◆ バイオレメディエーションとファイトレメディエーション(Jmol版) ◆ → Chime版 ← ※解説にジャンプ: バイオレメディエーション | ファイトレメディエーション ※初期表示は1lkd
| ■表1 図1の分子モデルとダイオキシン類に含まれるPCB |
| ●ビフェニルの代謝反応生成物(図1) |
| ビフェニル I |
| ビフェニル-2,3-ジヒドロジオール II |
| 2,3-ジヒドロキシビフェニル(DHBP) III |
| 2-ヒドロキシ-6-オキソ-6-フェニルヘキサ-2,4-ジエノエート(HPDA) IV |
| 安息香酸 + 2-ヒドロキシペンタ-2,4-ジエノエート V |
| ●PCB |
| 分類・同族体名 |
WHO-TEF〔ヒト・ほ乳類〕 |
| ◆PCBs(Non-ortho) |
|
| 3,4,4',5-TCB(81) |
0.0001 a,b,c,e |
| 3,3',4,4'-TCB(77) |
0.0001 |
| 3,3',4,4',5-PeCB(126) |
0.1 |
| 3,3',4,4',5,5'-HxCB(169) |
0.01 |
| ◆PCBs(Mono-ortho) |
|
| 2,3,3',4,4'-PeCB(105) |
0.0001 |
| 2,3,4,4',5-PeCB(114) |
0.0005 a,b,c,d |
| 2,3',4,4',5-PeCB(118) |
0.0001 |
| 2',3,4,4',5-PeCB(123) |
0.0001 a,c,d |
| 2,3,3',4,4',5-HxCB(156) |
0.0005 b,c |
| 2,3,3',4,4',5'-HxCB(157) |
0.0005 b,c,d |
| 2,3',4,4',5,5'-HxCB(167) |
0.00001 a,d |
| 2,3,3',4,4',5,5'-HpCB(189) |
0.0001 a,c |
| ◆参考:DecaPCB |
|
| DecaCB |
− |
■表2 ビフェニルおよびPCBの代謝酵素例 ※2xrx,2xshのリガンド-SITE部分はPDBsumのLigand-SITE情報にも掲載(鉄硫黄クラスターも参) |
| 全体表示 |
活性部位選択 | 活性部位のみ または リガンド-SITE部分 |
| 1d7y BphA4 |
− | − |
| 1bdb BphB |
− | − |
| 1kw8 BphC(NOあり) |
| |
1kw9 BphC(NOなし) |
| |
| 1c4x BphD |
− | − |
| 1lgt(2'-Cl dihydroxybiphenyl) |
| |
| 1lkd(2',6'-diCl dihydroxybiphenyl) |
| |
2xrxのA-F鎖 ビフェニルジオキシゲナーゼ (biphenyl) |
− |
(PDBsumより) |
2xshのA-F鎖 ビフェニルジオキシゲナーゼ (2,6-dichlorobiphenyl) |
− |
(PDBsumより) |
| ■表3 メタロチオネインのデータ1dmd |
| ●1dmd(NMR, 18 Structures)から作成 ●がCd 〈空間充填 〉,●はCysの硫黄 |
| Model 1 | Model 2 | Model 3 | Model 4 |
| Model 5 | Model 6 | Model 7 | Model 8 |
| Model 9 | Model 10 | Model 11 | Model 12 |
| Model 13 | Model 14 | Model 15 | Model 16 |
| Model 17 | Model 18 |
| Model〜18のアニメーション → アニメーション OFF |
| ■表4 その他の参考データ |
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3f0p(有機水銀分解酵素〈アルキル水銀リアーゼ,EC.4.99.1.2〉MerBの例) | PDBsumデータ 3f0p_HG(Hg追加)$
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