分子で見る国際問題と海外ニュース

◆ 分子で見る国際問題と海外ニュース ◆
※初期表示は白リン（P₄）

データ番号と資料番号が対応しているほか，［］の事項クリックで関連情報やブログエントリーにジャンプします。

H274Yタミフル耐性変異を知るために：タミフル由来GS4071を含むPDBsumデータ例 2qwk_G39＋His274 ｜ GS4071含むPDBsumデータ例 3cl0_G39＋Tyr274 ∥ アミノ酸274選択
トリクロサン（triclosan）［Triclosan - Wikipedia］
ペラミビル（peramivir）｜参考：ペラミビルを含むPDBデータ例2f10*（ノイラミニダーゼ）　同PDBsumデータ$　［Peramivir - Wikipedia］
テラバンシン（telavancin）　［Telavancin - Wikipedia］
参考：易熱性エンテロトキシンのPDBデータ例 1lt4#（粘膜アジュバントの例）　［Immunologic adjuvant - Wikipedia］
亜酸化窒素（nitrous oxide，；一酸化二窒素，dinitrogen monoxide）の構造例｜参考：亜酸化窒素を含むPDBsumデータ例 2icq_N2O（元データ）　［Nitrous oxide - Wikipedia］
抗HIVタンパク質アクチノヒビン（actinohivin）のPDBデータ3a07　同Chain A　［ブログ記事］
プロポフォール（propofol；ディプリバン，Diprivan）　［Propofol - Wikipedia］
オセルタミビル（oseltamivir；タミフル，Tamiflu）｜ GS4071（オセルタミビルが変化して機能）｜参考：GS4071結合ノイラミニダーゼ（N1）のPDBデータ例3cl0　［Oseltamivir - Wikipedia］
エリブリン（eribulin，E7389）　［Eribulin - Wikipedia］
参考：BDNF（Brain-derived neurotrophic factor；脳由来神経栄養因子）のPDBデータ例 1bnd*　［Brain-derived neurotrophic factor - Wikipedia，Alzheimer's disease - Wikipedia］
セロトニン（serotonin）　［Serotonin - Wikipedia］
バレニクリン（varenicline）　［Varenicline - Wikipedia］｜ブプロピオン（bupropion；異性体あり）　［Bupropion - Wikipedia］
HCFC-141b（代替フロンHCFC類の例）　※その他は温室効果ガス参照　［Freon - Wikipedia］
ニコチン（nicotine）　［ICSC情報，Nicotine poisoning - Wikipedia］｜参考：ニコチンが結合したアセチルコリン結合タンパク質のPDBデータ例 1uw6のChain A-E（PDBsumデータ集1uw6_NCT 参照）
2,3-ジメトキシ-1,4-ナフトキノン（2,3-dimethoxy-1,4-naphthoquinone，DMNQ）｜ N-ニトロソジメチルアミン（N-nitrosodimethylamine，DMN）［ICSC情報］｜フェノール（phenol）［ICSC情報］
CPS49 ∥ (S )-サリドマイド｜ (R )-サリドマイド　［Thalidomide - Wikipedia］
β-ヘキサクロロシクロヘキサン（β-hexachlorocyclohexane，β-BHC） → 他の新規POPs有害物質　［Lindane - Wikipedia，Persistent organic pollutant - Wikipedia］
アナボリックステロイドホルモン例：メタンジエノン（metandienone，メタンドロステノロン）　［Anabolic steroid - Wikipedia］
PDBデータ 1ruy#（ヘマグルチニン，豚インフルエンザ，H1N1，H～M鎖，1930年）｜ PDBデータ 1jsd#（同，H9N2，A・B鎖，1998年）　［Swine influenza - Wikipedia，ブログ記事］
抗HIV-1薬例：ジドブジン（zidovudine，AZT）　［Zidovudine - Wikipedia］
ビスフェノールZ（bisphenol Z）｜参考：ビスフェノールZを含むPDBデータ例 2zkc　［ブログ記事］
メチシリン（methicillin）　［Methicillin-resistant Staphylococcus aureus - Wikipedia］
塩化メチル水銀（methyl mercuric chloride）｜メチル水銀を含むPDBデータ例 1cwt　同PDBsumデータ（Hg追加）　［水俣病（本サイト），Methylmercury - Wikipedia，Minamata disease - Wikipedia］
クロルデコン（chlordecone，ケポン，キーポン）　［クロルデコン（ICSC情報），WWFの新規POPs候補物質リスト（本サイト），Persistent organic pollutants (POPs) - Wikipedia］
SARSコロナウイルスのプロテアーゼ例PDBデータ 2zu4（阻害剤モデル分子TG-0204998結合）　同PDBsumデータ（TG-0204998）$　［SARS coronavirus - Wikipedia］
リレンザ（一般名ザナミビル，zanamivir）｜ザナミビルを含むPDBデータ例 3ckz　［Zanamivir - Wikipedia］
PDBデータ 1azxのChain I #（アンチトロンビンIII，antithrombin III）　Asn96・Asn135・Asn155・Asn192選択　Arg393・Ser394選択　［Antithrombin - Wikipedia，ブログ記事］
二酸化炭素（carbon dioxide，CO₂）　［その他の温室効果ガス］
白リン（white phosphorus，P₄）　［White phosphorus (weapon) - Wikipedia］
ビスフェノールA（bisphenol A）｜参考：ビスフェノールAを含むPDBデータ例 2e2r*　［Bisphenol A - Wikipedia］

　（適宜追加します）

バックボーン　二次構造｜ DNA/RNA（ATGCU，backbone）
全選択　タンパク質選択　DNA/RNA選択　同backbone選択　リガンド選択　HB選択（$印のみ）　水分子表示（*印のみ）
空間充填　球棒　球10％　球25％　球30％　球60％　スティック　スティック（太）　針金
アミノ色　Chain色　CPK色　∥　Jmol色　Rasmol色 ∥ 濃赤　濃青　緑　ピンク　濃ピンク　橙　紫　青　水色
糖鎖別着色（#印のみ）：Gal，α-Glc，β-Glc，Man，Fuc，Xyl，Sia，GalNAc，GlcNAc，GlcA ∥ Asn,Ser,Thr選択｜ Asn　Ser　Thr
酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別　疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順　コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド）
水素結合表示｜ S-S結合表示　S原子（Protein中）空間充填｜ドット表面表示　α炭素ラベル表示　回転｜背景・黒　灰　白　紺
　Chain選択： A B C D E F G H I J K L M N O P

ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR　ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO

酸性

中性

芳香族

塩基性

ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR　ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS

極性

酸性

塩基性

非極性（疎水性）

SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG　HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP

ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP　SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE

ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS　TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE

ASP　GLU　CYS　ASN　PHE　GLN　TYR　SER　MET　TRP　VAL　GLY　LEU　ALA　ILE　THR　PRO　HIS　LYS　ARG

■参考資料　※上掲分子について詳しく知るために

タミフル耐性の仕組み解明インフルエンザで米チーム（47NEWS，2010/06/04）
- Permissive Secondary Mutations Enable the Evolution on Influenza Oseltamivir Resistance（Science 4 June 2010: Vol. 328. no. 5983, pp. 1272 - 1275）
- Odd mutation pattern in flu（The Scientist，2010/06/03）
- Proteopedia - Avian Influenza Neuraminidase, Tamiflu and Relenza
- 新型インフルエンザ情報（本サイト）　※ノイラミニダーゼ例の2qwk・3cl0・3ckzなど参照
H274Yタミフル耐性変異：〔左〕GS4071を含む2qwk（N9）PDBsumデータにHis274追加，〔右〕3cl0（N1）PDBsumデータにTyr274追加
※左側をN1の2hu0にした図は別ページに
家庭用製品に使われる抗菌物質トリクロサンの安全性をFDAが調査中（日経，2010/04/10）
- FDA Provides Information to Consumers about the Ingredient Triclosan（FDA，2010/04/08）　※参考：FDAツイートは @FDA_Drug_Info ほか
- FAQ: Triclosan and Your Health（WebMD，2010/04/09）
- 参考：ダイオキシン類の毒性等価係数（本サイト）
新型インフル、米が新薬の緊急投与を許可（日経，2009/10/26）
- 治療薬はタミフル5日分の効果インフル薬ペラミビル（47NEWS，2009/09/14）
- インタビュー：抗インフルエンザ薬は10年秋発売を計画、今冬承認にも準備＝塩野義<4507.T>社長（ロイター，2009/09/17）
- 米大統領諮問委、静脈注射用抗ウイルス剤認可手続き迅速化を勧告（ロイター，2009/08/25）　※ペラミビル等について
- Googleによる“peramivir”ニュース検索結果
- 新型インフルエンザ情報（本サイト）
〔左〕ペラミビル（peramivir），〔右〕ペラミビルを含むPDBsumデータ2f10_BCZより
※ペラミビルを含むPDBデータ例：2f10（上掲），2htu
アステラス製薬、米国で抗生物質「VIBATIV」が複雑性皮膚・軟部組織感染症の適応症で承認を取得　抗生物質「VIBATIV(TM)（一般名：テラバンシン）」（日経，2009/09/14）
- VIBATIV (telavancin) Injection, Theravance, Inc., Approval（FDA，2009/09/17）
- Googleによる“telavancin”ニュース検索結果
- 抗生物質分子データ集（本サイト）抗生物質／耐性菌／院内感染
テラバンシン（telavancin）
英国で新型ワクチンの効果確認ノバルティス社（47NEWS，2009/09/03）　※免疫増強剤アジュバント（adjuvant）添加
- クローズアップ2009：新型インフル・ワクチン　接種拡大、輸入頼み（毎日，2009/08/26）
- Googleによる“adjuvant influenza vaccine”ニュース検索結果
参考：易熱性エンテロトキシンの例1lt4（粘膜アジュバント関連データ例）
亜酸化窒素：オゾン層破壊、N2Oも脅威　規制強化を－－米チーム解明（毎日，2009/08/28）
- Nitrous Oxide (N2O): The Dominant Ozone-Depleting Substance Emitted in the 21st Century（Science，2009/08/27）
- きわめて有害な酸化物（Science｜ハイライト，2009/08/28）
- Nitrous oxide fingered as monster ozone slayer（Science News，2009/08/27）
- Nitrous Oxide Fingered as Monster Ozone Slayer（U.S. News & World Report，2009/08/28）
- 温室効果ガス（本サイト）
HIV感染　阻害物質の作用解明　いわき明星大田中教授（河北新報，2009/08/26）　※田中晴雄教授らによる抗HIVタンパク質アクチノヒビンの研究（WHOと共同でエイズ予防薬開発が進められる予定）

アクチノヒビン（actinohivin）の構造例3a07
※HIVとエイズに掲載
マイケルさん死因は麻酔過剰投与警察、事件として捜査（朝日，2009/08/25）　※麻酔剤ディプリバン（プロポフォール）過剰投与の可能性
「新生児・乳児にもタミフル投与」　WHOが指針（朝日，2009/08/22） → Recommended use of antivirals - Pandemic (H1N1) 2009 briefing note 8（WHO，2009/08/21）
- 鳥インフルエンザ＆新型インフルエンザ情報（本サイト）
〔左〕GS4071（オセルタミビル〔タミフル〕が血液・肝臓中で変化）を含むノイラミニダーゼ3cl0
〔右〕ザナミビル（リレンザ）を含むノイラミニダーゼ3ckz
※何れも下段はPDBsumのLigand-SITE情報と有機性・無機性による
【エーザイ】新規抗癌剤「エリブリン」をスイスで先行承認申請（ケムステニュース，2009/07/30）
- 【エーザイ】新規抗癌剤「エリブリン」をスイスで先行承認申請（薬事日報，2009/07/28）
- Eisai Seeks Approval For Breast Cancer Drug In Switzerland（Wall Street Journal，2009/07/27）
- 話題の制がん剤・抗がん剤（本サイト）
エリブリン（eribulin）
神経幹細胞の注射でアルツハイマー病が改善（Wired Vision，2009/07/23）　※ BDNF（Brain-derived neurotrophic factor；脳由来神経栄養因子〔ニューロトロフィン neurotrophin の一種〕）の研究
- Neural Stem Cells May Rescue Memory In Advanced Alzheimer's, Mouse Study Suggests（ScienceDaily，2009/07/22）
- アルツハイマー病治療薬（本サイト）
参考：BDNFの構造例1bnd
「薬物乱用等に陥りやすい遺伝子型」が発現する条件（Wired Vision，2009/07/09）　※キーワード：セロトニン，NIH
- 情報の信頼性を高めるウィキペディアの取り組み～米国立衛生研究所との連携（日経，2009/07/16）
- 掛札堅，「アメリカNIHの生命科学戦略　全世界の研究の方向を左右する頭脳集団の素顔」，講談社ブルーバックス(2004)
- 抗うつ剤の分類（本サイト）
FDAが禁煙補助薬2剤に警告表示を要請（日経，2009/07/01）
代替フロン排出、予測の4倍国連、対策呼び掛け（47NEWS，2009/06/27）
- フロンガス：エアコンに量表示　回収促進狙い、ラベル添付（毎日，2009/07/30）
- 代替フロン問題についてオゾン層と地球温暖化の専門家が協働へ（EICネット，2009/07/16）
- 代替フロン使用に警鐘、温室効果CO2の数千倍（エクール，2009/06/29）
- フロン回収・破壊法に基づく平成20年度のフロン類の破壊量の集計結果について（お知らせ）（環境省，2009/07/10）
- 代替フロン - Wikipedia
- 温室効果ガス（本サイト）
米国：たばこ規制法成立　禁煙中のオバマ大統領、苦闘しながら署名（毎日，2009/06/23）
- 米上院、FDAに「たばこ規制」の権限を強化する法案を可決（CNN Japan，2009/06/12）
- 参考ニュース：タバコのニコチンを貯めるトランスポータ遺伝子を世界で初めて発見（京都大学，2009/01/20）
新刊：鈴木聰編著，「分子でよむ環境汚染」，東海大学出版会(2009)　※上掲分子はp.123の『酸化ストレス，発がん性，タンパク質変成作用を有する3つのモデル化学物質』
- 紹介サイト例（p.48）：International Pellet Watch（IPW） [URL変更] ｜日本語版（海岸漂着プラスチックレジンペレットを分析した地球規模のPOPsモニタリング）
- 同書を読む上で役立つ本サイト内コンテンツ例
サリドマイドで手足の奇形が生じるメカニズム（５号館のつぶやき，2009/05/12） → Thalidomide induces limb defects by preventing angiogenic outgrowth during early limb formation（PNAS，2009/05/12）
- 参考（同じ共著者を含む関連論文例）：Selective leukemic-cell killing by a novel functional class of thalidomide analogs（Blood，2006/12/15）｜Figure 1
- How thalidomide makes its mark（Nature，2009/05/11）
- Natureニュースから - サリドマイドはどのように影響を与えるのか（食品安全情報blog，2009/05/12）
- 本間善夫・川端潤，「パソコンで見る動く分子事典」，p.220，講談社ブルーバックス(2007)　※サリドマイド
CPS49（上掲Figure 1より
※サリドマイドの鏡像体については，2001年度ノーベル化学賞 - 不斉触媒合成参照
第4回POPs条約締約国会議　有害物質リストへの追加を決定（EICネット，2009/05/09）
- Governments unite to step-up reduction on global DDT reliance and add nine new chemicals under international treaty（UNEP，2009/05/09）
- 残留性有機汚染物質 - Wikipedia
- 新規POPs有害物質リスト（本サイト）
「A･ロッドのステロイド使用は高校時代から」、米報道（AFPBB News，2009/05/01）
- Ａ・ロッドに新たな疑惑　ヤ軍移籍後も薬物使用か（日経，2009/05/01）
- ステロイドホルモンの生合成と代謝（本サイト）
- Molecule of the Month（PDB，2007/08），Anabolic Steroids｜蛋白質同化性ステロイド（Anabolic Steroids、筋肉増強剤）（PDBj）
- 参考：ステロイドホルモン - Wikipedia ｜アナボリックステロイドホルモン
「人から人に感染」確認　新型豚インフル、米CDC発表（日経，2009/04/25） → 鳥インフルエンザ＆新型インフルエンザ情報（本サイト）
- WHO、警戒水準をフェーズ５へ引き上げ　豚インフル（朝日，2009/04/30） → WHO | Swine influenza（2009/04/29）
- 豚インフル、警戒レベルをフェーズ４に引き上げ　WHO（朝日，2009/04/28） → WHO | Swine influenza（2009/04/27）
- 豚インフル、スペインでも１人感染確認　WHO、緊急委を前倒し（日経，2009/04/27）
- 豚インフル拡大で関連通貨売られる、株式では材料株物色（ロイター，2009/04/27）
- CDC - Swine Influenza (Flu)
- Googleによる“"swine influenza" OR "swine flu"”ニュース検索結果
- 豚インフルエンザ：厚労省が情報収集　専門家ら、大流行警戒（毎日，2009/04/25）
- メキシコで60人死亡 WHO、豚インフルか（47NEWS，2009/04/25）
1930年のインフルエンザにおけるヘマグルチニン1ruy（豚インフルエンザ，H1N1）
ワシントンDCでHIV感染が拡大（AFPBB News，2009/03/17）
- HIVとエイズ（本サイト）｜エイズ薬の例
- 参考：HAART療法 - Wikipedia
EPA　50万種以上の化学物質情報をオンラインで提供（EICネット，2009/03/12） → ACToR: Aggregated Computational Toxicology Resource｜National Center for Computational Toxicology (NCCT)

参考：ACToRにおける“bisphenol”検索結果表示画面
（他の推奨検索語例；methylmercury，TCDD，PFOS，MDMA，…）
18歳以下のMRSA感染数が増加傾向と　米CDC（CNN，2009/03/03）
- 抗生物質・抗菌剤／耐性菌／院内感染（本サイト）｜抗生物質データ集
UNEP：水銀規制条約制定へ　13年目指し交渉開始決定（読売，2009/02/21）
- Historic Treaty to Tackle Toxic Heavy Metal Mercury Gets Green Light（UNEP，2009/02/20）
- 北極の水銀放出に懸念（朝日，2009/01/14）
- UNEP第2回水銀に関するアドホック公開作業グループ会合の結果（EICネット，2008/10/14）
1CWTのLigand MMC情報（PDBsum）にHgを追加したデータ；アミノ酸はLeu398とCys484
最近の2つの国際的な化学物質の取組と市民参加（EICネット，2009/02/20）
- POPs条約（経済産業省）
- 柴田康行，『進む東アジアPOPsモニタリング』，科学，2008年7月号（特集＝東アジア環境共生系）
- WWFの新規POPs候補物質リスト（本サイト）
オバマ政権が新脅威概念「環境安全保障」打ち出す（47NEWS，2009/02/13）
- 他の最近のSARS言及ニュース例：全日空６年ぶりの最終赤字需要急減で（産経，2009/01/30）
- SARSと抗ウイルス薬（本サイト）
〔左〕CASTpデータ利用ページ（Chime版）のSARSコロナウイルスプロテアーゼ1p9sB鎖のPocketデータ
〔右〕阻害剤モデル分子例TG-0204998が結合した2zu4
※参考：2zu4のCleftsデータ（CASTpとは異なるタンパク質内空隙データ）
今年はタミフルが効かない！リレンザ緊急輸入200万人分（読売，2009/02/10）
- 鳥インフルエンザ＆新型インフルエンザ情報（本サイト）
遺伝子組み換え動物から医薬品　米FDAが初認可（日経，2009/02/08）　※アンチトロンビン（antithrombin）をヤギの乳から製造
- FDA Approves Orphan Drug ATryn to Treat Rare Clotting Disorder（FDA，2009/02/06）
「CO2は汚染物質」　米当局、排ガス規制手続き開始（朝日，2009/02/07）
- スパムメール1通あたり0.3グラムの二酸化炭素が発生、McAfee調査（INTERNET Watch，2009/04/20）
- 「温暖化、深刻な脅威」と米報告、削減規制へ始動（読売，2009/04/18）
- 温室効果ガス（本サイト）
- 本間善夫，「2時間即決環境問題」，pp.44-61，数研出版(2000)
- Googleによる“Obama carbon dioxide”ニュース検索結果
イスラエル：ガザ侵攻　イスラエル軍、白リン弾使用認める　調査開始を表明（毎日，2009/01/22）
- 酒井啓子，『排除から抹殺に踏み出したイスラエル　見たくないものは消すという恐るべき発想』，週刊東洋経済，2009年1月31日号
- 参考：Youtubeによる“white phosphorus”検索結果
- 桜井弘，「元素111の新知識　第2版」，pp.94-98，講談社ブルーバックス(2009)
- 野村祐次郎・辰巳敬・本間善夫，「チャート式シリーズ新化学」，pp.291-292，数研出版(2009) [2009年3月発刊]
- 参考（リン化合物の構造例）：Collection of 41 structures for the element P（Chemistry, Structures & 3D Molecules @ 3Dchem.com - Inorganic Library）
  
  同ページのP₄O₁₀より
カナダ　ビスフェノールAを含む哺乳瓶を規制へ（EICニュース，2008/10/17）
- 第20回環境ホルモン学会講演会『BPA 等の低用量影響の標的「中枢神経」』（2009/02/24開催） [PDF]
- 環境ホルモンとして疑われている化合物例（本サイト）｜ビスフェノールAが結合したエストロゲン受容体γ
- 本間善夫・川端潤，「パソコンで見る動く分子事典」，p.208，講談社ブルーバックス(2007)
- Googleによる本サイト内“ビスフェノールA”検索結果

EICネット[海外ニューストップページ]
化学物質国際対応ネットワーク　※REACH情報（本サイト内情報，言及ブログエントリー）
動物由来感染症を知っていますか？（厚生労働省）
テロ・緊急時対策（在米日本大使館）
メールマガジン「グローバル・エイズ・アップデイト」（アフリカ日本協議会）
CSR担当者向け環境ビジネス情報メディア ecool（エクール）｜海外CSR・環境通信
WebLSD（ライフサイエンス辞書）｜オンデマンド英語教材（ライフサイエンス辞書プロジェクト）
IT用語辞典 e-Words
文献収集講座（京都大学建築系図書室）
海外関連ニュース検索例：Googleによる“FDA OR CDC OR NIH OR OECD OR UNICEF OR UNESCO”ニュース検索結果
Data Book of Molecules（本サイト英語版コンテンツ）

「生活環境化学の部屋」ホームページ｜Jmol版「分子の学習帳」｜本間ラボへのパスポート