※分子モデル表示にはChimeプログラム(無料)のインストールが必要です(分子を見ない場合は不要)!
〔鳥〕インフルエンザ関連PDBデータ例
※初期表示は1jso
※CASTpにより,PDB ID または Keyword Search(influenza 等で検索)によりポケット部位探索可能
※amino表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO
= 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 =
※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS
※極性〈酸性・塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG
HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP
※hydropathy index順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE
※log P値順
ARG ASP ASN GLU GLN HIS GLY SER LYS THR
ALA PRO CYS VAL TYR MET ILE LEU PHE TRP
※有機概念図I/O値順(特性基 R)
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS
TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE
※同上(アミノ酸)
GLY SER ASN ASP GLN THR GLU ALA ARG HIS
VAL LYS CYS PRO LEU TYR ILE MET TRP PHE
インフルエンザウイルスの構造;サブタイプ『H?N?』を決めるのがヘマグルチニン(HA;H1〜H15)とノイラミニダーゼ(NA;N1〜N9)
※2004年の鳥インフルエンザはH5N1,1918年のスペイン風邪はH1N1
※インフルエンザウイルス Q&A−特徴と性状−(東京都立衛生研究所)などを参考に作図
※参考:Googleイメージ検索による“haemagglutinin”検索結果,同“neuraminidase”
ヘマグルチニン分子の3本鎖の例(1kenのChain A-F)
※「分子レベルで見た薬の働き」(平山令明,講談社ブルーバックス),pp.198-209参照
シアル酸および抗インフルエンザウイルス薬(プラグ薬の例)のザナミビルとGS4071・オセルタミビル;親油ポテンシャル表示
※「別冊日経サイエンス143 世界を脅かす感染症とどう闘うか」,p.51参照
シアル酸とザナミビルの重ね合わせ例
ザナミビル〔※リレンザ〕を含むPDBデータ1a4gのChain A → 新しい風邪薬・インフルエンザ治療薬
GS4071(オセルタミビル〔※タミフル〕が血液・肝臓中で変化)を含む2qwk