◆ コカインを含む生体分子のSITE例 ◆
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PDBsumのLigand-SITE情報と有機性・無機性
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※コカイン(cocaine): I/O = 0.662
1i7z_COC(Immune system)
I'/O' = 1.252
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
1q72_COC(Immune system)
I'/O' = 1.087
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
2ajv_COC(Immune system)
I'/O' = 0.687
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
2pgz_COC(Acetylcholine-binding protein)
I'/O' = 0.848
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
4xp4_COC(Dopamine transporter)
I'/O' = 0.921
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
9eo4_COC(Dopamine transporter)
I'/O' = 0.922
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
Nature論文(2024/08/07)
[NEW!]
= 以下の表示は
アミノ酸の親水性・疎水性
参照 =
●
酸性
・
中性
〈
芳香族
〉・
塩基性
アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU
GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET
PHE TYR TRP
LYS ARG HIS
●有機概念図I/O値順(特性基 R)
ASN SER
ASP GLN
GLU THR
ARG HIS
GLY
LYS TYR TRP
CYS MET
PRO PHE
ALA VAL LEU ILE
左から何れもコカインが結合したPDB 1I7Z(免疫システム),2PGZ(アセチルコリン結合タンパク質),4XP4・9EO4(ドパミン〈ドーパミン〉輸送体)のPDBsumデータより
コカイン(cocaine)の受容体との結合
【参考文献】
山川ほか「メディシナルケミストリー 第5版」(講談社)
,p.136
【参考】
コカイン - Wikipedia
本間善夫・川端 潤,「パソコンで見る 動く分子事典」,p.214,講談社ブルーバックス(2007)
分子と分子の相互作用(本サイト)
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新規指定または指定予定の麻薬
「生活環境化学の部屋」ホームページ
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Jmol版「分子の学習帳」
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Chime版「分子の学習帳」