◆ βバレル型膜タンパク質データ集(Jmol版) ◆ = 膜タンパク質データ集 (2) =
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《 初期表示は1thq 》
※本データ集は,膜貫通領域をもつと推定されるデータを抽出して掲載し,そのβ-シート部分を選択して表示の変更ができるようにしたものです。e1〜のボタンがあるものは,e1〜で各領域を,e_allで全領域を選択して右下フレームのボタンで各種表示の指定をすることが可能です(その他については下フレームのChime機能によるシート選択のみ)。この表示のためにPDBデータのHETATM(リガンドや水など)のデータ番号を変更してるものもあります。
さらに,b_ex1〜とあるのは,βバレルで隣接するアミノ酸が連なっている部分の例,s1〜は元PDBデータに記載されているSITE例です。
また,$印があるものについては,疎水性インデックス値にも解析データを掲載しています。
なお,〈 PDB 〉をクリックすれば RCSB PDB のオリジナルデータを参照できます。
データは当初はMembrane Proteins of Known Structureに掲載されているものを順次取り上げ,その後もさらに追加していく予定です。
1a0t Chain P 〈PDB〉 [Outer Membrane Protein]Sucrose-Specific Porin, With Bound Sucrose Molecules.
1bxw$ 〈PDB〉 e1 e2 e3 e4 e5 e6 e7 e8 e_all [Membrane Protein]Outer Membrane Protein A (Ompa) Transmembrane Domain.
1by3 〈PDB〉 [Membrane Protein]
1by5 〈PDB〉 [Membrane Protein]Fhua From E. Coli, With Its Ligand Ferrichrome.
1e54 〈PDB〉 [Outer Membrane Protein]Anion-Selective Porin From Comamonas Acidovorans.
1ek9 〈PDB〉 [Membrane Protein]2.1A X-Ray Structure Of Tolc: An Integral Outer Membrane Protein and Efflux Pump Component From Escherichia Coli.
1fcp 〈PDB〉 [Membrane Protein]Ferric Hydroxamate Uptake Receptor (Fhua) From E. Coli In Complex With Bound Ferrichrome-Iron.
2fcp 〈PDB〉 [Membrane Protein]Ferric Hydroxamate Uptake Receptor (Fhua) From E. Coli.
1fep 〈PDB〉 [Membrane Protein]Ferric Enterobactin Receptor.
1i78のChain A 〈PDB〉 [Hydrolase]Crystal Structure Of Outer Membrane Protease Ompt From Escherichia Coli.
1ild 〈PDB〉 [Hydrolase, Membrane Protein]Outer Membrane Phospholipase A From Escherichia Coli N156A Active Site Mutant pH 4.6.
1ilz$ 〈PDB〉 e1 e2 e3 e4 e5 e6 e7 e8 e9 e10 e11 e12 e13 e_all [Hydrolase, Membrane Protein]Outer Membrane Phospholipase A From Escherichia Coli N156A Active Site Mutant pH 6.1.
1im0 〈PDB〉 [Hydrolase, Membrane Protein]Outer Membrane Phospholipase A From Escherichia Coli N156A Active Site Mutant pH 8.3.
1k24$ 〈PDB〉 e1 e2 e3 e4 e5 e6 e7 e8 e9 e10 e11 e12 e13 e_all [Membrane Protein]Crystal Structure Of The Opca Outer Membrane Adhesin/Invasin From Neisseria Meningitidis.
1kmp 〈PDB〉 [Membrane Protein]Crystal Structure Of The Outer Membrane Transporter Feca Complexed With Ferric Citrate.
1mm4のModel 1$ 〈PDB〉 e1 e2 e3 e4 e5 e6 e7 e8 e_all [Transferase]Solution NMR Structure Of The Outer Membrane Enzyme Pagp In Dpc Micelles.
2mprのChain A 〈PDB〉 [Outer Membrane Protein]Maltoporin From Salmonella Typhimurium.
1nqe 〈PDB〉 [Transport Protein]Outer Membrane Cobalamin Transporter (Btub) From E. Coli.
2omf$ 〈PDB〉 e1 e2 e3 e4 e5 e6 e7 e8 e9 e10 e11 e12 e13 e14 e15 e16 e17 e18 e19 e_all [Integral Membrane Protein Porin]
1osmのChain A$ 〈PDB〉 e1 e2 e3 e4 e5 e6 e7 e8 e9 e10 e11 e12 e13 e14 e15 e16 e17 e_all [Outer Membrane Protein]Osmoporin (Ompk36) From Klebsiella Pneumoniae.
1p4t$ 〈PDB〉 e1 e2 e3 e4 e5 e6 e7 e8 e9 e10 e_all [Membrane Protein]Crystal Structure Of Neisserial Surface Protein A (Nspa).
2por 〈PDB〉 [Integral Membrane Protein Porin]Structure of porin refined at 1.8 A resolution.
1prn 〈PDB〉 [Integral Membrane Protein Porin]Refined structure of the porin from Rhodopseudomonas blastica. Comparison with the porin from Rhodobacter capsulatus.
1q9fのModel 1 〈PDB〉 [Membrane Protein]NMR Structure Of The Outer Membrane Protein Ompx In Dhpc Micelles.
1qd6 〈PDB〉 [Membrane Protein]Outer Membrane Phospholipase A From Escherichia Coli.
1qfg 〈PDB〉 [Metal Transport]E. Coli Ferric Hydroxamate Receptor (Fhua).
1qj8$ 〈PDB〉 e1 e2 e3 e4 e5 e6 e7 e8 e_all [Integral Membrane Protein]Crystal Structure Of The Outer Membrane Protein Ompx From Escherichia Coli.
1qkc 〈PDB〉 [Tonb Dependent Receptor]Escherichia Coli Ferric Hydroxamate Uptake Receptor (Fhua) In Complex Two-Albomycin.
1t1lのChain A 〈PDB〉 [Lipid Transport]Crystal Structure Of The Long-Chain Fatty Acid Transporter Fadl.
1thq$ 〈PDB〉 e1 e2 e3 e4 e5 e6 e7 e8 e_all | b_ex1 [Transferase]Crystal Structure Of Outer Membrane Enzyme Pagp.
1tlwのChain A 〈PDB〉 e1 e2 e3 e4 e5 e6 e7 e8 e9 e10 e11 e12 e13 e14 e_all [Membrane Protein]Tsx Structure Complexed With Thymidine.
1ujwのChain A 〈PDB〉 [Transport Protein/Hydrolase]Structure Of The Complex Between Btub and Colicin E3 Receptor Binding Domain.
1uyn 〈PDB〉 e1 e2 e3 e4 e5 e6 e7 e8 e9 e10 e11 e12 e_all | s1(AC1) s2(AC2) s3(AC3) [Membrane Protein]Translocator Domain Of Autotransporter Nalp From Neisseria Meningitidis.
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