「世界で一番美しい元素図鑑」で気になった元素の関連データSITE例

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●ランタノイド

※RCSB PDBデータがある元素のみ

La(57)
1djg_LA〈 LA 4(A) 〉（ホスホリパーゼ）→ PDBsum
I'/O'＝3.7500
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
リガンドの元素記号表示
背景・黒　灰　白　紺

Ce(58)
1ak8_CE〈 CE 77(A) 〉（カルモジュリン）→ PDBsum
I'/O'＝3.4091
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
リガンドの元素記号表示
背景・黒　灰　白　紺

Pr(59)
2if5_PR〈 129(A) 〉（ヒドロラーゼ）→ PDBsum
I'/O'＝3.7500
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
リガンドの元素記号表示
背景・黒　灰　白　紺

Sm(62)
2o5w_SM〈 170(B) 〉（ヒドロラーゼ）→ PDBsum
I'/O'＝2.5000
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
リガンドの元素記号表示
背景・黒　灰　白　紺

Eu(63)
1qsl_EU〈 1(A) 〉（DNAポリメラーゼ）→ PDBsum
I'/O'＝3.2143
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
リガンドの元素記号表示
背景・黒　灰　白　紺

Gd(64)
1okj_GD 〈 1216(A) 〉（ヒドロラーゼ）→ PDBsum
I'/O'＝2.3750
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
リガンドの元素記号表示
背景・黒　灰　白　紺

Ho(67)
3eeu_HO〈 155(B) 〉（ピロホスホヒドロラーゼ）→ PDBsum
I'/O'＝2.5000
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
リガンドの元素記号表示
背景・黒　灰　白　紺

Er(68)
3cm6_ER3 〈 300(A) 〉（ヒドロラーゼ）→ PDBsum
I'/O'＝3.2143
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
リガンドの元素記号表示
背景・黒　灰　白　紺

Yb(70)
1nch_YB〈 500(A) 〉（細胞接着タンパク質）→ PDBsum
I'/O'＝2.8125
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
リガンドの元素記号表示
背景・黒　灰　白　紺

Lu(71)
1qmm_LU〈 2005(A) 〉（ホスホイノシチド3-キナーゼ）→ PDBsum
I'/O'＝3.7500
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
リガンドの元素記号表示
背景・黒　灰　白　紺

【参考】ランタノイドにSc(17)，Y(39)を加えた17元素がレアアース（希土類元素）になります。RCSB PDBにはY(39)を含むデータがあります。

●最も密度の高い元素は？

※単体の密度参照

La(57) 1djg_LA〈 LA 4(A) 〉（ホスホリパーゼ）→ PDBsum I'/O'＝3.7500 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順リガンドの元素記号表示背景・黒　灰　白　紺	Ce(58) 1ak8_CE〈 CE 77(A) 〉（カルモジュリン）→ PDBsum I'/O'＝3.4091 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順リガンドの元素記号表示背景・黒　灰　白　紺
Pr(59) 2if5_PR〈 129(A) 〉（ヒドロラーゼ）→ PDBsum I'/O'＝3.7500 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順リガンドの元素記号表示背景・黒　灰　白　紺	Sm(62) 2o5w_SM〈 170(B) 〉（ヒドロラーゼ）→ PDBsum I'/O'＝2.5000 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順リガンドの元素記号表示背景・黒　灰　白　紺
Eu(63) 1qsl_EU〈 1(A) 〉（DNAポリメラーゼ）→ PDBsum I'/O'＝3.2143 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順リガンドの元素記号表示背景・黒　灰　白　紺	Gd(64) 1okj_GD 〈 1216(A) 〉（ヒドロラーゼ）→ PDBsum I'/O'＝2.3750 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順リガンドの元素記号表示背景・黒　灰　白　紺
Ho(67) 3eeu_HO〈 155(B) 〉（ピロホスホヒドロラーゼ）→ PDBsum I'/O'＝2.5000 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順リガンドの元素記号表示背景・黒　灰　白　紺	Er(68) 3cm6_ER3 〈 300(A) 〉（ヒドロラーゼ）→ PDBsum I'/O'＝3.2143 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順リガンドの元素記号表示背景・黒　灰　白　紺
Yb(70) 1nch_YB〈 500(A) 〉（細胞接着タンパク質）→ PDBsum I'/O'＝2.8125 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順リガンドの元素記号表示背景・黒　灰　白　紺	Lu(71) 1qmm_LU〈 2005(A) 〉（ホスホイノシチド3-キナーゼ）→ PDBsum I'/O'＝3.7500 CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順リガンドの元素記号表示背景・黒　灰　白　紺