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図１　セントラルドグマとRNAワールド
※以下に掲載の図を改変；柳川弘志，「生命はいかに創られたか」，TBSブリタニカ(1991)


図２　tRNAを含むPDBデータ例（1g59より，PDB部分データリストにも収録）；拡大
Glutamyl-tRNA Synthetase Complexed With tRNA(Glu).
［左］tRNAのL字型三次構造の骨格，［中］1g59のChain B（tRNAGlu），［右］1g59のChain A・B（tRNAGluとGluRSの複合体）
※中・右の図では，RNAは球棒（塩基の色は下表と同じ），タンパク質はスティック（色は下表amino形式）表示
◎中村義一 編，「RNAがわかる」，p.90，羊土社(2003)

mRNAの遺伝暗号表
※生物種によっては，以下の普遍暗号に従わないコドンを持つ場合もある。
  第２文字  
U C A G
第
１
文
字		 U UUU Phe／F UCU Ser／S UAU Tyr／Y UGU Cys／C U 第
３
文
字
UUC Phe／F UCC Ser／S UAC Tyr／Y UGC Cys／C C
UUA Leu／L UCA Ser／S UAA 終了 UGA 終了 A
UUG Leu／L UCG Ser／S UAG 終了 UGG Trp／W G
C CUU Leu／L CCU Pro／P CAU His／H CGU Arg／R U
CUC Leu／L CCC Pro／P CAC His／H CGC Arg／R C
CUA Leu／L CCA Pro／P CAA Gln／Q CGA Arg／R A
CUG Leu／L CCG Pro／P CAG Gln／Q CGG Arg／R G
A AUU Ile／I ACU Thr／T AAU Asn／N AGU Ser／S U
AUC Ile／I ACC Thr／T AAC Asn／N AGC Ser／S C
AUA Ile／I ACA Thr／T AAA Lys／K AGA Arg／R A
AUG Met／M（開始） ACG Thr／T AAG Lys／K AGG Arg／R G
G GUU Val／V GCU Ala／A GAU Asp／D GGU Gly／G U
GUC Val／V GCC Ala／A GAC Asp／D GGC Gly／G C
GUA Val／V GCA Ala／A GAA Glu／E GGA Gly／G A
GUG Val／V GCG Ala／A GAG Glu／E GGG Gly／G G

DNAの遺伝暗号表
  第２文字  
T C A G
第
１
文
字		 T TTT Phe／F TCT Ser／S TAT Tyr／Y TGT Cys／C T 第
３
文
字
TTC Phe／F TCC Ser／S TAC Tyr／Y TGC Cys／C C
TTA Leu／L TCA Ser／S TAA 終了 TGA 終了 A
TTG Leu／L TCG Ser／S TAG 終了 TGG Trp／W G
C CTT Leu／L CCT Pro／P CAT His／H CGT Arg／R T
CTC Leu／L CCC Pro／P CAC His／H CGC Arg／R C
CTA Leu／L CCA Pro／P CAA Gln／Q CGA Arg／R A
CTG Leu／L CCG Pro／P CAG Gln／Q CGG Arg／R G
A ATT Ile／I ACT Thr／T AAT Asn／N AGT Ser／S T
ATC Ile／I ACC Thr／T AAC Asn／N AGC Ser／S C
ATA Ile／I ACA Thr／T AAA Lys／K AGA Arg／R A
ATG Met／M（開始） ACG Thr／T AAG Lys／K AGG Arg／R G
G GTT Val／V GCT Ala／A GAT Asp／D GGT Gly／G T
GTC Val／V GCC Ala／A GAC Asp／D GGC Gly／G C
GTA Val／V GCA Ala／A GAA Glu／E GGA Gly／G A
GTG Val／V GCG Ala／A GAG Glu／E GGG Gly／G G

※参考（携帯版コドン表）：mRNA，DNA

コドン解明のきっかけとなった実験に関連して
※初期表示はmRNA（UUUUUUUUUUUU），ポリペプチドはα-helix構造で組み立て
※mol形式のポリペプチドはProtein選択やそれに関する特殊表示は不可
実験者名mRNA（部分）ポリペプチド（部分）
ニーレンバーグ UUUUUUUUUUUU　 FFFF　（PDB形式）｜ （mol形式）
コラーナ CACACACACACA　 HTHT　（PDB形式）｜ （mol形式）
その他の参考データ（PDB部分データリストより）
PDB_1g59のChain A・B（tRNAGluとGluRSの複合体）
PDB_1asyのChain A・R（tRNAAspとAspRSの複合体）
PDB_1ml5のChain B・C（P-site tRNAPheとA- and P-site mRNA codons）
PDB_1gixのChain B・C・1（A-siteおよびP-site tRNAPheとA- and P-site mRNA codons）
PDB_1wz2のChain A・C ｜ PDB_2bytのChain A・B　※理研資料参照
◆tRNA擬態タンパク質（図３参照）
PDB_1eh1のChain A（図3のRRF）
PDB_1dt9のChain A（図3のeRF1）
PDB_1darのChain A（図3のEF-G）
PDB_1tttのChain A・D（図3のEF-Tu tRNA 複合体）
PDB_1gqeのChain A（図3のRF2）　 Ser205・Pro206・Phe207選択
Backbone 2oStructure Termini
DNA/RNA（ATGCU）
Ligands表示 OFF
Water表示（*印データのみ）　 OFF

全選択 Ligand選択 Protein選択
DNA/RNA全選択 同backbone選択
 空間充填 球棒 スティック OFF
CPK amino ｜ ラベル表示 OFF
酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
有機概念図I/O値順（特性基 R）| 同（アミノ酸）
等電点順
Dot Surface表示 OFF
水素結合（細） 同（太） OFF
Specular OFF ｜ 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF ｜ 画像をクリップボードへコピー

※amino表示の凡例
ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR
ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO
＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝
※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR
ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS
※極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG
HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP
※有機概念図I/O値順（特性基 R）
ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS
TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE
※同上（アミノ酸）
GLY　SER　ASN　ASP　GLN　THR　GLU　ALA　ARG　HIS
VAL　LYS　CYS　PRO　LEU　TYR　ILE　MET　TRP　PHE
※等電点順
ASP　GLU　CYS　ASN　PHE　GLN　TYR　SER　MET　TRP
VAL　GLY　LEU　ALA　ILE　THR　PRO　HIS　LYS　ARG

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