◆ マンガンクラスター/CaMn
4
O
4
(酸素発生系)を含む生体分子のSITE例 ◆
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金属原子を含む生体分子のSITEデータ集
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光合成光化学反応中心を含む生体分子のSITE例
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1s5l_OEC(光合成,光化学系II,マンガンクラスター)
I'/O'=2.3955
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
2axt_OEC (電子伝達,光化学系II,マンガンクラスター)
I'/O'=2.5056
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
3a0b_OEC (電子伝達,光化学系II,マンガンクラスター)
I'/O'=2.5056
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
3bz1_OEC (電子伝達,光化学系II,マンガンクラスター)
I'/O'=2.5056
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
●参考:光合成,光化学系I に関係するデータ例(4Fe-4Sクラスター,Fe
4
S
4
)
1jb0_SF4(光合成,光化学系I)
I'/O'=0.6622
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
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鉄硫黄クラスター/Fe4S4,Fe2S2,Fe3S4を含む生体分子のSITE例
アミノ参性質別表示の凡例
●
酸性
・
中性
〈
芳香族
〉・
塩基性
アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU
GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET
PHE TYR TRP
LYS ARG HIS
●有機概念図I/O値順(特性基 R)
ASN SER
ASP GLN
GLU THR
ARG HIS
GLY
LYS TYR TRP
CYS MET
PRO PHE
ALA VAL LEU ILE
【参考】関連ページ
園池公毅,「光合成とはなにか 生命システムを支える力」,講談社ブルーバックス(2008)
PDBj - 今月の分子(Molecule of the Month)- 059:光化学系II(Photosystem II)
Library of Inorgainc Structures - Mn(Chemistry, Structures & 3D Molecules @ 3Dchem.com)
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