◆ 今週の分子 ◆
★連載57（2004/05/26〜）：PCBの代謝酵素例（PDBデータ1LKD）

　ダイオキシンなど有害な化学物質を微生物の力を借りて分解してしまおうというのがバイオレメディエーションです。今回はPCBを生分解してくれる酵素群の中の一例を取り上げました。

◎PCBの生分解反応（バイオレメディエーション）
◎千田俊哉・福田雅夫，『PCB分解酵素系の構造プロテオミクス』
…以下に収録：大島泰郎・西村善文・横山茂之・中村春木 編，「構造プロテオミクス −蛋白質ネットワークの構造生物学−」，共立出版(2003)
※参考：千田俊哉・N.Nandhagopal・杉本敬佑，『ビフェニル/PCB分解代謝系の酵素群に関する立体構造的研究』
※参考：バイオレメディエーション事例紹介B-1／PCB（環境バイオネット）


PCBの代謝酵素例1lkd
Backbone Termini 2nd Structure
Ligands表示 OFF
Water表示 OFF

Protein選択
Ligand選択 Water選択 全選択
 空間充填 球棒 スティック OFF
CPK amino ｜ ラベル表示 OFF
酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
hydropathy index順（Protein）
log P値順（Protein）
有機概念図I/O値順（Protein特性基 R）| 同（アミノ酸）
Dot Surface表示 OFF
Specular OFF ｜ 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF
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※amino表示の凡例
ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR
ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO
＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝
※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR
ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS
※極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG
HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP
※hydropathy index順
ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP
SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE
※log P値順
ARG　ASP　ASN　GLU　GLN　HIS　GLY　SER　LYS　THR
ALA　PRO　CYS　VAL　TYR　MET　ILE　LEU　PHE　TRP
※有機概念図I/O値順（特性基 R）
ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS
TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE
※同上（アミノ酸）
GLY　SER　ASN　ASP　GLN　THR　GLU　ALA　ARG　HIS
VAL　LYS　CYS　PRO　LEU　TYR　ILE　MET　TRP　PHE


ビフェニルの代謝酵素BphCおよびPCBの代謝酵素の活性中心

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