サッカーボール型分子として連載第1回で紹介したフラーレンがすっかり有名になりましたが,タンパク質が集合してサッカーボール型の構造体になったのがクラスリン(clathrin)です。この話題は,2004/08/29の高エネルギー加速器研究機構(KEK)の一般公開で催された,若槻壮市さんによる講演「放射光で探るタンパク質のライフサイクル」の中で取り上げられたものです。そこで紹介されたアニメーションも以下で参照できます。
なお,分子モデルはα-炭素原子だけですので,二次構造表示などはできません。
※Googleイメージ検索による“clathrin”検索結果例
◎若槻壮市(高エネルギー加速器研究機構物質構造科学研究所),『輸送系の構造生物学』 〈PDF〉
◎若槻壮市,『タンパク質の成熟:糖鎖修飾と輸送』(田之倉優 編,「タンパク質のかたちから生命のなぞを解く」,クバプロ 2005)
◎Clathrin Protein (Movie by Allison Bruce)
◎クラスリン格子:膜輸送の重要な成分 (Nature,2004/12/02号)
◎Clathrin - Molecule of the Month(PDB,2007/04)
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※amino表示の凡例 ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO = 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 = ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS ※極性〈酸性・塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別 SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP ※hydropathy index順 ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE ※log P値順 ARG ASP ASN GLU GLN HIS GLY SER LYS THR ALA PRO CYS VAL TYR MET ILE LEU PHE TRP ※有機概念図I/O値順(特性基 R) ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE ※同上(アミノ酸) GLY SER ASN ASP GLN THR GLU ALA ARG HIS VAL LYS CYS PRO LEU TYR ILE MET TRP PHE |
1XI4の全体構造(A〜IがHeavy Chain,j〜rがLight Chain)
KEK入口のモニュメント