◆ 「予防原則」を取り上げた本から〈Chime分子表示〉 ◆
= “科学技術と社会”を考える =

★今週の分子/連載91(2005/06/15〜):DESを含むエストロゲン受容体の例(PDBデータ3ERDより)

→ 詳細情報掲載のオリジナル版(分子表示はJmolによる)


DESを含むエストロゲン受容体の例(3ERDのChain A)
※初期表示では,DESのSITE部分をamino色で球棒・ドット表面表示

バックボーン 二次構造
リガンド表示 OFF

全選択 タンパク質選択 SITE部分選択
リガンド(DES+Cl)選択 DES選択
空間充填 球棒 スティック 針金 OFF
CPK amino | ラベル表示 OFF
酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
疎水性インデックス順(タンパク質)
log P値順(タンパク質)
ドット表面表示 OFF
光沢表示 OFF 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF
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※amino表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO

= 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 =
酸性中性芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET
 PHE TYR TRP LYS ARG HIS

極性酸性塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG
HIS
 GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP

※hydropathy index順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY
 ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE

※log P値順
ARG ASP ASN GLU GLN HIS GLY SER LYS THR
ALA PRO
 CYS VAL TYR MET ILE LEU PHE TRP


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