アミノ酸および特性基の親水性・疎水性とコンホメーション選択性
→ 簡略版（コンホメーション選択性除く） ｜ 別版（特性基 R のI/O値順） ‖ PDB部分データリスト／別版 ←
※1文字アミノ酸記号の欄の色はamino色（Jmol，RasMol共通）

アミノ酸			分子式	CAS番号	疎水性 インデックス	log P	酸性・塩基性	極性・非極性	等電点	コンホメーション 選択性
Arg	R	アルギニン	H2N(=NH)NHC3H6CCH(NH2)COOH	74-79-3	-4.5	-4.20	塩基性	極性（塩基性）	10.76	α
Lys	K	リシン	H2N(CH2)4CH(NH2)COOH	56-87-1	-3.9	-3.05	塩基性	極性（塩基性）	9.74	α
Asp	D	アスパラギン酸	HOOCCH2CH(NH2)COOH	56-84-8	-3.5	-3.89	酸性	極性（酸性）	2.77	−
Asn	N	アスパラギン	H2NCOCH2CH(NH2)COOH	70-47-3	-3.5	-3.82	中性	極性（中性）	5.41	−
Glu	E	グルタミン酸	HOOCCH2CH2CH(NH2)COOH	56-86-0	-3.5	-3.69	酸性	極性（酸性）	3.22	α
Gln	Q	グルタミン	H2NCO-CH2CH2CH(NH2)COOH	56-85-9	-3.5	-3.64	中性	極性（中性）	5.65	α
His	H	ヒスチジン	H2NCH[CH2(C3H3N2)]COOH	71-00-1	-3.2	-3.32	塩基性	極性（塩基性）	7.59	α
Pro	P	プロリン	(C4H8N)-COOH	147-85-3	-1.6	-2.54	中性	非極性（疎水性）	6.30	−
Tyr	Y	チロシン	HO(C6H4)CH2CH(NH2)COOH	60-18-4	-1.3	-2.26	中性	極性（中性）	5.66	β
Trp	W	トリプトファン	(C8H6N)-CH2CH(NH2)COOH	73-22-3	-0.9	-1.05	中性	非極性（疎水性）	5.89	β
Ser	S	セリン	HOCH2CH(NH2)COOH	56-45-1	-0.8	-3.07	中性	極性（中性）	5.68	−
Thr	T	トレオニン	CH3CH(OH)CH(NH2)COOH	72-19-5	-0.7	-2.94	中性	極性（中性）	6.16	β
Gly	G	グリシン	H2NCH2COOH	56-40-6	-0.4	-3.21	中性	非極性（疎水性）	5.97	−
Ala	A	アラニン	CH3CH(NH2)COOH	56-41-7	1.8	-2.85	中性	非極性（疎水性）	6.00	α
Met	M	メチオニン	CH3SCH2CH2CH(NH2)COOH	63-68-3	1.9	-1.87	中性	非極性（疎水性）	5.74	α
Cys	C	システイン	HSCH2CH(NH2)COOH	52-90-4	2.5	-2.49	中性	極性（中性）	5.07	β
Phe	F	フェニルアラニン	(C6H5)CH2CH(NH2)COOH	63-91-2	2.8	-1.38	中性	非極性（疎水性）	5.48	β
Leu	L	ロイシン	(CH3)2CHCH2CH(NH2)COOH	61-90-5	3.8	-1.52	中性	非極性（疎水性）	5.98	α
Val	V	バリン	(CH3)2CHCH(NH2)COOH	72-18-4	4.2	-2.26	中性	非極性（疎水性）	5.96	β
Ile	I	イソロイシン	C2H5CH(CH3)CH(NH2)COOH	73-32-5	4.5	-1.70	中性	非極性（疎水性）	6.02	β

※hydropathy indexは以下を参照；Kyte and Doolittle, J. Mol. Biol., 157, 105-132(1982)
※log PはOn-Line Log P Calculation掲載の実験値
※極性・非極性はChimeのProtein選択様式と関連（参考ページ）
※アミノ酸のコンホメーション選択性は以下による；From Sequence to Structure [PDF]，p.18
《参考》分子と分子の相互作用（QSARと有機概念図から）〔特性基RのI・O値を用いた計算例：1ereのSITE表示と有機概念図計算〕
《参考》１文字アミノ酸配列から各種HTMLデータを作成する秀丸マクロ

疎水性インデックス（hydropathy index）のグラフ

参考：アミノ酸および特性基の親水性・疎水性（特性基 R のI/O値順）
→ 有機概念図簡易計算機 ←

アミノ酸			特性基 R			hydropathy index	極性%	log P	酸性・塩基性	極性・非極性	Cleftの分類	等電点	必須・非必須 （ヒト）
			O	I	I/O
Ile	I	イソロイシン	80	0	0	4.5	5.2	-1.70	中性	非極性（疎水性）	Aliphatic	6.02	必須
Leu	L	ロイシン	70	0	0	3.8	4.9	-1.52	中性	非極性（疎水性）	Aliphatic	5.98	必須
Val	V	バリン	50	0	0	4.2	5.9	-2.26	中性	非極性（疎水性）	Aliphatic	5.96	必須
Ala	A	アラニン	20	0	0	1.8	8.1	-2.85	中性	非極性（疎水性）	Aliphatic	6.00	非必須
Phe	F	フェニルアラニン	140	15	0.107	2.8	5.2	-1.38	中性	非極性（疎水性）	Aromatic	5.48	必須
Pro	P	プロリン	60	10	0.167	-1.6	8.0	-2.54	中性	非極性（疎水性）	Pro & Gly	6.30	非必須
Met	M	メチオニン	100	20	0.200	1.9	5.7	-1.87	中性	非極性（疎水性）	Aliphatic	5.74	必須
Cys	C	システイン	60	20	0.333	2.5	5.5	-2.49	中性	極性（中性）	Cysteine	5.07	非必須
Trp	W	トリプトファン	180	130	0.722	-0.9	5.4	-1.05	中性	非極性（疎水性）	Aromatic	5.89	必須
Tyr	Y	チロシン	140	115	0.821	-1.3	6.2	-2.26	中性	極性（中性）	Aromatic	5.66	非必須
Lys	K	リシン	80	70	0.875	-3.9	11.3	-3.05	塩基性	極性（塩基性）	Positive	9.74	必須
Gly	G	グリシン	0	0	−	-0.4	9.0	-3.21	中性	非極性（疎水性）	Pro & Gly	5.97	非必須
His	H	ヒスチジン	80	152	1.900	-3.2	10.4	-3.32	塩基性	極性（塩基性）	Positive	7.59	必須
Arg	R	アルギニン	80	190	2.375	-4.5	10.5	-4.20	塩基性	極性（塩基性）	Positive	10.76	準必須
Thr	T	トレオニン	40	100	2.500	-0.7	8.6	-2.94	中性	極性（中性）	Neutral	6.16	必須
Glu	E	グルタミン酸	60	150	2.500	-3.5	12.3	-3.69	酸性	極性（酸性）	Negative	3.22	非必須
Gln	Q	グルタミン	60	200	3.333	-3.5	10.5	-3.64	中性	極性（中性）	Neutral	5.65	非必須
Asp	D	アスパラギン酸	40	150	3.750	-3.5	13.0	-3.89	酸性	極性（酸性）	Negative	2.77	非必須
Ser	S	セリン	20	100	5.000	-0.8	9.2	-3.07	中性	極性（中性）	Neutral	5.68	非必須
Asn	N	アスパラギン	40	200	5.000	-3.5	11.6	-3.82	中性	極性（中性）	Neutral	5.41	非必須

% 宮田隆，「分子からみた生物進化　DNAが明かす生物の歴史」，p.89，講談社ブルーバックス(2014) より。

  
有機概念図のI/O値順に並べたアミノ酸（有機概念図簡易計算機，Log Pをポケットに！参照）

アミノ酸残基の極性%とI'/O'値の比較（マークの色はI'/O'値順；Glyを除く）

ヒトの必須・準必須（色やや薄目）・非必須（色薄目）アミノ酸の区別

【参考】20種のアミノ酸をI/O値順に結合させたポリペプチドのα-ヘリックス構造
H-IleLeuValAlaPheProMetCysTrpTyrLysGlyHisArgThrGluGlnAspSerAsn-OH

1文字アミノ酸配列： ILVAFPMCWYKGHRTEQDSN ※一部正しくない水素結合も表示されます。

バックボーン　二次構造 空間充填　球棒　球80％　スティック　針金 アミノ色　Chain色　CPK色　‖　Jmol色　Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド）# ヒトの必須・非必須区別 ノーベル化学賞2024受賞情報着色 水素結合表示 　 　 背景・黒　灰　白　紺 ※amino表示の凡例 ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO ＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝ ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS ※極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別 SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP ※疎水性インデックス順 ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE ※有機概念図I/O値順（特性基 R） ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE ※等電点順 ASP　GLU　CYS　ASN　PHE　GLN　TYR　SER　MET　TRP VAL　GLY　LEU　ALA　ILE　THR　PRO　HIS　LYS　ARG ※ヒトの必須・非必須区別 ILE　LEU　VAL　PHE　MET　TRP　LYS　HIS　THR　ARG ALA　PRO　CYS　TYR　GLY　GLU　GLN　ASP　SER　ASN ※ノーベル化学賞2024受賞情報関連 （Popular information - NobelPrize.org掲載図より） LYS　LEU　ILE　HIS　PHE　ARG　TYR　SER　PRO　GLY GLU　GLN　CYS　ASP　ASN　ALA　VAL　TRP　THR　MET # アミノ酸のコンホメーション選択性参照。

アミノ酸残基のhydropathy indexとI'/O'値の比較（Glyを除く）

芳香族アミノ酸（Phe，Tyr，Trp）；上表の酸性・中性・塩基性区別表示における中性のうち芳香族アミノ酸は黄緑色で表示される．
※参考雑誌記事：青木康展，『ベンゼンはなぜ動物には有害か ─毒性研究を広く自然界を見渡して考える』，科学，2007年9月号，pp.986-989
…p.987の「動物のフェニル基は植物に依存している」に関連して（親油ポテンシャル表示はChime版でのみ可能）；関連資料１・２

参考：What is a Protein? - YouTube　※旧版