■分子モデルの色を考える


 最近,科学番組やテレビのコマーシャルで,DNAや薬剤分子など,CGによる分子モデルをたくさん見るようになりました.でも,番組によって,同じ分子でも色が違うようです.分子モデルをカラーで見ることは,化学教育にとってどのような意味があるのでしょう? そこで質問です!

 以下の6つの分子モデル図(静止画像)は,同じ分子に見えますか? 違う分子に見えますか? あなたにとって,色や表示形式の違いがどう影響しているか,お考えを聞かせて下さい.このページのプリンタ出力(モノクロ)またはグレー版画像をご覧になった感想もお願いします.また,あなたのお持ちの本にカラーの分子モデル図が出ていたら,その文献名(出版社名も)と配色(C,H,N,O,Sなど)を教えて下さい.
 ところで,この分子は何でしょうか? 【ヒント:あま〜い!/解答編作成中 → Jmolコンテンツをご参照ください! 】

【1】分子ソフト HyperChem(Hypercube社)/既定色,【2】同/アレンジ色,【3】CAMD-I plus(矢野・本間),【4】分子表示 plug-in“ChemscapeChime”(MDL社),【5】分子 Java(Sun Microsystem社),【6】P.W.Atkins 著,千原秀昭・稲葉章 訳,「分子と人間」,東京化学同人(1990)《スキャナで読み込んだので,色が若干異なります》


〔左〕Jmol形式 〔右〕モル・タロウ

◎以上のアンケートに対して,ご回答・ご意見をお待ちしています.年齢,ご職業・学年などもお書き添え下さい.
 お使いの分子ソフトのサンプル画像ファイルや,書籍の分子モデルのスキャナ読み取り図などをメールに添付して戴ければ,本ページに掲載して充実させたいと考えています.


【パソコン通信における関連発言】

●“分子モデルの色”についてのNIFTY-Serve/FCHEM(旧)/MES_5 での発言例

06595/06599 GEH05313  シェーマ         RE:分子模型の色について(長文)
( 5)   96/03/17 20:45  05750へのコメント

 インターネットがらみの話題ですが,昨年の「分子模型の色」の話題とも関連
するので自己RES(→#5750)をつけます。

 詳細は20番会議室に書き込んだので(#1090,1092),そちらを参照して頂
くことにしますが,インターネットのホームページ上で分子モデルを表示する2
つの試み(アメリカが発信)で,表示される「分子模型の色」を紹介したいと思
います。

 #5750 の書き込んだ原子の色についてだけ追加(最後の2件)します。
 
|   AN  1    6   7   8   9    11   15  16   17 /  −
| 
|  元素 H … C  N  O  F … Na … P   S   Cl / その他
| −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
| 
|    白  黒 青 赤 黄緑 [灰]  橙 黄  緑  [適宜] 「分子と人間」 
| 
|      白  青 紫 緑 △  △  △ [赤] [赤]  △(黄)  中野,MODRAST
| 
|    水  緑  青  赤  △   △   △ 黄  △   △(紫)  矢野・本間,plus
|                                                                  (カラー)
|      (1)  (2) (3) (4) (5)  (6)  (7) (8)  (9)    (10)   本間,plus(タイル)
| 
       白   灰  菫  赤 黄土   青   橙  黄   緑     ?     ChemscapeChime/CPK

       灰   黒  青  赤  △    △  水色 黄   △     △     Sun.com. の Java

             (△は複数の元素で共通に用いられる色)

 こう見ると,似ているようでやはりみな違いますね。

 Hero さんがアナウンスしてくれた(MES_20, #1080-1081)ChemscapeChime 
は特に楽しく,今この文章を書いているエディタと同じディスプレイ上で,複数
の分子モデルが回転しています(オフラインで Netscape を起動して利用可能)。
Chemscape Chime(現在 Win95 用のベータ版のみ)を FTP で入手し,Netscape2.0
に plug-in(自動的に機能を追加してくれる仕組み)する必要があるので,利用
者が対応していないと見られないのが残念です。以前紹介した HypewrChem とい
う分子ソフトでも出力できる MDL 形式の分子データファイルがあれば,簡単に
自作の「動く分子事典」を作れそうです。ChemscapeChime で表示可能ないくつ
かの分子色タイプのうち,CPK というのがかなり標準的な色使いなのかもしれま
せん。

 Java もアニメーション等,「動くホームページ」などを作れるということで
話題になっていますが(日本の中・高のホームページでも利用者急増),こちら
は今後多くのブラウザが対応するようですから,特別なことをしないでも他人に
見てもらえるし,自分でソースを書き直したりできる利点があります。
 なお,上記分子 Java(こちらも Netscape2.0 等対応ブラウザが必要)は,

  http://java.sun.com/applets/applets/MoleculeViewer/

の example1.html 〜 example3.html で試せます(MES_20,#1090 も参)。

 何時の間にか,自分でも訳のわからない単語を連ねてしまうようになったしま
って愕然としています。あくまで「分子の色」にこだわっての行きがかりです。

                  1996/03/17 本間善夫(geh05313@niftyserve.or.jp)

◆ひとこと 人間の視覚情報として,“かたち”と“色”を考えた場合,どちらの重みが大きいのでしょう? この点については,古来いろいろな研究がなされていますが,例えば服を購入する際などは,“かたち”よりも色彩の方が先に目に入り,選ぶ場合も色彩の比重が大きいことなどはよく言われています。
 分子モデルの場合,“かたち”の方が重要なのですが,“色”(これは原子の種類の識別に寄与)をつけてしまった場合,書籍やソフトウェアなどによって異なる色彩が,分子の認識・理解の上で“雑音”にならないのかどうか(特に初学者に対して),というのがこのアンケートをお願いする目的です。

“かたち”と“色”の問題 上の図で,下と同じものを上のなかから選びなさい.
【引用】朝日新聞社編,「色の博物誌 −世界の色彩感覚−」,p.150,朝日新聞社(1986)

 “かたち”と“色”,そして“分子”については,以下の文献,ページなども参照してください。

※「化学と教育」は,日本化学会の教育会員会誌(入会案内).


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