◆ バイオミネラルとして鉄Feを含むPDBデータ1TKPのSITE例 ◆
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バックボーン 二次構造
全選択 タンパク質選択 リガンド選択
空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色
酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックス・βストランド)#
水素結合(太) OFF
 
 
背景・黒 灰 白 紺
1TKPの12量体(Chain A-D × 3) → RCSB PDB,PDBsum



1tkp_FE〈 304(A) 〉 → PDBsum
I'/O'=2.5111
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺

1tkp_FE〈 307(A) 〉→ PDBsum
I'/O'=2.5000
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺

1tkp_FE〈 310(A) 〉→ PDBsum
I'/O'=0.7222
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺

1tkp_FE〈 317(B) 〉→ PDBsum
I'/O'=2.9167
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺



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