◆ 今週の分子 ◆
連載88（2005/05/25〜）：カドヘリンの例（PDBデータ1EDHより）
※Jmol版に変更しました。

　細胞と細胞とをしっかり“接着”しているタンパク質がカドヘリン。それを研究することでがんや認知症などの治療にも役立てようとしている現状を取り上げた番組が先日放映されました。

　カドヘリンの接着力を示すために，取材した眞鍋かをりさんは手の甲をしっかりつねられてしまいました。眞鍋さんの『カドヘリンが無かったら…　私はスライムだったかもしれません』というコメントが効いています。
　今回取り上げたのはカドヘリン・スーパーファミリーの中で古典的カドヘリンに分類され，主に上皮で発現するE-カドヘリンです。

細胞接着タンパク質 E-カドヘリンの例 1edh
1edh（細胞接着タンパク質 E-カドヘリン）
1l3w（C-カドヘリン）
1nci（N-カドヘリン）
バックボーン　二次構造
全選択　タンパク質選択　リガンド選択　HB選択（$印のみ）
 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去
アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色

糖鎖別着色（#印のみ）：Gal，α-Glc，β-Glc，Man，Fuc，Xyl，Sia，GalNAc，GlcNAc，GlcA
酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別
疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順
コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド）
ヒトの必須・非必須区別
 水素結合表示
　
　　
背景・黒　灰　白　紺
●アミノ色表示凡例　ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR　ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO
●酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例　ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR　ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS
●極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別　SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG　HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP
●疎水性インデックス順　ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP　SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE
●有機概念図I/O値順（特性基 R）　ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS　TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE
●等電点順　ASP　GLU　CYS　ASN　PHE　GLN　TYR　SER　MET　TRP　VAL　GLY　LEU　ALA　ILE　THR　PRO　HIS　LYS　ARG
●ヒトの必須・非必須区別　ILE　LEU　VAL　PHE　MET　TRP　LYS　HIS　THR　ARG　ALA　PRO　CYS　TYR　GLY　GLU　GLN　ASP　SER　ASN


ハツカネズミのE-カドヘリン 1edh（左が有機概念図I/O値順，右が必須・非必須区別）


アフリカツメガエルのC-カドヘリン 1l3w（PDBj「今月の分子 99:カドヘリン」（2008/03）で紹介）

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