炭疽菌感染者の治療薬開発やSARS研究で,ネットにつながっている多数の一般ユーザーのコンピュータの力を借りて計算する分散コンピューティング(グリッドコンピューティング)が話題になりました。巨大な生体分子と医薬などの低分子の相互作用を計算するのは大変なことですから,この手法は極めて有効で,いろいろなプロジェクトが進行しています。もちろんそれ以外の分野でも活用されており,各種分散コンピューティングプロジェクトの紹介で詳しく解説されています。
今回,抗がん剤を見つけるためのあるプロジェクトで用いられた標的タンパク質を取り上げたページを作成したので,ここではその中の一例を紹介します。
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※amino表示の凡例 ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO = 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 = ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS ※極性〈酸性・塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別 SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP ※hydropathy index順 ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE ※log P値順 ARG ASP ASN GLU GLN HIS GLY SER LYS THR ALA PRO CYS VAL TYR MET ILE LEU PHE TRP ※有機概念図I/O値順(特性基 R) ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE ※同上(アミノ酸) GLY SER ASN ASP GLN THR GLU ALA ARG HIS VAL LYS CYS PRO LEU TYR ILE MET TRP PHE |
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