【本ページの更新情報】
- 2000/06/02 掲載開始
- 2000/06/04 ランキングを作成
- 2000/06/06 補足2に若干の追記
- 2000/06/07 図4を追加
- 2000/06/20 トルクロホスメチル(No.76)を追加
- 2000/06/24 メソミルの分子式と分子モデルを訂正し,表データと図1も修正.オクタクロロスチレン,トリフルラリン,p-ニトロトルエン,ニトロフェンの分子式の誤記を訂正
- 2000/08/18 チウラム,リニュロン,レゾルシン,3,4-ジクロロアニリン,1,2,3,7,8-ペンタブロモベンゾフラン(No.77-81)を追加 [NEW!]
- 2000/08/20 図6を差し替え [NEW!]
多数の化合物の中から環境ホルモンとして作用しそうな化合物を選び出していくために様々な試験法が考案されているが,近年進展著しい計算化学の手法を援用しようとする試みも多数あり,例えば小林茂樹らにより化合物の生物活性と化学的ハードネスとの関係の解析が報告されるなどしている。小林らの「構造-毒性活性相関」によるダイオキシン類などの解析結果によれば,分子の毒性やエストロゲン様作用は絶対ハードネスに強く依存するとされる。なお,柔らかい(ソフトな)化合物とは電子が移動しやすいと解釈されるものである。
絶対ハードネス η = (εLUMO - εHOMO )/2
絶対電気陰性度 χ = - (εLUMO + εHOMO )/2εLUMO:LUMO(lowest unoccupied molecular orbital,最低空分子軌道)の電子エネルギー
εHOMO:HOMO(highest occupied molecular orbital,最高被占分子軌道)の電子エネルギー※LUMO,HOMOは福井謙一らが提唱したフロンティア軌道であり,このフロンティア軌道理論の業績に対してノーベル化学賞が与えられている(1981年)。
《参考》 Chem3Dによる環境ホルモン関連分子のLUMO,HOMO表示画像例
図1 下表の化合物順に並べた環境ホルモン関連分子のεLUMO,εHOMO,χ,η.
εLUMO,εHOMOは分子計算ソフトウェアChem3DのPM3構造最適化した分子についての計算結果である.ソフトウェアの種類や計算理論・条件,さらには分子モデルデータの初期構造によって計算結果が異なることに注意する必要がある(補足1,2参照).
No. | 化合物名 | 分子式 | εLUMO / eV | εHOMO / eV | χ / eV | η / eV |
1 | 2,4-D | C8H6Cl2O3 | -0.113301 | -9.632584 | 4.8729 | 4.7596 |
2 | 2,4,5-T | C8H5Cl3O3 | -0.315472 | -8.594338 | 4.4549 | 4.1394 |
3 | o,p'-DDD | C14H10Cl4 | -0.933611 | -10.237040 | 5.5853 | 4.6517 |
4 | p,p'-DDD | C14H10Cl4 | -0.955292 | -10.215312 | 5.5853 | 4.6300 |
5 | o,p'-DDE | C14H8Cl4 | -0.933611 | -10.237040 | 5.5853 | 4.6517 |
6 | p,p'-DDE | C14H8Cl4 | -0.972560 | -9.133780 | 5.0532 | 4.0806 |
7 | o,p'-DDT | C14H9Cl5 | -0.949214 | -9.812846 | 5.3810 | 4.4318 |
8 | p,p'-DDT | C14H9Cl5 | -1.073111 | -10.090856 | 5.5820 | 4.5089 |
9 | TBTC | C12H27ClSn | 29.619670 | -11.924856 | -8.8474 | 20.7723 |
10 | TBTO | C24H54OSn2 | 21.864069 | -12.428490 | -4.7178 | 17.1463 |
11 | TPTC | C18H15ClSn | -1.229483 | -11.337283 | 6.2834 | 5.0539 |
12 | 2,3,7,8-TCDD | C12H4Cl4O2 | 0.221598 | -8.223039 | 4.0007 | 4.2223 |
13 | 2,3,7,8-TCDF | C12H4Cl4O | -1.499411 | -9.215459 | 5.3574 | 3.8580 |
14 | アジピン酸ジエチルヘキシル | C22H42O4 | -0.088587 | -12.493566 | 6.2911 | 6.2025 |
15 | アトラジン | C8H14ClN5 | 2.191958 | -9.860110 | 3.8341 | 6.0260 |
16 | アミトロール | C2H4N4 | 4.710518 | -10.069575 | 2.6795 | 7.3900 |
17 | アラクロール | C14H20ClNO2 | -0.351377 | -10.732659 | 5.5420 | 5.1906 |
18 | アルディカーブ | C7H14N2O2S | 1.682753 | -8.763767 | 3.5405 | 5.2233 |
19 | アルドリン | C12H8Cl6 | 0.386536 | -6.960782 | 3.2871 | 3.6737 |
20 | エスフェンバレレート | C25H22ClNO3 | -1.081736 | -10.976359 | 6.0290 | 4.9473 |
21 | エンドスルファン | C9H6Cl6O3S | 5.156563 | -6.999853 | 0.9216 | 6.0782 |
22 | エンドリン | C12H8Cl6O | 4.545756 | -6.991058 | 1.2227 | 5.7684 |
23 | オキシクロルデン[クロルデン代謝物の例] | C10H4Cl8O | 4.959984 | -7.083523 | 1.0618 | 6.0218 |
24 | オクタクロロスチレン | C8Cl8 | 2.241182 | -7.253378 | 2.5061 | 4.7473 |
25 | カルバリル | C12H11NO2 | -3.468406 | -11.959787 | 7.7141 | 4.2457 |
26 | クロルデン[cis-体] | C10H6Cl8 | 4.939997 | -7.099319 | 1.0797 | 6.0197 |
27 | クロルデン[trans-体] | C10H6Cl8 | 4.947597 | -7.082630 | 1.0675 | 6.0151 |
28 | ケポン(クロルデコン,キーポン) | C10Cl10O | -0.638757 | -6.960615 | 3.7997 | 3.1609 |
29 | ケルセン(ジコホル) | C14H9Cl5O | -0.950932 | -9.876399 | 5.4137 | 4.4627 |
30 | ジエチルスチルベストロール(DES) | C18H20O2 | -0.969603 | -11.987018 | 6.4783 | 5.5087 |
31 | 2,4-ジクロロフェノール | C6H4Cl2O | -0.001675 | -9.848430 | 4.9251 | 4.9234 |
32 | 1,2-ジブロモ-3-クロロプロパン(DBCP) | C3H5Br2Cl | 23.790142 | -10.389223 | -6.7005 | 17.0897 |
33 | シペルメトリン | C22H19Cl2NO3 | -1.078926 | -9.829520 | 5.4542 | 4.3753 |
34 | シマジン(CAT) | C7H12ClN5 | 2.268547 | -10.173955 | 3.9527 | 6.2213 |
35 | スチレンダイマー(1) | C16H16 | -3.587450 | -13.981806 | 8.7846 | 5.1972 |
36 | スチレンダイマー(2) | C16H16 | -0.986547 | -13.786997 | 7.3868 | 6.4002 |
37 | スチレントリマー(1) | C24H24 | -3.207032 | -13.883227 | 8.5451 | 5.3381 |
38 | スチレントリマー(2) | C24H24 | -0.982859 | -13.538755 | 7.2608 | 6.2779 |
39 | ディルドリン | C12H8Cl6O | 4.844423 | -6.942070 | 1.0488 | 5.8932 |
40 | トキサフェン[混合物の一例] | C10H8Cl8 | 5.125061 | -6.882418 | 0.8787 | 6.0037 |
41 | トリフルラリン | C13H16F3N3O4 | -1.122222 | -8.533397 | 4.8278 | 3.7056 |
42 | p-ニトロトルエン | C7H7NO2 | -3.317159 | -12.141501 | 7.7293 | 4.4122 |
43 | ニトロフェン(NIP) | C12H7Cl2NO3 | -2.874594 | -10.207615 | 6.5411 | 3.6665 |
44 | ノナクロル[trans-体] | C10H5Cl9 | 5.108548 | -6.897455 | 0.8945 | 6.0030 |
45 | p-ノニルフェノール | C15H24O | -0.955558 | -12.269008 | 6.6123 | 5.6567 |
46 | ビスフェノールA | C15H16O2 | -1.142538 | -11.912727 | 6.5276 | 5.3851 |
47 | ビンクロゾリン | C12H9Cl2NO3 | -0.773250 | -11.128078 | 5.9507 | 5.1774 |
48 | フェンバレレート[光学異性体混合物の一例] | C25H22ClNO3 | -1.064730 | -10.962019 | 6.0134 | 4.9486 |
49 | フタル酸ジエチル | C12H14O4 | -4.973877 | -10.110638 | 7.5423 | 2.5684 |
50 | フタル酸ジエチルヘキシル | C24H38O4 | -2.208456 | -12.017451 | 7.1130 | 4.9045 |
51 | フタル酸ジシクロヘキシル | C20H26O4 | -1.231525 | -11.884064 | 6.5578 | 5.3263 |
52 | フタル酸ジブチル | C16H22O4 | -4.973800 | -10.093364 | 7.5336 | 2.5598 |
53 | フタル酸ジプロピル | C14H18O4 | -4.973159 | -10.096859 | 7.5350 | 2.5619 |
54 | フタル酸ジヘキシル | C20H30O4 | -4.974148 | -10.092127 | 7.5331 | 2.5590 |
55 | フタル酸ジペンチル | C18H26O4 | -4.973283 | -10.088817 | 7.5311 | 2.5578 |
56 | フタル酸ブチルベンジル | C19H20O4 | -2.462791 | -12.055058 | 7.2589 | 4.7961 |
57 | ブチルベンゼン | C10H14 | -0.971553 | -15.058264 | 8.0149 | 7.0434 |
58 | ヘキサクロロベンゼン | C6Cl6 | 3.422564 | -8.343784 | 2.4606 | 5.8832 |
59 | ベノミル | C14H18N4O3 | -1.331789 | -11.217517 | 6.2747 | 4.9429 |
60 | ヘプタクロル | C10H5Cl7 | 0.922963 | -6.937220 | 3.0071 | 3.9301 |
61 | ヘプタクロルエポキサイド[ヘプタクロルの代謝物] | C10H5Cl7O | 5.047607 | -6.735990 | 0.8442 | 5.8918 |
62 | ペルメトリン | C21H20Cl2O3 | -1.074227 | -9.809082 | 5.4417 | 4.3674 |
63 | ベンゾ[a]ピレン | C20H12 | -5.796633 | -12.340734 | 9.0687 | 3.2721 |
64 | ベンゾフェノン | C13H10O | -4.347168 | -11.244863 | 7.7960 | 3.4488 |
65 | ペンタクロロフェノール(PCP) | C6HCl5O | 3.057780 | -8.403147 | 2.6727 | 5.7305 |
66 | ポリ臭化ビフェニル[4Brの一例] | C12H6Br4 | -2.111357 | -4.970194 | 3.5408 | 1.4294 |
67 | ポリ塩化ビフェニル[4Clの一例] | C12H6Cl4 | -1.733510 | -9.404026 | 5.5688 | 3.8353 |
68 | マイレックス | C10Cl12 | 20.747903 | -7.127070 | -6.8104 | 13.9375 |
69 | マラチオン(マラソン) | C10H19O6PS2 | -0.047756 | -9.351999 | 4.6999 | 4.6521 |
70 | メソミル | C5H10N2O2S | 2.608965 | -8.901904 | 3.1465 | 5.7554 |
71 | メトキシクロル(メトキシクロール) | C16H15Cl3O2 | -0.910343 | -10.059320 | 5.4848 | 4.5745 |
72 | メトリブジン | C8H14N4OS | -0.107116 | -6.038726 | 3.0729 | 2.9658 |
73 | リンダン(リンデン,γ-BHC) | C6H6Cl6 | 27.854347 | -8.308129 | -9.7731 | 18.0812 |
74 | 17β-エストラジオール[女性ホルモン] | C18H24O2 | -0.691187 | -12.163062 | 6.4271 | 5.7359 |
75 | テストステロン[男性ホルモン] | C19H28O2 | -3.873268 | -11.487181 | 7.6802 | 3.8070 |
(以下追加) 76 |
トルクロホスメチル | C9H11Cl2O3PS | 1.083902 | -10.126539 | 4.5213 | 5.6052 |
77 | チウラム | C6H12N2S4 | 4.441623 | 1.638234 | -3.0399 | 1.4017 |
78 | リニュロン | C9H10Cl2N2O2 | 0.016567 | -8.960674 | 4.4721 | 4.4886 |
79 | レゾルシン(レソルシノール) | C6H6O2 | -0.356111 | -12.330155 | 6.3431 | 5.9870 |
80 | 3,4-ジクロロアニリン | C6H5Cl2N | 0.153944 | -8.926895 | 4.3865 | 4.5404 |
81 | 1,2,3,7,8-ペンタブロモベンゾフラン | C12H3Br5O | -1.269670 | -4.759038 | 3.0144 | 1.7447 |
[注] 追加したトルクロホスメチル(No.76)はトピック1,チウラム,リニュロン,レゾルシン,3,4-ジクロロアニリン,1,2,3,7,8-ペンタブロモベンゾフラン(No.77-81)はトピック2を参照.これらは図2〜4には含まれていない.
図2 環境ホルモン関連分子のη-χダイアグラム(右は部分拡大).小林らは,毒性はχよりもηに強く依存し,ηが小さいほど(ソフトであるほど)毒性が強いとしている.なお,上図のη,χ値はあくまで市販ソフトウェアで求めたものであり,小林らの報告と異なることに注意する必要がある(補足1参照).
図3 3次元グラフで見たχ,ηとDipole Moment(双極子モーメント;数値はこちらの表).
図4 χ-η平面上に示したLog P値.Log PはSciQSARによる計算によるもので,別データと詳細も掲載している.
【補足1】
【補足2】
なお,分子の立体構造と生物活性について分子化学計算によって厳密に研究した例としては,以下の論文がある.
さらに,各分子が生体内でレセプター分子との相互作用によって分子のエネルギー状態が変化することにも留意する必要があり,その点は上記小林らの一連の論文等でも詳述されている.
【補足3】
図5 本ページのデータと小林らのオリジナル報告のη-χ値との比較.
◎小林茂樹・田中彰・鮫島圭一郎,『環境ホルモンの電子構造はその毒性や生物活性の発現にどのような相関性を持つのであろうか? −ハードネス概念の生物学への応用−』,化学と工業,52(1),42(1999)
環境ホルモン分子の中でも構造の簡単なオクタクロロスチレンを例にとって,その立体構造の違いが分子計算結果に及ぼす影響について詳述したのが“環境ホルモンとして疑われている化合物の分子情報 (3)”である.
また,ChemscapeChimeによって表示可能な分子情報についても,例えば以下の2,3,7,8-TCDDの構造の違いで分子の特性が異なってしまう例により,ある程度理解することができる.
◎TCDDとOCDD(本ページ内の資料)
◎中馬寛 ほか,「ピレスロイド系殺虫化合物の大規模並列配座解析と構造類似性の評価」,Journal of Chemical Software,4(4),1998
以下は参考図で,17β-エストラジオール受容体の一例である.
図6 17β-エストラジオール受容体の例;Estrogen Receptor Alpha Ligand-Binding Domain Complexed To Estradiol(PDBの元データ1a52).
旧図はこちら(Human Estrogen Receptor Ligand-Binding Domain In Complex With 17beta-Estradiol;元データ1ere).
計算化学については,以下の資料や掲載リンクを参照されたい.
◎計算化学演習(本ページ内の資料)