【本ページの更新情報】
- 2000/06/04 掲載開始
- 2000/06/24 メソミル分子を修正して再計算し，Log Pのランキングが最小値の分子をメソミルからアミトロールに訂正
- 2000/08/20 ボタンでElectrostatic PotentialおよびLipophilic Potential表示できるように修正 [NEW!]
◎以下の数値は，分子モデリングソフトウェアAlchemy 2000よるPM3構造最適化分子についての計算結果であり，*はその補助プログラムSciQSARによる再構造最適化・計算による結果，*は同じくSciLogPによる計算結果である。
◎各分子モデルの下のボタンで，Electrostatic Potential（静電ポテンシャル）表示またはLipophilic Potential（本サイト内では“疎水性ポテンシャル”と意訳）表示のRelative MLP Coloringモード（Absolute MLP Coloringモードに変更するには，分子モデル上で右クリックして表示されるメニューで以下のように指定；詳細は，Chimeマニュアル参照）にすることができる。
・Select / Display List / Color / Lipophilic Potential / Absolute MLP Coloring
●天然のホルモンの分子形状とLog Pの例
| 分子モデル | ||
|---|---|---|
| Surface / Å2 | 312.08 | 332.12 |
| Volume / Å3 | 265.83 | 287.85 |
| Ovality | 1.5609 | 1.5753 |
| Log P * | 3.2351 | 3.3711 |
| Log P * | 3.1900 | 3.2169 |
●分子の形状（Surface，Volume，Ovality）のランキング
| Surface，Volume，Ovalityの3数値とも75分子中で | |||
|---|---|---|---|
| 最小の分子 | （参考） | 最大の分子 | |
| 分子モデル | |||
| Surface / Å2 | 98.34 | 328.40 | 601.46 |
| Volume / Å3 | 71.55 | 264.27 | 494.73 |
| Ovality | 1.1799 | 1.6490 | 1.9883 |
| Log P * | 0.6022 | 3.0907 | − |
| Log P * | 0.6435 | 3.2209 | − |
●Log P のランキング
※TBTC，TBTO，TPTCはSciQSAR，SciLogPのデフォルトの計算条件では計算できなかったため除外した。
| Log P （*，*とも）が75分子中で | |||
|---|---|---|---|
| 最小の分子 | （参考） | 最大の分子 | |
| 分子モデル | |||
| Log P * | 0.6022 | 2.5779 | 6.8338 （4.5398） |
| Log P * | 0.6435 | 2.7878 | 5.9099 （3.9289） |
| Surface / Å2 | 98.34 | 219.57 | 263.79 （270.16） |
| Volume / Å3 | 71.55 | 264.27 | 229.46 （236.09） |
| Ovality | 1.1799 | 1.5033 | 1.4266 （1.4446） |