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「すごい分子　世界は六角形でできている」に出てくる分子名（以下に出てこないものも）・キーワードを検索!!

初期表示はベンゼン（benzene）
［Benzene - Wikipedia］

バックボーン　二次構造　DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択　タンパク質選択　リガンド選択　DNA/RNA選択　同backbone選択 空間充填　球棒　球60％　スティック　針金　消去 アミノ色　Chain色　CPK色　∥　Jmol色　Rasmol色 リガンドの元素記号表示 酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別 疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 S-S結合表示（太）　S原子（Protein中）空間充填 ドット表面表示　α炭素ラベル表示　回転 背景・黒　灰　白　紺

p.5・21ほか多数 ベンゼン：ベンゼン（benzene） p.23 トルエン：トルエン（toluene）　→ 悪臭の正体 p.23 キシレン：o-キシレン（o-xylene） ｜ m-キシレン（m-xylene） ｜ p-キシレン（p-xylene） p.24 フェノール：フェノール（phenol）　→ アルコールとフェノール p.25 フェニルアラニン／チロシン ：フェニルアラニン（phenylalanine） ｜ チロシン（tyrosine）　→ タンパク質中の20種類のアミノ酸 p.26 アドレナリン／“ベンゼン環-C-C-N”：アドレナリン（adrenaline）　→ 抗うつ剤と神経伝達物質｜「亀-C-C-N」構造をもつ脳内物質のSITE例 p.27 アスピリン（一般名 アセチルサリチル酸）：アセチルサリチル酸（acetylsalicylic acid） p.28 バニリン：バニリン（vanillin） p.29 ポリエチレンテレフタレート：ポリエチレンテレフタレート（ポリエチレンテレフタラート，polyethylene terephthalate，PET）　→ 代表的な高分子 p.33・48 メタン：メタン（methane）　→ 分子の形と性質(1)　－メタン，アンモニア，水－ p.57 [18]アヌレン：[18]アヌレン（[18]annulene，cyclooctadecanonaene）　→ 分子の構造を決める(a) p.60 ナフタレン／アントラセン ｜ p.62 テトラセン／ペンタセン：ナフタレン（naphthalene） ｜ アントラセン（anthracene） ｜ テトラセン (tetracene；ナフタセン，naphthacene） ｜ ペンタセン（pentacene） ｜ ヘキサセン（hexacene）　→ モノはなぜ見える p.64 ベンゾピレン／その代謝物：ベンゾピレン（benzopyrene；ベンゾ[a]ピレン，benzo[a]pyrene） ｜ 代謝物 benzo[a]pyrene diol epoxide の例　→ 発がん性化合物と生体分子 p.88 ：ピリジン（pyridine）　→ 別トピック p.90 DNA／RNA：　→ DNAとRNAのいろいろな姿 p.96 ヒスチジン｜ p.98 トリプトファン：ヒスチジン（histidine） ｜ トリプトファン（tryptophan）　→ タンパク質中の20種類のアミノ酸 p.98 LSD ：LSD（リゼルグ酸ジエチルアミド，lysergic acid diethylamide，LSD-25）　→ 危険ドラッグ p.99 セロトニン／メラトニン ：セロトニン（serotonin） ｜ メラトニン（melatonin）　→ 抗うつ剤と神経伝達物質｜「亀-C-C-N」構造をもつ脳内物質のSITE例 p.99 インドール酢酸：インドール酢酸（indole-3-acetic acid，IAA；植物ホルモンのオーキシンの例） p.99 ストリキニーネ：ストリキニーネ（strychnine） p.99 シロシビン ：シロシビン（サイロシビン，psilocybin；psylocybin）　→ 「亀-C-C-N」構造をもつ脳内物質のSITE例 p.100 スカトール／インドール：スカトール（skatole，3-methyl-1H -indole） ｜ インドール（indole）　→ 悪臭の正体 p.101 インドメタシン：インドメタシン（indomethacin）　→ 人類の遺産─アスピリンとペニシリン p.101・196 インジゴ：インジゴ（indigo，C.I.Vat Blue 1）　→ 染料の種類 p.102 キニーネ：キニーネ（quinine）　→ 別トピック（キニーネ結合タンパク質） p.103ほか ATP：アデノシン三リン酸（adenosine triphosphate，ATP）　→ 生体分子の構成元素 p.107 ロスバスタチン：ロスバスタチン（rosuvastatin）　→ 日本発の医薬品 p.114 クロロフィルa／ヘム：生物界で見られる4種類のテトラピロール（クロロフィルa，ヘム，ビタミンB12〈p.113〉，F430）の同時表示　→ 窒素から見る生命の世界 p.116 フタロシアニン： 関連PDBsumデータ例 3w8o_WPC（鉄フタロシアニンが結合したヘム獲得タンパク質HasAp）　→ 窒素から見る生命の世界 p.130 テストステロン／エストラジオール：テストステロン（testosterone） ｜ 17β-エストラジオール（17β-estradiol） ｜ テストステロンと17β-エストラジオールの同時表示 　→ 性ホルモン - ステロイドホルモンの生合成と代謝 p.130 アロマターゼ： アロマターゼ構造例 3eqm（アロマターゼ，P450 19A1；アンドロステンジオンが結合）　→ P450部分データ集 p.146 サッカーボール分子C60：フラーレン（fullerene，C60）　→ フラーレン p.151 カーボンナノチューブ：カーボンナノチューブ（carbon nanotube；アームチェア型〈p.152〉の部分構造例）　→ フラーレン p.154 グラフェン：グラフェン（graphene）の部分構造　→ 分子モデルで見るノーベル賞 p.165 カーボンナノベルト：カーボンナノベルト（carbon nanobelt）の構造例（還数12；伊丹・瀬川らのカーボンナノベルト〈p.167〉）　→ 別トピック p.177 “アセチルコリンエステラーゼに結び付いたドネペジル分子”／“トリプトファン分子のインドール環は、ドネペジルのベンゼン環にスタッキング” ： 関連PDBsumデータ例 1eve_E20（アセチルコリンエステラーゼ中のドネペジル）　→ アセチルコリンエステラーゼのSITE比較 p.183 カリックス[4]アレーン： 誘導体例 4-tert-ブチルカリックス[4]アレーン（4-tert-butylcalix[4]arene） p.196 アリザリン：アリザリン（alizarin，C.I.Mordant Red 11）　→ 染料の種類 p.199 モーヴェイン： モーヴェイン（モーベイン，mauveine；モーブ，mauve）の構造例 モーベインA（mauveine A） ｜ モーベインB（mauveine B）　→ 別トピック（モーベインとキニーネ） p.202 β-カロテン：β-カロテン（β-carotene）　→ モノはなぜ見える p.204 フェノールフタレイン：フェノールフタレイン（phenolphthalein，酸性水溶液中） ｜ 同（アルカリ性水溶液中）　→ フェノールフタレインのpH変化による構造と色の変化 p.215 窒化ガリウム：窒化ガリウム（gallium nitride，GaN）結晶構造　→ 分子モデルで見るノーベル賞 pp.219-222 導電性高分子：ポリアセチレン（polyacetylene） ｜ ポリピロール（polypyrrole） ｜ ポリチオフェン（polythiophene）　→ 分子モデルで見るノーベル賞

    
［左］ベンゼン（benzene）　［中］鉄フタロシアニンが結合したHasAp 3w8oのPDBsumデータ（p.116） ［右］ドネペジルが結合したアセチルコリンエステラーゼ1eveのPDBsumデータ（p.177）

生物界で見られる4種類のテトラピロール（クロロフィルa，ヘム，ビタミンB₁₂，F430；p.113・114参照）→ 窒素から見る生命の世界

α-サソリ毒とジギトニンが結合したヒト-ゴキブリ ハイブリッドNavチャネル6nt4とそのPDBsumデータ

Gag-Pol融合タンパク質が結合したhachimoji DNA（ハチモジDNA，8文字DNA）6mig

3'3'-cGAMPが結合したENPP1（エクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ1）6aelとそのPDBsumデータ

4'-カルボキシベンゾ-18-クラウン-6が結合したトランスサイレチン 6imyのChain AとPDBsumデータ

トリクラベンダゾール（triclabendazole）が結合したトランスサイレチン 7eriのChain AとPDBsumデータ（7erh・7erj・7erkとの比較）

compound 6が結合したトランスサイレチン 7w9rのChain AとPDBsumデータ

ベンジオダロン（benziodarone）が結合したヒトのトランスサイレチン 8ii1のChain AとPDBsumデータ；ベンズブロマロン（benzbromarone）結合8ii2との比較

  
左から アイオキシニル（ioxynil）が結合したトランスサイレチン 9jirのChain AとPDBsumデータ；アクロニフェン（aclonifen）結合9jisとの比較，
アイオキシニル（ioxynil）とアクロニフェン（aclonifen）

参考図：テトラブロモビスフェノールA（TBBPA）ほか種々のリガンドが結合したトランスサイレチンのPDBsumデータ　→ 別トピック

エチル水銀イオンと水銀(II)イオンが結合したハロゲナーゼPltM 6bziのChain AおよびそのPDBsumデータ

リン脂質が結合したAtg2のN末端ドメイン6a9jのChain AおよびそのPDBsumデータ

ヘリコバクター・ピロリの空胞化サイトトキシンAオリゴマー集合体2c 6nyl

人工タンパク質 nvPizza2-S16H58 5chbの6量体（Chain A-C×2）

4-(2-ヒドロキシエチルカルバモイル)安息香酸が結合したMHETase 6qgaのChain AおよびそのPDBsumデータ（安息香酸結合の6qgbとの比較）