文献の図(「メディシナルケミストリー」,図2.11)を参考に作図し,以下の分子モデルも組み立てたもの。ただし原図ではどちらも塩酸塩で描いてあり,上のアミンの部分がアンモニウム塩になっている。また下の分子モデルは構造解析で得られている安定構造ではなく,重ね合わせモデルも上図矢印の3原子を指定した場合の参考例に過ぎない。
分子の重ね合わせは,いくつかの分子計算ソフト(市販分子科学計算ソフトウェアの比較参照)で可能であり,ここではAlchemy 2000の“RMS Fit”機能を用いて実行し,PDB形式で保存した。
・色分け1(Chain):青がモルフィン,緑がペチジン |
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モルフィン/モルヒネ(morphine) |
ペチジン(pethidine) |