- STAP現象の検証結果について（理研，2014/12/26） ｜ 「研究不正再発防止をはじめとする高い規範の再生のためのアクションプラン」への取組状況について（理研，2014/12/26） ｜ STAP現象の検証結果について（理研，2014/12/19） ∥ 研究論文（STAP細胞）に関する情報等について（理研）
- STAP論文、「ES細胞が混入」と認定 理研調査委（朝日，2014/12/26）
- STAP狂奏曲のエピローグ（大隅典子の仙台通信，2014/12/20）
- （耕論）STAPの教訓 郷通子さん、榎木英介さん（朝日，2014/12/19）
- 理化学研究所「STAP現象の検証結果」の資料公表（全文）（弁護士ドットコム，2014/12/19）
- 小保方氏が理研退職へ 「魂の限界まで取り組んだ」（朝日，2014/12/19）
- STAP細胞：理研が存在を否定 小保方氏証明できず（毎日，2014/12/19）
- 小保方氏、STAP細胞再現できず 19日に理研が会見（朝日，2014/12/18）
- 「真実と希望の○×科学」を求めて － 榎木英介「嘘と絶望の生命科学」（みわよしこ）（Yahoo!ニュース，2014/08/17）
- STAP白紙に 科学技術立国へ正念場 不正防ぐ仕組みづくりを（日経，2014/06/05）
- STAP 全論文撤回へ 研究成果白紙に（NHK，2014/06/04）
- STAP細胞はあるのか ～検証 小保方会見～（2014/04/10放映）
- STAP現象の検証の実施について（理研，2014/04/07）
- 研究論文（STAP細胞）の疑義に関する調査報告について（理研，2014/04/01）
- 研究論文（STAP細胞）の疑義に関する調査報告について（その2）（理研，2014/04/01） ※『調査報告を受けての著者のコメント』も掲載。
- 研究論文（STAP細胞）の疑義に関する調査中間報告について（理研，2014/03/14）
- STAP細胞騒動から考える研究広報と科学報道（大隅典子の仙台通信，2014/03/22）
- STAP細胞問題から見えた市民と科学者の乖離 ─前編（Chem-Station，2014/03/19） ｜ 後編（2014/03/22）
- STAP細胞はあったのか？（日本科学未来館 科学コミュニケーターブログ，2014/03/17）
- 小保方さんら3人 論文取り下げ同意（NHK，2014/03/14） ※“研究者の倫理問題に詳しい東京都市大学の北澤宏一学長は…”。
- 【衝撃】理研・小保方晴子氏のSTAP細胞論文の捏造がほぼ確定か 著名研究者らによる失望ツイートまとめ - NAVER まとめ（2014/03/10）
- STAP細胞論文の調査について（理研，2014/03/11） ※“当該Nature誌掲載の論文（2報）について論文の取下げを視野に入れて検討しています”。
- STAP細胞論文「3つの疑問」 理研、調査結果公表へ（朝日，2014/03/09）
- 村松 秀，「論文捏造」，中公新書ラクレ(2006)
- Stimulus-triggered fate conversion of somatic cells into pluripotency（Nature，2014/01/30）
- STAP細胞作製に関する実験手技解説の発表について（理研，2014/03/05）
- STAP細胞の研究成果に関するお問合せ・取材対応について（理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター）
- iPS細胞の医療応用に期待してくださっている患者さんへ（京都大学 iPS細胞研究所，2014/02/07）
- 続・STAP細胞が映し出すもの――「科学」と「社会」の関係（SYNODOS，2014/02/27）
- 「STAP細胞」報道から見える日米の“科学レベル”の違い（日経トレンディネット，2014/02/14）
- STAP細胞「ノウハウ教えて」 山中教授が会見で称賛（朝日，2014/02/10）
- STAP細胞、応用へ過熱 性急な国家事業は逆効果（日経，2014/02/10）
- 独創の系譜:海越え連携、STAP細胞 常識覆した日米トップ研究者（毎日，2014/02/06）
- STAP細胞 米でヒツジ治療の研究始まる（NHK，2014/02/01）
- 特集「万能細胞」（朝日）
- なぜSTAP細胞は驚くべき発見なのか――STAP細胞が映し出すもの 八代嘉美 / 幹細胞生物学（SYNODOS，2014/01/31）
- 発明者に小保方さんの名も、既に国際特許出願（読売，2014/01/30）
- 弱酸性溶液に浸すだけで「万能細胞」作成に成功（NHK，2014/01/30）
- STAP細胞「大変革」 世界が興奮、米指導教官も称賛（朝日，2014/01/30）
- 「生物のロマン見ている」 小保方さん会見一問一答（朝日，2014/01/30）
- 論文一時は却下…かっぽう着の「リケジョ」快挙（読売，2014/01/30）
- 理研の万能細胞、海外から賛辞 「また日本人が成果」 （日経，2014/01/30）
- 「万能細胞」新手法 iPSより簡易 マウスで成功、理研チーム（東京新聞，2014/01/30）
- 理研など、動物の体細胞を万能細胞(多能性細胞)へと初期化する新手法を開発（マイナビニュース，2014/01/30）
- タカラバイオ株など高い、STAP細胞報道が材料に（ロイター，2014/01/30）
- 多能性幹細胞をつくる簡便な方法：幹細胞は実はストレスで誘導される（大隅典子の仙台通信，2014/01/29）
- 「間違い」と言われ泣いた 新型万能細胞を開発した30歳女性研究者（産経，2014/01/29）
- 新型万能細胞で山中伸弥教授「日本人研究者からの発信、誇り」（産経，2014/01/29）
- 弱酸性溶液に浸すだけで「万能細胞」作成に成功（NHK，2014/01/29）
- 参考（理研プレスリリースの“Oct4::GFPマウス”およびLIF関連論文例）：Deterministic direct reprogramming of somatic cells to pluripotency（Nature，2013/10/03）
- 参考（“酸性”について）：NHK高校講座 化学基礎「第25回 酸と塩基 ～青を赤くするもの、赤を青くするもの～」
- 今月の分子 No.112: Oct・Sox転写因子（Oct and Sox Transcription Factors）（PDBj，2009/04） ｜ Molecule of the Month（PDB）
- Oct1/Sox2/DNA複合体 - iPS細胞の山中因子から（本サイト） ｜ 分子モデルで見るノーベル賞 ｜ 緑色蛍光を発するタンパク質／GFP
［Oct-4 - Wikipedia］
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◎Oct4関連 1gt0*（Oct4・Sox2・DNA 複合体の例） 3l1p（Oct4関連POUドメイン；DNAに結合） ◎GFP関連 1hcjのChain A（オワンクラゲ由来のGFP） バックボーン 二次構造 DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 DNA/RNA選択 同backbone選択 ※1gt0について： C鎖（Oct4類似のOct1）選択 D鎖（Sox2）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
PDBデータ1gt0のPyMOLによる回転アニメ
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●アミノ色表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO
●酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS
●極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP
●疎水性インデックス順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE
●有機概念図I/O値順（特性基 R）
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE
●等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP VAL GLY LEU ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG
アミノ酸および特性基の親水性・疎水性 ｜ Log Pをポケットに！
ヘモグロビン構造の比較（何れもA鎖）： ヒト（2hhb，デオキシヘモグロビン），ヤツメウナギ（2lhb，CN-結合），ヌタウナギ（1it3，CO結合）
［Hagfish - Wikipedia］
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1it3（ヌタウナギのヘモグロビン；一酸化炭素が結合） ｜ 同Chain A 1hho（ヒトのヘモグロビン；オキシヘモグロビン） ｜ 同Chain A バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［Cytochrome P450 reductase - Wikipedia，Heme oxygenase - Wikipedia］
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バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- 富士フイルム、来年にも米で抗インフルエンザ薬承認申請へ（Bloomberg，2014/07/18） → ファビピラビル情報を2014年にエボラ出血熱感染拡大にも転載
- 抗感染症領域 | 富山化学工業
- インフル薬「途上国ルート」はインド発 日本企業に特効薬の期待（朝日，2009/07/27）
- ヒポキサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ - Wikipedia
- 鳥インフルエンザ＆新型インフルエンザ情報（本サイト）
［Favipiravir - Wikipedia，Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase - Wikipedia］
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ファビピラビル（favipiravir） PDBデータ 4kn6（ヒポキサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ；T-705-リボース-5'-一リン酸が結合） ※T-705は活性体の三リン酸体に変換されて阻害作用 同PDBsumデータ 4kn6_1RP$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 HB選択（$印のみ） 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- 緑膿菌が分泌する鉄獲得タンパク質の標的誤認識を利用する緑膿菌の増殖阻害人工タンパク質を開発（名古屋大学，2014/02/05） [PDF]
- 名大ら 緑膿菌に対する新作用機構の増殖阻害人工タンパク質を開発 - （QLifePro医療ニュース，2014/02/18）
- ヘム獲得タンパク質HasA（名古屋大学大学院理学研究科 生物無機化学研究室 渡辺Group）
- RCSB PDB 2014/01/28 新規公開データより：3w8o Crystal Structure of HasAp with Iron Phthalocyanine
- フタロシアニン - Wikipedia
- 別トピック（本サイト；3w8oのPDBsumデータ掲載）
鉄フタロシアニンが結合したヘム獲得タンパク質HasApのPDBsumデータ3w8o_WPC
［Phthalocyanine - Wikipedia］
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3w8oのChain A（ヘム獲得タンパク質HasAp；鉄フタロシアニンが結合） 同PDBsumデータ 3w8o_WPC（鉄フタロシアニン結合）$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 HB選択（$印のみ） 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
鉄フタロシアニンが結合したHasAp 3w8oのPDBsumデータ
- 『死なないやつら』著：長沼毅---ムダにスゴいやつら（現代ビジネス，2014/01/02）
- 死なないやつら 長沼毅著 さあ、不思議な生命の冒険へ（日経，2014/01/22）
- 長沼毅・藤崎慎吾，「辺境生物探訪記」，光文社新書(2010) ｜ 長沼毅・藤崎慎吾，『辺境生物探訪記 第4回』（科学未来館）
- 高井研，「生命はなぜ生まれたのか 地球生物の起源の謎に迫る」，幻冬舎新書(2011)
- NHK「サイエンスZERO」取材班・高井研・JAMSTEC 編著，「NHKサイエンスZERO 深海で生命の起源を探る」，NHK出版(2011) ※JAMSTEC刊行物案内で関連書籍多数紹介
- E．シュレーデｨンガー 著，岡小天・鎮目恭夫 訳，「生命とは何か」，岩波新書(1951)
- 浅島 誠・黒岩常祥，小原雄治 編，「現代生物科学入門10 極限環境生物学」，岩波書店(2011) ※pp.33-34でDeinococcus radiodurans 紹介。“しかしDeinococcus radiodurans は何のために放射線耐性を獲得したのであろうか”。
- 第10回 自然科学研究機構シンポジウム「多彩な地球の生命 －宇宙に仲間はいるのか－」（2010/10/10，学術総合センター）
- NHKサイエンスZERO「熱水噴出！ 深海に生命を探れ」（2011/01/15放映）
- デイノコッカス・ラディオデュランス - Wikipedia ｜ 極限環境微生物
- 生命を知り生命に学ぶ（本サイト） ｜ DNA修復 ｜ チューブワーム関連データのSITE例 ｜ DNAとRNAのいろいろな姿 ｜ DNAの脆弱性と強靭性（ロバスト／ロバストネス） ｜ コドンと遺伝暗号表
デイノコッカス・ラディオデュランスのDNA修復酵素2v1c（左）としんかい6500レゴ（中），チューブワームのヘモグロビン1yhu（右）
［Deinococcus radiodurans - Wikipedia］
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2v1c（放射線抵抗性細菌デイノコッカス・ラディオデュランスのDNA修復酵素） 1yhu（チューブワームのヘモグロビン） → ヘモグロビン バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 HB選択（$印のみ） 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- 参考：遺伝子の変異によらないがん化の仕組みを解明iPS細胞技術の応用（JST，2014/02/14）
- 参考：化学物質でiPS細胞を作る（Chem-Station，2012/10/10）
- DNAメチル化 - Wikipedia ｜ エピジェネティクス ｜ 人工多能性幹細胞 ｜ ジンクフィンガー
- iPS細胞山中4因子／STAP細胞関連（本ページ）
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バックボーン 二次構造 DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 DNA/RNA選択 同backbone選択 5CM選択 Zn選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- Induction of mitochondrial dysfunction as a strategy for targeting tumour cells in metabolically compromised microenvironments（Nature，2014/02/18）
- 参考：クローズアップ現代『がん“根治”の時代は来るか ～“がん幹細胞”研究最前線～』（NHK，2013/09/19放映）
- 参考：サイエンスZERO『シリーズ がん幹細胞 (1) がん再発の謎が解けた！ 新発見「がん幹細胞」』（NHK，2014/01/12放映）
- 『分子からみた生物進化 DNAが明かす生物の歴史』著：宮田隆（現代ビジネス，2012/02/04）
- 分子系統学 - Wikipedia
- 生命を知り生命に学ぶ（本サイト） ｜ DNAとRNAのいろいろな姿（p.38ほか） ｜ コドンと遺伝暗号表（p.49） ｜ ヘモグロビン（p.83ほか） ｜ チューブワーム（ハオリムシ）関連データのSITE例（p.269） ｜ ミトコンドリア関連生体分子のSITE例（p.309ほか） ｜ 鉄硫黄クラスターを含む生体分子のSITE例（p.316）
アミノ酸残基の極性（上掲書 p.89）とI'/O'値の比較 → Jmolアミノ酸
ヘモグロビンβ鎖の立体構造例（4hhbのChain B）
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4hhbのChain B（ヒトのヘモグロビンβ；デオキシヘモグロビン） His63・92選択 2hhb_HEM（B鎖；ヘモグロビンβ）$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 HB選択（$印のみ） ヘム選択 Fe選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |