◆ 今週の分子 ◆
連載97(2005/09/14〜):
コレラ毒素の例(PDBデータ1XTCより)

 Protein Data Bankで連載しているMolecule of the Month,今月はコレラ毒素(cholera toxin)。

  
〔上〕コレラ毒素1xtc;下部の青色がレセプター結合サイトのBサブユニット5量体,上部2量体(Aサブユニット)のうち赤色が毒性活性中心A1
〔下〕エンテロトキシン(コレラ毒素も含まれる腸管毒の総称)1ltt

 アメリカのハリケーン「カトリーナ」の被災地で感染症が問題になっていることもあるのかも知れないのだけれど,一日も早い復興を望む。


コレラ毒素の例(1XTC;初期表示(はS原子)
表示(側面図)

※参考データ:エンテロトキシン1LTTのChain D-H;Bサブユニット5量体
表示(上面図)

バックボーン 二次構造
リガンド表示 OFF

全選択 リガンド選択
タンパク質全選択
A鎖(A1サブユニット)選択/1xtcのみ
D-H鎖(Bサブユニット5量体)選択
空間充填 球棒 スティック OFF
CPK アミノ色 | ラベル表示 OFF

酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
疎水性インデックス順
log P値順

水素結合(細) 同(太) OFF
S原子空間充填
ドット表面表示 OFF
光沢表示 OFF 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF
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※amino表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO

= 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 =
酸性中性芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET
 PHE TYR TRP LYS ARG HIS

極性酸性塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG
HIS
 GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP

※hydropathy index順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY
 ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE

※log P値順
ARG ASP ASN GLU GLN HIS GLY SER LYS THR
ALA PRO
 CYS VAL TYR MET ILE LEU PHE TRP


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