初期表示はPDBデータ 7aai（PFOAが結合したヒト血清アルブミン）

バックボーン　二次構造 DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択　タンパク質選択　リガンド選択 DNA/RNA選択　DNA選択　DNA/RNA backbone選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金 アミノ色　Chain色　CPK色　∥　Jmol色　Rasmol色 リガンドの元素記号表示 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 S-S結合表示（太）　S原子（Protein中）空間充填 ドット表面表示　α炭素ラベル表示　回転 背景・黒　灰　白　紺

p.11ほか DDT：p,p'-DDT　o,p'-DDT p.18ほか多数 ビスフェノールA：ビスフェノールA（BPA）　→ 別トピック p.24ほか スチレン：スチレン｜ポリスチレン（繰り返し単位）　→ 代表的な高分子 p.25 ペニシリン：ペニシリンG　→ 抗生物質分子データ集 p.33ほか多数 フタル酸ジエチルヘキシル：フタル酸ジエチルヘキシル（DEHP）　→ 環境ホルモン例 p.37ほか 甲状腺ホルモン多数／p.89ほか ヨウ素／p.90 レボチロキシン：レボチロキシン（L-チロキシン；甲状腺ホルモン例）　→ 別トピック｜甲状腺ホルモンと受容体 p.40ほか 水銀／p.65 メチル水銀：塩化メチル水銀 CH3HgCl　→ 水俣病｜水銀Hgを含む生体分子のSITE例 p.45ほか アセチルコリン／p.94ほか アセチルコリンエステラーゼ：PDBsumデータ2ha4_ACH$（アセチルコリン結合アセチルコリンエステラーゼのPDBsumデータ例）　→ アセチルコリンエステラーゼのSITE比較 p.56ほか トリブチルスズ：塩化トリブチルスズ（TBTC）｜トリブチルスズオキシド（TBTO）　→ 環境ホルモン例 p.58ほか DNA：1d66のChain D・E（DNA構造例）　→ DNAとRNAのいろいろな姿 p.64 アヘン：ヘロイン（アヘンの成分例）　→ 危険ドラッグ p.65ほか アトラジン：アトラジン　→ 環境ホルモン例 p.76ほか テストステロン ：テストステロン　→ 性ホルモン - ステロイドホルモンの生合成と代謝 p.92ほか多数 ポリ塩化ビフェニル（PCB）：3,3',4,4',5-PeCB（コプラナーPCBの例）　→ ダイオキシン類 p.103 2,4-D：2,4-D　→ 環境ホルモン例 p.104ほか グリホサート／p.203 ラウンドアップ：グリホサート　→ 別トピック p.105ほか多数 ポリ臭化ジフェニルエーテル（PBDE）：BDE-209（DBDE；PBDEの例）　→ はっ水剤・難燃剤の生物体内蓄積性 p.109ほか ビスフェノールP：ビスフェノールP（BPP）　→ 別トピック p.110ほか ビスフェノールS：ビスフェノールS（BPS）　→ 別トピック p.110ほか ビスフェノールZ：ビスフェノールZ（BPZ）　→ 別トピック p.110ほか ポリカーボネートの容器：ポリカーボネートの繰り返し単位　→ 代表的な高分子 p.111ほか テフロン：テフロン（ポリテトラフルオロエチレン，繰り返し単位）　→ 代表的な高分子 p.111ほか PFOA：パーフルオロオクタンスルホン酸（PFOA）｜7aai（PFOAヒト血清アルブミン）　8PF（PFOA）選択　→ PFAS汚染問題 p.132 ペルオキシソーム増殖剤活性化受容体（PPAR）：3wj4のChain A（トリブチルスズが結合したPPARγ）　→ 別トピック p.132 ロシグリタゾン：ロシグリタゾン｜6onjのChain A（ロシグリタゾンが結合したPPARγ）　同PDBsumデータ 6onj_BRL$ p.133ほか ポリ塩化ビニル（PVC）：ポリ塩化ビニル（繰り返し単位）｜イソタクチック構造例｜シンジオタクチック構造例｜アタクチック構造例　→ 代表的な高分子 p.171 フタル酸ジブチル：フタル酸ジブチル　→ 環境ホルモン例 p.178 アンドロゲン受容体 ：2q7j（テストステロンが結合したアンドロゲン受容体）　同PDBsumデータ 2q7j_TES$　→ 性ホルモン - ステロイドホルモンの生合成と代謝 p.178 ビタミンD：ビタミンD2（エルゴカルシフェロール）｜ビタミンD3（コレカルシフェロール）｜活性型ビタミンD3（カルシトリオール）　→ 水溶性ビタミンと脂溶性ビタミン p.185ほか タモキシフェン：タモキシフェン　→ 話題の制がん剤・抗がん剤 p.190ほか トリクロサン：トリクロサン　→ 別トピック p.201ほか プロゲステロン：プロゲステロン　→ 低用量ピル p.203ほか レトロゾール：レトロゾール　→ 別トピック p.216 パラベン：p-ヒドロキシ安息香酸メチル（メチルパラベン；パラベンの例）　→ 化粧品の成分／パラベン p.216ほか ベンゾフェノン：ベンゾフェノン　→ 環境ホルモン例

    
有機概念図で見る有害化学物質と農薬

  
［左］ビスフェノールA　［右］ビスフェノールを含むPDBsumデータ例ビスフェノールを含むPDBsumデータ例　→ 別トピック

  
川上モデル｜鍵と鍵穴模型から：［左］ビスフェノールAが結合したエストロゲン受容体γ2e2rより　［右］PFAS例のPFOSを含む血清アルブミン4e99より

PFOAが結合したヒト血清アルブミン7aai　→ PFAS汚染問題

  
ロシグリタゾン（rosiglitazone）と同分子結合PPARγ6onjのChain AとそのPDBsumデータ

AZD7648が結合したDNA依存性プロテインキナーゼ触媒サブユニットDNA-PKcs 7otwとそのPDBsumデータ（リガンドがそれぞれNU7441・ATPγS・wortmannin・M3814のデータとの比較）

ミオヘムエリトリン1a7dとそのPDBsumデータ（1a7dとの比較）

フェレドキシン1vjwとそのPDBsumデータ

オリゴ糖転移酵素（オリゴサッカリルトランスフェラーゼ）複合体OST-A 6s7o

オリベトリン酸シクラーゼ（F24I変異体）7w6dのChain AとそのPDBsumデータ（7w6e，7w6f，7w6gとの比較）

参考：Δ⁹-テトラヒドロカンナビノール（Δ⁹-THC）ほか危険ドラッグ代表例

自己アルキル化リボザイム-Fab HAVx複合体6xjqのChain A・L・HとそのPDBsumデータ

Mon1-Ccz1複合体7qla；残基番号367・368・380・382・402・404・405・651・652・656・645を球表示・α炭素ラベル表示（文献Fig.4 A参照）

デスメチルグリシテインが結合したネッタイシマカ由来のNoppera-bo 7ebwのChain AとそのPDBsumデータ（7ebu，7ebvとの比較）

デスメチルグリシテイン（desmethylglycitein）

マイトジェン活性化プロテインキナーゼ1（MAPK1）7w5oとPDBsumデータ（何れもリガンドのH原子付加）

アロステリック阻害剤compound 1が結合したマイトジェン活性化プロテインキナーゼ14（p38α MAPK）8x3m
（リガンドはA・B座標重ね合わせ）とPDBsumデータ（B座標）

アロステリック阻害剤3が結合したマイトジェン活性化プロテインキナーゼ14（p38α MAPK）8yd9

F₄-TPP⁺が結合した膜タンパク質EmrE 7sfqのModel 1とそのPDBsumデータ