◆ 亜鉛フィンガー(ジンクフィンガー,Zn finger)例 ◆
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金属原子を含む生体分子のSITEデータ集
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1a1t_ZN(ウイルスタンパク質/RNA,Znフィンガー)
I'/O'=0.8154
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
1hcq_ZN(転写/DNA,Znフィンガー)
I'/O'=0.3333
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
1joc_ZN(膜タンパク質,Znフィンガー)
I'/O'=0.3333
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
2hgh_ZN(転写/DNA,Znフィンガー)
I'/O'=1.2286
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
2wbs_ZN(Klf4〈
iPS細胞関連
〉,Znフィンガー)
I'/O'=1.2286
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
= 以下の表示は
アミノ酸の親水性・疎水性
参照 =
●
酸性
・
中性
〈
芳香族
〉・
塩基性
アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU
GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET
PHE TYR TRP
LYS ARG HIS
●有機概念図I/O値順(特性基 R)
ASN SER
ASP GLN
GLU THR
ARG HIS
GLY
LYS TYR TRP
CYS MET
PRO PHE
ALA VAL LEU ILE
【参考】Zn関連ページ
桜井弘 編,「生命元素事典」,pp.230-234,オーム社(2006)
PDBj - 今月の分子(Molecule of the Month)- 087:ジンクフィンガー
|
Zinc Fingers(RCSB PDB)
ジンクフィンガー - Wikipedia
|
Zinc finger
Library of Inorgainc Structures - Zn(Chemistry, Structures & 3D Molecules @ 3Dchem.com)
参考
Znフィンガーを含むがん抑制遺伝子p53の部分構造例(PDB
1TUP
のDNAとChain B)。
※左図(
DNAの脆弱性と強靭性
に掲載,Chime版で作成)の右側がZnフィンガー部分:Zn,Cys176,His179,Cys238,Cys242。
※右図は
ブログ記事
参照。
「生活環境化学の部屋」ホームページ
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Jmol版「分子の学習帳」
|
Chime版「分子の学習帳」