◆ アルコールとフェノール ◆
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旧版(モル・タロウ色表示可能;ブラウザはChrome以外で)
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エタノール捕捉!(EtOHを含むPDBデータ集)
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●アルコール類(直鎖・飽和)
炭素数 1
メタノール(methanol) CH
3
OH
融点=-97.8℃ 沸点=64.51℃
水溶性: 混和 log P=-0.77
空間充填 球棒 スティック
背景・黒 灰 白 紺
炭素数 2
エタノール(ethanol) C
2
H
5
OH
融点=-114.1℃ 沸点=78.32℃
水溶性: 混和 log P=-0.31
空間充填 球棒 スティック
背景・黒 灰 白 紺
炭素数 3
プロパノール(propanol) C
3
H
7
OH
融点=-126.2℃ 沸点=97.21℃
水溶性: 混和 log P=0.25
空間充填 球棒 スティック
背景・黒 灰 白 紺
炭素数 4
ブタノール(butanol) C
4
H
9
OH
融点=-89.3℃ 沸点=117.73℃
水溶性: 7.7g/100mL(20℃) log P=0.88
空間充填 球棒 スティック
背景・黒 灰 白 紺
炭素数 6
ヘキサノール(hexanol) C
6
H
13
OH
融点=-46℃ 沸点=157.08℃
水溶性: 0.59g/100mL(20℃) log P=2.03
空間充填 球棒 スティック
背景・黒 灰 白 紺
炭素数 8
オクタノール(octanol) C
8
H
17
OH
融点=-16℃ 沸点=195℃
水溶性: 0.05mg/L(20℃) log P=3.00
空間充填 球棒 スティック
背景・黒 灰 白 紺
●フェノール類
炭素数 (6)
フェノール(phenol) C
6
H
5
OH
融点=40.85℃ 沸点=182℃
水溶性: 8.28g/100mL log P=1.46
空間充填 球棒 スティック
背景・黒 灰 白 紺
※参考:
有機化合物の名前・基礎の基礎
【新コンテンツ作成予告】 EtOH捕捉!
※
リガンドとしてエタノールを含むPSBデータのSITE構造集
作成開始!
バックボーン 二次構造
全選択 タンパク質選択 リガンド選択
空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色
酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(
αヘリックス
・
βストランド
)
水素結合(太)
OFF
背景・黒 灰 白 紺
エタノールを含むKチャネル構造例
3auw
の8量体(Chain AB×4)
3auw_EOH
I'/O'=1.1538
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 紺
■参考Webページ・文献例
国際化学物質安全性カード(ICSC)
Interactive LOGKOW Demo
分子と分子の相互作用(QSARと有機概念図から)
有機概念図
※“有機性”が疎水性に,“無機性”が親水性に結びつくので,
無機性基表
によりどのような置換基が親水性・疎水性に寄与するか半定量的に理解することができ,log
P
の推算も可能である。
Log Pをポケットに!
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有機分子の構成元素と色立体
log P(オクタノール/水系の分配係数)とは?
※
Log Pをポケットに!
“水と油”のデモンストレーション(水-サラダ油層,簡単に手に入る色素)
「生活環境化学の部屋」ホームページ
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Jmol版「分子の学習帳」
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Chime版「分子の学習帳」