= 田辺・松本によるニューラルネットワークを用いた発がん性予測研究と有機概念図から =
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化学ソフトウェア学会と日本化学プログラム交換機構(JCPE)が合併して,日本コンピュータ化学会(SCCJ)が2002年に誕生した。
2002/03/15にはその論文誌The Journal of Computer Chemistry, Japan第1号が発刊され,化学ソフトウェア学会論文誌と同様,Web上で全文が公開されている(HTML形式,PDF形式)。
ここでは,同号に掲載された以下の論文に掲載されている,有機塩素化合物の発がん性予測に用いられたlog P(オクタノール/水系分配係数)の値等について,有機概念図を用いた計算結果と比較した結果を紹介する。
本研究室では,有機化合物の性質を簡便に予測できる有機概念図について,表計算ソフトウェアExcelで利用できるスプレッドシートを公開しているほか,いろいろな応用を試みている。特に,定量的構造活性相関(QSAR)で用いられる主因子であるlog Pの推算ができることから,環境ホルモンとして疑われている化合物についての適用(別版)などを行っている。
上掲の論文で取り上げられている有機塩素化合物の中には,環境ホルモンとして疑われているものもあり,有機概念図で計算したところ以下のような結果が得られた。
また,文献[1]のニューラルネットワーク解析で用いられた記述子はlog P以外に,Gibbs標準生成自由エネルギー,イオン化ポテンシャル,LUMOエネルギー,HOMO-LUMOのエネルギー差,Connolly体積,分子量である。このうち,HOMO-LUMOのエネルギー差と関連する分子の化学的ハードネスについては,やはり環境ホルモン関連化合物について計算した例を参照されたい。
No. | Molecular Name ※クリックで別窓にChime分子表示 (Chime版のため現在の多くの環境ではご覧いただけません) |
CAS No. ※クリックで別窓にChemFinder情報表示 |
Molecular Formula | I | O | LogP | Output | Carcinogenicity | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Pred | Exp | ||||||||
1 | Aldrin | 309-00-2 | C12H8Cl6 | 104 | 480 | 3.5 | 0.9997 | + | + |
2 | Allyl chloride | 107-05-1 | C3H5Cl | 12 | 100 | 1.63 | 1 | + | + |
3 | Benzyl chloride | 100-44-7 | C7H7Cl | 25 | 180 | 2.59 | 0.9874 | + | + |
4 | Carbon tetrachloride | 56-23-5 | CCl4 | 40 | 180 | 2.43 | 0.9989 | + | + |
5 | Chlordane 〈trans -体,cis -体〉 | 12789-03-6(γ) 57-74-9(α・γ isomers) |
C10H6Cl8 | 112 | 520 | 4.2 | 0.9997 | + | + |
6 | 9-Chloro-10-chloromethyl-anthracene | C15H10Cl2 | 125 | 380 | 5.23 | 0.9997 | + | + | |
7 | Chloroethane | 75-00-3 | C2H5Cl | 10 | 80 | 1.3 | 1 | + | + |
8 | Chloroform | 67-66-3 | CHCl3 | 30 | 140 | 1.71 | 0.9908 | + | + |
9 | 7-(Chloromethyl)benz[a]anthracene 《原報では7-(Chloromethyl)benza(a)-anthracene》 |
C19H13Cl | 130 | 420 | 5.7 | 0.9997 | + | + | |
10 | 9-Chloromethyl-10-methyl-anthracene | C16H13Cl | 115 | 360 | 5.12 | 0.9997 | + | + | |
11 | 3-Chloro-2-methylpropene | 563-47-3 | C4H7Cl | 12 | 120 | 1.73 | 0.9981 | + | + |
12 | p,p' -DDD | 72-54-8 | C14H10Cl4 | 70 | 440 | 5.77 | 0.9708 | + | + |
13 | p,p' -DDE | 72-55-9 | C14H8Cl4 | 72 | 440 | 5.81 | 0.9997 | + | + |
14 | 1,4-Dichlorobenzene | 106-46-7 | C6H4Cl2 | 35 | 200 | 3.11 | 0 | - | + |
15 | 1,2-Dichloroethane | 107-06-2 | C2H4Cl2 | 20 | 120 | 1.59 | 0.9991 | + | + |
16 | Dichloromethane | 75-09-2 | CH2Cl2 | 20 | 100 | 1.08 | 0.8398 | + | + |
17 | 1,2-Dichloropropane | 78-87-5 | C3H6Cl2 | 20 | 140 | 2 | 0.9432 | + | + |
18 | 1,3-Dichloropropane | 142-28-9 | C3H6Cl2 | 20 | 140 | 1.8 | 0.908 | + | + |
19 | Heptachlor | 76-44-8 | C10H5Cl7 | 104 | 480 | 3.59 | 0.9997 | + | + |
20 | Hexachlorobenzene | 118-74-1 | C6Cl6 | 75 | 360 | 5.37 | 0.2534 | - | + |
21 | Hexachloroethane | 67-72-1 | C2Cl6 | 60 | 280 | 3.21 | 1 | + | + |
22 | Methylallyl chloride | 513-37-1 | C4H7Cl | 12 | 120 | 2 | 0.9924 | + | + |
23 | Mirex | 2385-85-5 | C10Cl12 | 180 | 680 | 6.33 | 0.9996 | + | + |
24 | Pentachloroethane | 76-01-7 | C2HCl5 | 50 | 240 | 2.71 | 1 | + | + |
25 | 1,1,1,2-Tetrachloroethane | 630-20-6 | C2H2Cl4 | 40 | 200 | 2.4 | 0.9996 | + | + |
26 | 1,1,2,2-Tetrachloroethane | 79-34-5 | C2H2Cl4 | 40 | 200 | 2.22 | 1 | + | + |
27 | Tetrachloroethylene | 127-18-4 | C2Cl4 | 42 | 200 | 2.42 | 1 | + | + |
28 | 1,1,2-Trichloroethane | 79-00-5 | C2H3Cl3 | 30 | 160 | 1.9 | 0.993 | + | + |
29 | Trichloroethylene | 79-01-6 | C2HCl3 | 32 | 160 | 2.25 | 0.9963 | + | + |
30 | 1,2,3-Trichloropropane | 96-18-4 | C3H5Cl3 | 30 | 180 | 2.29 | 0.9979 | + | + |
31 | Vinyl chloride | 75-01-4 | C2H3Cl | 12 | 80 | 1.66 | 0.7704 | + | + |
32 | Chlorobenzene | 108-90-7 | C6H5Cl | 25 | 160 | 2.54 | 0.1442 | - | - |
33 | 1-Chlorobutane | 109-69-3 | C4H9Cl | 10 | 120 | 2.2 | 0.8568 | + | - |
34 | DDT 〈p,p' -DDT,o,p' -DDT〉 | 50-29-3(p,p' -DDT) 789-02-6(o,p' -DDT) |
C14H9Cl5 | 80 | 480 | 6.33 | 0 | - | - |
35 | 1,2-Dichlorobenzene | 95-50-1 | C6H4Cl2 | 35 | 200 | 3.11 | 0 | - | - |
36 | 1,1-Dichloroethane | 75-34-3 | C2H4Cl2 | 20 | 120 | 1.43 | 0.1897 | - | - |
37 | Hexachlorocyclopentadiene | 77-47-4 | C5Cl6 | 74 | 340 | 2.02 | 0 | - | - |
38 | Lindane | 58-89-9 | C6H6Cl6 | 70 | 360 | 4.2 | 0.0186 | - | - |
39 | Pentachlorobenzene | 608-93-5 | C6HCl5 | 65 | 320 | 4.81 | 0.0987 | - | - |
40 | 1,1,1-Trichloroethane | 71-55-6 | C2H3Cl3 | 30 | 160 | 2.1 | 0.0041 | - | - |
41 | Vinylidene chloride | 75-35-4 | C2H2Cl2 | 22 | 120 | 1.83 | 0.1498 | - | - |
図1 文献[1]のlog Pと,有機概念図のI・Oとの重回帰分析から求めた相関式から算出したlog Pとの比較.
相関式: 0.0087255俳 + 0.0016071琶 + 0.78794 [r2=0.765928,r=0.875173]
※参考…環境ホルモン関連化合物における有機概念図の有機性・無機性値とlog P の関係(別資料)
図2 文献[1]で用いられた有機塩素化合物の有機概念図上における分布.
※参考…環境ホルモン関連化合物の有機概念図(がん原化合物領域図示)