツについてポスター発表しました。　※要旨PDF，発表スライド（一部改変）

アンモニアの生成
※関連キーワード例：ハーバー・ボッシュ法　［Haber process - Wikipedia］

N2 ＋ 3 H2 空間充填　球棒　スティック 全選択　窒素選択 ドット表面表示　元素記号・番号表示　　回転 背景・黒　灰　白　紺

→ 　（反応熱＝92 kJ/mol）

2 NH3 空間充填　球棒　スティック 全選択 ドット表面表示　元素記号・番号表示　　回転 背景・黒　灰　白　紺

「元素手帳2018」（化学同人）のブックカバー裏面より一部分子を上掲

d-ツボクラリンおよび同分子が結合したニコチン性アセチルコリン受容体3pmzのChain Eと同PDBsumデータ

1n2c_HCA-CFM（モリブデン鉄クラスター） I'/O'＝1.003 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択 Fe-Mo-Sクラスター選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　消去 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順 ドット表面表示 ｜ 背景・黒　灰　白　紺	1n2c_CLF（Fe(8)-S(7)クラスター） I'/O'＝0.858 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択   空間充填　球棒　球60％　スティック　消去 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順 ドット表面表示 ｜ 背景・黒　灰　白　紺
4tkv_ICE [502(A)]（Fe-Mo-Sクラスター；C〈格子間炭素〉含む） ※一酸化炭素と3-ヒドロキシ-3-カルボキシ-アジピン酸が結合 （I'/O'＝0.889） 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択 C-Fe-Mo-Sクラスター（CFe7MoS8）選択　一酸化炭素選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　消去 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順 ドット表面表示 ｜ 背景・黒　灰　白　紺	4tkv_CLF（Fe(8)-S(7)クラスター）   I'/O'＝0.801 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択   空間充填　球棒　球60％　スティック　消去 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順 ドット表面表示 ｜ 背景・黒　灰　白　紺
4tku_ICS [502(A)]（Fe-Mo-Sクラスター；C〈格子間炭素〉含む） ※3-ヒドロキシ-3-カルボキシ-アジピン酸が結合 （I'/O'＝0.973） 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択 C-Fe-Mo-Sクラスター（CFe7MoS9）選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　消去 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順 ドット表面表示 ｜ 背景・黒　灰　白　紺	4tku_CLF（Fe(8)-S(7)クラスター）   I'/O'＝0.899 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択   空間充填　球棒　球60％　スティック　消去 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順 ドット表面表示 ｜ 背景・黒　灰　白　紺

※参考：鉄硫黄クラスター／Fe4S4，Fe2S2，Fe3S4等を含む生体分子のSITE例 ｜ Jmolトピックス（4tkv/4tkuについて）

ニトロゲナーゼの構造例1n2c（Azotobacter vinelandii由来）

銅含有亜硝酸還元酵素5d4iのChain AとそのPDBsumデータ

1e79_ATP（ATP合成酵素；F1部分） I'/O'＝1.8500，I/O＝－ 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択 リガンド中N選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　消去 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順 ドット表面表示 ｜ 背景・黒　灰　白　紺

1e79_ADP（ATP合成酵素；F1部分） I'/O'＝1.9907，I/O＝－ 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択 リガンド中N選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　消去 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順 ドット表面表示 ｜ 背景・黒　灰　白　紺

ミトコンドリア関連生体分子のSITE例

発がん性が認められている複素芳香族アミンの例　→ 発がん性化合物と生体分子

Trp-P-1 空間充填　球棒　スティック 全選択　窒素選択 ドット表面表示　元素記号・番号表示　　回転 背景・黒　灰　白　紺	Trp-P-2 空間充填　球棒　スティック 全選択　窒素選択 ドット表面表示　元素記号・番号表示　　回転 背景・黒　灰　白　紺	Glu-P-1 空間充填　球棒　スティック 全選択　窒素選択 ドット表面表示　元素記号・番号表示　　回転 背景・黒　灰　白　紺	Glu-P-2 空間充填　球棒　スティック 全選択　窒素選択 ドット表面表示　元素記号・番号表示　　回転 背景・黒　灰　白　紺
A-α-C 空間充填　球棒　スティック 全選択　窒素選択 ドット表面表示　元素記号・番号表示　　回転 背景・黒　灰　白　紺	MeA-α-C 空間充填　球棒　スティック 全選択　窒素選択 ドット表面表示　元素記号・番号表示　　回転 背景・黒　灰　白　紺	IQ 空間充填　球棒　スティック 全選択　窒素選択 ドット表面表示　元素記号・番号表示　　回転 背景・黒　灰　白　紺	PhIP 空間充填　球棒　スティック 全選択　窒素選択 ドット表面表示　元素記号・番号表示　　回転 背景・黒　灰　白　紺

PDBデータ1HZ0のModel 1

生物界で見られる4種類のテトラピロール 空間充填　球棒　スティック 全選択　窒素選択 ドット表面表示　元素記号・番号表示　　回転 背景・黒　灰　白　紺

  
4分子同時表示と関連川上モデル
※参考：生化学： メタン触媒の分子構成（Nature ハイライト，2017/03/02）
※参考：ビタミンB₁₂等の分子の結晶写真集（Facebookページ）

4分子模型と関連書籍（左から 「現代化学」2024年1月号と化学同人「星屑から生まれた世界　進化と元素をめぐる生命38億年史」）

1n2z_CNC

 
3Dプリンタによる新生体分子模型Kawakami Model（JAISTプレスリリース）
［左］光合成関連3ARCのChain A（以下にYouTube動画）　［右］ヘモグロビン2HHB

BCL・BPH・HEMのみ表示