- Carbon-Rich Active Materials with Macrocyclic Nanochannels for High-Capacity Negative Electrodes in All-Solid-State Lithium Rechargeable Batteries（Wiley Online Library，2016/05/13）
- 防虫剤の「ナフタレン」から大容量負電極が誕生（EE Times Japan，2016/05/16）
- ナフタレン - Wikipedia ｜ グラフェン
- モノはなぜ見える（本サイト）
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穴あきグラフェン分子（CNAP）；歪み構造例 ｜ 同；平面構造例 ナフタレン（naphthalene） → モノはなぜ見える グラフェン（graphene） → 分子モデルで見るノーベル賞 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 背景・黒 灰 白 紺 |
穴あきグラフェン分子（CNAP）の歪み構造例
- M-COPA, a Golgi disruptor, inhibits cell surface expression of MET protein and exhibits antitumor activity against MET-addicted gastric cancers（Cancer Research，2016/05/15）
- 世界初 ゴルジ体阻害剤、難治性胃がんへの効果確認 東京理科大学など（大学ジャーナル，2016/05/17）
- AMF-26, a Novel Inhibitor of the Golgi System, Targeting ADP-ribosylation Factor 1 (Arf1) with Potential for Cancer Therapy（Journal of Biological Chemistry，2012/02/03）
- Total Synthesis of AMF-26, an Antitumor Agent for Inhibition of the Golgi System, Targeting ADP-Ribosylation Factor 1（Journal of Medicinal Chemistry，2012/12/06）
- 特許 WO2013151161A1 - 新規化合物及びその製造方法並びに抗がん剤 - Google 特許検索（公開日 2013/10/10）
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空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 背景・黒 灰 白 紺 |
M-COPA（2-メチルコプロフィリンアミド；AMF-26）
［Keratin - Wikipedia，Intermediate filament - Wikipedia］
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バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］4zryの4量体（Chain A・B×2）；中間径フィラメント（KRT1）とケラチン10（KRT10）の複合体（●はシステインのS原子）
［右］参考図：羊毛の階層構造（epicuticleはケラチンタンパク質から成る）
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●アミノ色表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO
●酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS
●極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP
●疎水性インデックス順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE
●有機概念図I/O値順（特性基 R）
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE
●等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP VAL GLY LEU ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG
アミノ酸および特性基の親水性・疎水性 ｜ Log Pをポケットに！
- A platform for the discovery of new macrolide antibiotics（Nature，2016/05/18） ※solithromycin（ソリスロマイシン），erythromycin（エリスロマイシン）を以下に。
- Hundreds of antibiotics built from scratch（Nature News & Comment，2016/05/18）
- Antibiotics From Scratch（Scientist Magazine，2016/05/18）
- 富山化学 新規マクロライド系抗菌薬ソリスロマイシンの国内P2開始 18年5月までに申請へ（ミクスOnline，2015/01/14）
- Solithromycin rejection chills antibiotic sector（Nature Biotechnology，2017/03/07） …“ソリスロマイシンの承認却下で冷え込む抗生物質業界”
- エリスロマイシン - Wikipedia ｜ マクロライド系抗生物質
- 抗生物質分子データ集（本サイト） ｜ 抗生物質を含むPDBデータ
［Solithromycin - Wikipedia，Macrolide - Wikipedia］
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ソリスロマイシン（solithromycin） エリスロマイシン（erythromycin） ※参考（エリスロマイシン結合タンパク質例）： 3aoc（エリスロマイシンAが結合した多剤排出タンパク質AcrB） 同PDBsumデータ3aoc_ERY（エリスロマイシンA）$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］ソリスロマイシン（solithromycin） ［中］ソリスロマイシンが結合した大腸菌リボソーム4www（上にはデータ未掲載） ［右］エリスロマイシンA（erythromycin A）が結合した多剤排出タンパク質AcrB3aocのPDBsumデータ
- Structural insights into inhibition of lipid I production in bacterial cell wall synthesis（Nature，2016/04/18） ※PDB 5CKR。
- 抗薬剤耐性菌薬開発の新たな標的 リピドI合成酵素の阻害機構の解明に成功（北海道大学，2016/04/19） [PDF]
- 抗薬剤耐性菌薬開発の新たな標的「リピドI合成酵素」の阻害機構を解明－北大（QLifePro医療ニュース，2016/04/21）
- 今月の分子 292:ヒアルロニダーゼφX174 YES複合体（PhiX174 YES Complex）（PDBj，2024/04） ｜ Molecule of the Month（PDB） ※紹介PDBデータ8g02・4jpp・5ckr
- 抗生物質データ集メニュー（本サイト）
［Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase - Wikipedia］
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5ckr（ムライマイシンD2が結合した酵素MraY） 同PDBsumデータ5ckr_57M$ ムライマイシンD2（muraymycin D2，MD2） バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 A鎖（IL-18）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］ムライマイシンD2（muraymycin D2，MD2） ［右］ムライマイシンD2が結合した酵素ホスホ-MurNAc-ペンタペプチドトランスロカーゼ（MraY）5ckrとそのPDBsumデータ
- Structural basis of omalizumab therapy and omalizumab-mediated IgE exchange（Nature Communications，2016/05/19）
- 他のオマリズマブ構造例
- 他の抗体（免疫グロブリン）構造例
- オマリズマブ関連ニュース例
- 明るい希望をもたらす2024年の医学のブレイクスルー7選（日経，2025/01/20） [NEW!] ※“FDAが、ピーナツなどの食品に対するアレルギー反応を減らす薬として、ゾレア（一般名オマリズマブ）を1歳以上の患者に使うことを承認”。
- 【花粉症2020】世界初 抗体医薬「ゾレア」登場…デザレックス供給再開、抗ヒスタミン薬も競争激しく（AnswersNews，2020/01/22）
- 抗体医薬として初めて重症花粉症に適応拡大（日経メディカル，2020/01/30）
- ゾレアが重症季節性アレルギー性鼻炎の承認を取得（日経メディカル，2019/12/13）
- オマリズマブは日本の重症小児喘息でも有用か？（CareNet，2015/10/16）
- 花粉症新薬情報例
- 目の花粉症｢まぶたに塗る新薬｣登場で大きく進歩 目薬との使い分けやセルフケアを専門家が解説（東洋経済オンライン，2025/02/11） [NEW!] ※“まぶたに塗るクリームタイプのアレルギー性結膜炎治療薬（商品名：アレジオン眼瞼クリーム）”。一般名はエピナスチン塩酸塩，エピナスチン（epinastine）を下掲。
- アレルギー性結膜炎治療剤「アレジオン®眼瞼クリーム0.5%」を日本で発売―世界初の1日1回上下眼瞼に塗布するクリームタイプのアレルギー性結膜炎治療剤―（田辺三菱製薬，2024/05/22）
- 医療用医薬品 : アレジオン - KEGG
- 抗体 - Wikipedia
- 今月の分子 21:抗体（Antibodies）（PDBj，2001/09） ｜ Molecule of the Month（PDB）
- 抗体とは？｜バイオのはなし - 中外製薬
- 抗体について - 5種類のタイプ｜協和キリン ※“抗体（免疫グロブリン）のH鎖定常部には5種類あり、それによってIgG、IgM、IgA、IgD、IgEの5タイプに分類されます”。
- KEGG DRUG: 人免疫グロブリン
［Omalizumab - Wikipedia，Immunoglobulin E - Wikipedia］
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5hysのChain A・B・H・J・K・L（オマリズマブ〈omalizumab〉と結合したIgE） 6tcm（オマリズマブ〈omalizumab〉Fab） ※参考（IgGの構造例）：1igt（IgG2a） ［Immunoglobulin G - Wikipedia］ ｜ 8btb（IgG3，FLJ00385タンパク質） エピナスチン（epinastine） ［Epinastine - Wikipedia］ バックボーン 二次構造 糖鎖別着色（#印のみ）：Gal，α-Glc，β-Glc，Man，Fuc，Xyl，Sia，GalNAc，GlcNAc，GlcA 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］抗IgE抗体オマリズマブ（omalizumab）と結合したIgE 5hysのChain A・B・H・J・K・L
［右］オマリズマブ（omalizumab）Fab 6tcm
［左］IgG2a構造例1igt ［右］IgG3構造例8btb
エピナスチン（epinastine）
- Crystal Structure of Cytochrome P450 (CYP105P2) from Streptomyces peucetius and Its Conformational Changes in Response to Substrate Binding（Journal of Molecular Sciences，2016/05/25）
- シトクロムP450 - Wikipedia ｜ ビスフェノールA
- P450データ集メニュー（本サイト） ※“P450ファミリーの独特の形状は“おにぎり”や“プリズム”に例えられます”。 ｜ 多様なリガンドを含むエストロゲン受容体および関連受容体等のSITE比較 ｜ 別トピック
［Cytochrome P450 - Wikipedia，Bisphenol A - Wikipedia］
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5it1のChain A（ビスフェノールAが結合したP450〈CYP105P2〉） 同PDBsumデータ5it1_2OH$ ビスフェノールA（bisphenol A） → 環境ホルモンとして疑われている化合物例 ※参考（ビスフェノールAが結合した他のPDBデータ例）：2e2r（ビスフェノールAが結合したエストロゲン関連受容体γ） 同PDBsumデータ2e2r_2OH$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］5it1のChain A（ビスフェノールAが結合したP450〈CYP105P2〉） ［右］5it1と2e2rのPDBsumデータ
［Beta-galactosidase - Wikipedia，Allolactose - Wikipedia］
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1jz8（アロラクトースが結合したβ-ガラクトシダーゼ） LAK（アロラクトース）選択 同PDBsumデータ1jz8_LAK$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 Pb選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
アロラクトースが結合したβ-ガラクトシダーゼ1jz8
- Charge-density analysis of an iron-sulfur protein at an ultra-high resolution of 0.48Å（Nature，2016/05/18） ※PDB 5CKR。
- HiPIP - 光合成事典 - 日本光合成学会
- 鉄硫黄タンパク質 - Wikipedia
- 鉄硫黄クラスターを含む生体分子のSITE例（本サイト）
［High potential iron-sulfur protein - Wikipedia］
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5d8v（高電位鉄硫黄タンパク質） SF4（鉄硫黄クラスター）選択 同PDBsumデータ5d8v_SF4$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 A鎖（IL-18）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
高電位鉄硫黄タンパク質（HiPIP）5d8vとそのPDBsumデータ
- 再生可能エネルギーによる効率的な水分解水素製造、二酸化炭素資源化触媒系を研究（中部大学，2016/04/19）
- 一酸化炭素デヒドロゲナーゼ (フェレドキシン) - Wikipedia
- 鉄硫黄クラスターを含む生体分子のSITE例（本サイト）
［Carbon-monoxide dehydrogenase (ferredoxin) - Wikipedia］
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4udxの2量体（一酸化炭素デヒドロゲナーゼ） WCC（Fe3NiS4クラスター）選択 SF4（鉄硫黄クラスター）選択 同PDBsumデータ4udx_WCC（CO2，Fe含む）$ ※鉄ポルフィリン類の例 → 窒素から見る生命の世界｜ヘモグロビン 2hhbのChain AのPDBsumデータ2hhb_HEM_A（ヒトのデオキシヘモグロビンのヘム）$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 A鎖（IL-18）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
一酸化炭素デヒドロゲナーゼ構造例4udxの2量体とそのPDBsumデータ（Fe3NiS4クラスター-Fe-CO2）