◆ 2006年ノーベル生理学医学賞:RNA干渉 ◆
★今週の分子/連載108(2006/10/03〜):RNA干渉関連PDBデータ例(2AZ0より)

2006年のノーベル生理学医学賞はRNA干渉(RNAi)の研究に!!

The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2006 (Nobel Foundation) | Press Release
※参考:コドンと遺伝暗号表(トピックス掲載) | 分子モデルで見るノーベル賞 | 2006年ノーベル化学賞:真核生物の遺伝情報転写



PDB 2az0より作成した壁紙(gif形式)
1024*768 | 800*600
※その他の壁紙:科学とアート



RNA干渉関連PDBデータ例(2az0)
    2az0* 〈PDB〉
    2b9zのModel 1 〈PDB〉
    ▼Molecule of the Month: Small Interfering RNA (siRNA) 〔低分子干渉RNA〕のデータ
    2ffl* 〈ダイサー,PDB〉
    2f8s* 〈PDB〉
    1r9f* 〈PDB〉
    1si3* 〈PDB〉
バックボーン 二次構造
全選択 タンパク質選択
DNA/RNA選択 同バックボーン選択
リガンド選択 (*印のみ)
空間充填 球棒 同(球大き目) スティック 針金
DNA/RNA(ATGCU,backbone)
アミノ色 CPK色 | 濃赤 濃青
Jmol色 Rasmol色
酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックス・βストランド)#
水素結合(太) OFF
 
 
背景・黒 背景・灰 背景・白


※amino表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO

= 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 =
※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET
 PHE TYR TRP LYS ARG HIS

※極性〈酸性・塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG
HIS
 GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP

※疎水性インデックス順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY
 ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE

※等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP
VAL GLY LEU
 ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG

# アミノ酸のコンホメーション選択性参照。


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