PDBデータ 5ireの360量体（Chain A-F×60〈α炭素とHETATMのみ〉；ジカウイルスの構造）
［Zika virus - Wikipedia］

バックボーン　二次構造 ｜ DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択　タンパク質選択　DNA/RNA選択　同backbone選択　リガンド選択　HB選択（$印のみ）　水分子表示（*印のみ） 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　∥　Jmol色　Rasmol色 リガンドの元素記号表示 糖鎖別着色（#印のみ）：Gal，α-Glc，β-Glc，Man，Fuc，Xyl，Sia，GalNAc，GlcNAc，GlcA 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 S-S結合表示（太）　S原子（Protein中）空間充填 ドット表面表示　α炭素ラベル表示　回転 背景・黒　灰　白　紺

5ire（ジカウイルスの構造） 5ireの360量体（Chain A-F×60〈α炭素とHETATMのみ〉；ジカウイルスの構造）　※オリジナルデータ（gz形式） 5iz7の360量体（Chain A-F×60〈α炭素とHETATMのみ〉；ジカウイルスの構造）　※オリジナルデータ（gz形式） 5gzrの600量体（Chain ABCDEFHLMN×60〈α炭素のみ〉；中和抗体Z23-Fabが結合したジカウイルスの構造）　Z23 Fab重鎖（Chain H・M）選択　Z23 Fab軽鎖（Chain L・N）選択　※オリジナルデータ（gz形式） 5u4wの360量体（Chain A-F×60〈α炭素とHETATMのみ〉；未成熟なジカウイルスの構造）　※オリジナルデータ（gz形式） 5h37の720量体（Chain ABCDEFGHIKLM×60〈α炭素とHETATMのみ〉；Fab C10と構造タンパク質Mが結合したジカウイルスの構造）　構造タンパク質M（Chain D・E・F）選択　C10 IgG重鎖（Chain G・I・K）選択　C10 IgG軽鎖（Chain H・L・M）選択　※同時公開の5h30・5h32は略，オリジナルデータ（gz形式） 5ireの60量体（Chain A-F×10〈α炭素とHETATMのみ〉；ジカウイルスの構造）　※オリジナルデータ（gz形式） ※以下ジカウイルス関連別データ 5iy3（ジカウイルスの非構造タンパク質NS1） ｜ 5k6k（同）　［Viral nonstructural protein - Wikipedia］ 5gs6（ジカウイルスの完全長NS1） 5x8y（ジカウイルスのNS1） 5lc0（ジカウイルスのNS2B-NS3プロテアーゼ；ボロン酸阻害剤が結合）　B（ホウ素）選択　同PDBsumデータ5lc0_6T8$ 5t1v（ジカウイルスのNS2B-NS3プロテアーゼ；アポ体） 5gj4のChain A・B・E・F（ジカウイルスの自己切断後のNS2B-NS3プロテアーゼ） 5gxj（ジカウイルスのNS2B-NS3プロテアーゼ） 5h6v（ジカウイルスのプロテアーゼ） 5jmt（ジカウイルスの非構造タンパク質NS3；ヘリカーゼ） ｜ 5jrz（同） 5gjc（ジカウイルスのNS3ヘリカーゼ；ATPが結合）　ATP選択 5jmt（ジカウイルスのNS3ヘリカーゼ） 5mfx（ジカウイルスのNS3ヘリカーゼ；RNAが結合） 5txg（ジカウイルスのNS3ヘリカーゼ） 5kqs（ジカウイルスのNS5メチルトランスフェラーゼ）　SAM選択　M7G選択　同PDBsumデータ5kqs_SAM$　5kqs_M7G$　※他に5kqr 5tfrのChain A（ジカウイルスのNS5タンパク質）　SAH選択　同PDBsumデータ5tfr_SAH$ 5tmhのChain A（ジカウイルスのNS5タンパク質）　SAH選択　同PDBsumデータ5tmh_SAH$ 5u04（ジカウイルスのNS5 RNA依存性RNAポリメラーゼ）　［RNA-dependent RNA polymerase - Wikipedia］ 5wz1のChain A（ジカウイルスのNS5 メチルトランスフェラーゼ）　SAM（S-アデノシル-L-メチオニン）選択　同PDBsumデータ5wz1_SAM$ ｜ 5wz2のChain A（ジカウイルスのNS5 メチルトランスフェラーゼ）　同PDBsumデータ5wz2_SAM$　同5wz2_GTA$ ｜ 5wz3（ジカウイルスのNS5 RNA依存性RNAポリメラーゼ） 5u0bのChain A（ジカウイルスの完全長NS5タンパク質）　SAH（S-アデノシル-L-ホモシステイン）選択　同PDBsumデータ 5u0b_SAH$ ｜ 5u0cのChain A（ジカウイルスのNS5 RNA依存性RNAポリメラーゼ） 5jhm（ジカウイルスのエンベロープタンパク質） ｜ 5jhl（同；フラビウイルス広域中和抗体が結合）　A鎖（エンベロープ）選択 ｜ 5lbsのChain A・H・L（同；交差性中和抗体が結合） ｜ 5lbv（同） ｜ 5lcv（同；交差性中和抗体が結合）　A・B鎖（エンベロープ）選択 5kvd（ジカウイルスのエンベロープタンパク質DIII；ジカ特異抗体ZV-2が結合）　E鎖（エンベロープ）選択 5vigのChain A・B・G　（ジカウイルスのエンベロープタンパク質DIII；ジカ抗体Z006が結合）　G鎖（エンベロープ）選択 5tpy*（ジカウイルスのエキソヌクレアーゼ耐性RNA）

ジカウイルスの構造例5ire（左）と60量体（Chain A-F×10；右）

    
［左］5ire　［中］5iz7　［右］5u4w（未成熟なジカウイルス）　※いずれも360量体（Chain A-F×60；α炭素とリガンドのみ）

  
［左］5gzrの600量体（Chain ABCDEFHLMN×60）　［右］5h37の720量体（Chain ABCDEFGHIKLM×60）　※いずれもα炭素とリガンドのみ

    
［左］ジカウイルスの非構造タンパク質NS15iy3　［中］同5k6k　［右］同5gs6（full-length）

  
［左］非構造タンパク質NS3（ヘリカーゼ）5jrz　［右］RNAが結合したNS3ヘリカーゼ5mfx

  
NS2B-NS3プロテアーゼ5lc0（ボロン酸阻害剤が結合）とそのPDBsumデータ（Science論文でAsp⁸³に言及）

ジペプチドインヒビターが結合したプロテアーゼ5h6v

  
［左］NS5メチルトランスフェラーゼ5kqs（アミノ酸残基番号5-308）　［右］NS5 RNA依存性RNAポリメラーゼ5u04

［左］NS5メチルトランスフェラーゼ5wz2のChain A　［右］NS5 RNA依存性RNAポリメラーゼ5wz3

［左］完全長NS5タンパク質5u0bのChain A（PBBsumデータの図は以下に）　［右］NS5 RNA依存性RNAポリメラーゼ5u0cのChain A

    
［左から］NS5タンパク質5tfrのChain A（アミノ酸残基番号6-887）とPDBsumデータ，5tmhのChain AとPDBsumデータ，5u0b（完全長NS5）のPDBsumデータ

  
広域中和抗体が結合したジカウイルスのエンベロープタンパク質5jhl（左）と5lcv（右）

  
［左］ジカ特異抗体ZV-2が結合したジカウイルスのエンベロープタンパク質DIII 5kvd
［右］ジカ抗体Z006が結合したエンベロープタンパク質DIII 5vig（Chain A・B・G）

ジカウイルスのエキソヌクレアーゼ耐性RNA 5tpy

表　いろいろなウイルス（DNAウイルスとRNAウイルス）
◎以下を編集：吉開泰信 編，「ウイルス・細菌と感染症がわかる」，p.37，羊土社(2004)
（ ）は新興感染症の出現年：竹田美文・岡部信彦，「SARSは何を警告しているのか」，岩波ブックレット(2003)
SARS-CoV-2ほかを加筆；なお以下の分類等は変更になっている場合もある

	分類	例
主なDNAウイルス	ポックスウイルス科	エムポックス〈mpox，サル痘〉（1970）　→ 別トピック
	ヘルペスウイルス科	※鯉ヘルペス
	アデノウイルス科
	パピローマウイルス科 （ポリオーマウイルス科も酷似）	子宮頸がん；ヒトパピローマウイルス〈HPV〉による　→ 別トピック
	ヘパドナウイルス科 #	B型肝炎
	パポバウイルス科
主なRNAウイルス	パラミクソウイルス科	麻疹，ニパウイルスによる脳炎（1998）
	オルトミクソウイルス科 （オルソミクソウイルス科）	インフルエンザ　→ 鳥インフルエンザ（高病原性H5N1型は1959年）＆新型インフルエンザ情報
	コロナウイルス科	SARS（2002） → SARSと抗ウイルス薬 SARS-CoV-2（2019） → 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2｜COVID-19）情報
	アレナウイルス科	ラッサ熱
	レトロウイルス科 #	〈逆転写，レンチウイルス属〉AIDS（1983） → HIVとエイズ 〈一本鎖，デルタレトロウイルス属〉HTLV-1関連症候群（1980） → HTLV-1情報
	フィロウイルス科	エボラ出血熱（1977） → 2014年にエボラ出血熱感染拡大
	レオウイルス科	ロタ
	ピコルナウイルス科	ポリオ，A型肝炎
	カリシウイルス科	ノロ
	ラブドウイルス科	狂犬病
	フラビウイルス科 （トガウイルス科も酷似）	日本脳炎，ウエストナイル熱，デング熱，ジカウイルス感染症， C型肝炎（1989）　→ 別トピック〈B型肝炎記事含む〉 ※豚コレラ
	ブニヤウイルス科

# 最近のICTVレポートでは，ヘパドナウイルス科とレトロウイルス科は，『逆転写を行うDNAおよびRNAウイルス』として同じカテゴリに分類されている。
※参考：デビッド・クアメン 著・甘糟智子 訳，「スピルオーバー ウイルスはなぜ動物からヒトへ飛び移るのか」，明石書店(2021)
※参考：ウイルス図鑑，ウイルスの分類 - Wikipedia