体内で解毒などの重要な働きをしているのがユニークな形をしたシトクロムP450ファミリー(Googleによる“cytochrome P450”イメージ検索結果参照)。今週は,以下の講演会で結晶構造解明の重要性に言及されているヒトcytochrome P450(CYP)2C9の例です。
なお,シトクロムP450は昔放映されたNHKスペシャル『驚異の小宇宙 人体/壮大な化学工場 <肝臓>』(DVDあり;先日,NHK教育TVジュニアスペシャル版放映)で手数の多い円盤のようなCGで登場して強く印象に残っていますが,450nmの光を吸収することから,大阪大学蛋白質研究所の佐藤了名誉教授が命名されたとのことです。
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※amino表示の凡例 ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO = 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 = ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS ※極性〈酸性・塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別 SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP ※hydropathy index順 ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE ※log P値順 ARG ASP ASN GLU GLN HIS GLY SER LYS THR ALA PRO CYS VAL TYR MET ILE LEU PHE TRP ※有機概念図I/O値順(特性基 R) ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE ※同上(アミノ酸) GLY SER ASN ASP GLN THR GLU ALA ARG HIS VAL LYS CYS PRO LEU TYR ILE MET TRP PHE |
ヒトcytochrome P450(CYP)2C9の構造例1OG5
〔左〕Chain A全体,〔右〕そのHEME CのSITE部分(PDBデータのLigand結合部位で作成)