- Mechanism of homologous recombination from the RecA-ssDNA/dsDNA structures（Nature，2008/05/22）
- 参考：生命進化の理由の1つは、遺伝物質にDNAを選択した結果と判明 －RNAから始まった原始生命が、進化の過程で「DNA」を選択した謎を解く－（理研，2009/09/28）
- 遺伝的組換え - Wikipedia
- DNA修復（本サイト）
［RecA - Wikipedia，Homologous recombination - Wikipedia］
|
|
バックボーン 二次構造 DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択 タンパク質選択 DNA/RNA選択 同backbone選択 リガンド選択 HB選択（$印のみ） 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
-
●アミノ色表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO
●酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS
●極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP
●疎水性インデックス順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE
●有機概念図I/O値順（特性基 R）
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE
●等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP VAL GLY LEU ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG
アミノ酸および特性基の親水性・疎水性 ｜ Log Pをポケットに！
- Structure of the human P2Y12 receptor in complex with an antithrombotic drug（Nature，2014/03/23）
- 新しい受容体メカニズムの解明と創薬（東京都神経研: 神経研ニュース）
- GPCR - 2012年ノーベル化学賞（本サイト） ｜ 別トピック
［P2Y receptor - Wikipedia］
|
|
PDBデータ 4ntj*（P2Y受容体；抗血栓剤が結合） 同PDBsumデータ 4ntj_AZJ$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 AZJ選択 HB選択（$印のみ） 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- Structure of the LH1-RC complex from Thermochromatium tepidum at 3.0Å（Nature，2014/03/26）
- 光合成のしくみ（KEK，2014/08/20）
- 光合成に関係する生体分子のSITE例（本サイト）
※上掲研究で3wmmがC2結晶，3wmn・3wmoがP21結晶
|
|
バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 C・L・M・H鎖（反応中心）選択 BCL選択 BPH選択 HEM選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
BCL・BPH・HEMのみ表示
- Solution structure of a 2:1 complex of anticancer drug XR5944 with TFF1 estrogen response element: insights into DNA recognition by a bis-intercalator（Nucleic Acids Research，2014/04/07）
- National DNA Day
- Nature special: 50 Years of DNA
- Yahoo!リアルタイム検索“DNAの日”
- DNAとRNAのいろいろな姿（本サイト）
|
|
バックボーン 二次構造 DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択 タンパク質選択 DNA/RNA選択 同backbone選択 リガンド選択 HB選択（$印のみ） 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- 佐々木成 編，「みずみずしい体のしくみ 水の通り道「アクアポリン」の働きと病気」，クバプロ(2005)
- 佐々木成 編，「水とアクアポリンの生物学」，中山書店(2008)
- アクアポリン - Wikipedia
- 爆問学問で脳と水分子とアクアポリンの話題（こども省，2009/03/05）
- 膜タンパク質データ集（本サイト） ｜ 別トピック
［Aquaporin - Wikipedia］
|
|
3zojの4量体（Chain A×4；アクアポリン）* 同 単量体* バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- 崩壊前のタンパク質の姿撮影 理研放射光科学総合研究センター（神戸新聞，2014/05/12）
- 今月の分子 No.005: シトクロムc酸化酵素（Cytochrome c Oxidase）（PDBj，2000/05） ｜ Molecule of the Month（PDB）
- 2014年は世界結晶年！（本サイト）
［Cytochrome c oxidase - Wikipedia; Redirected from Cytochrome oxidase］
|
|
3wg7 同PDBsumデータ 3wg7_PER（過酸化物イオン）$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 PER（過酸化物イオン）選択 HEA（ヘムa）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- Structural Delineation of a Quaternary, Cleavage-Dependent Epitope at the gp41-gp120 Interface on Intact HIV-1 Env Trimers（Immunity，2014/04/24）
- Scripps Research Institute scientists find new point of attack on HIV for vaccine development（EurekAlert，2014/04/24）
- 今月の分子 No.170: 広域中和抗体（Broadly Neutralizing Antibodies）（PDBj，2014/02） ｜ Molecule of the Month（PDB）
- HIVとエイズ（本サイト）
- PDB登録データ100,000件突破関連
|
|
バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
（EPAが結合したプロスタグランジンエンドペルオキシド合成酵素）
EPAが結合したプロスタグランジンエンドペルオキシド合成酵素1igxのPDBsumデータ
- Mutations in the PQBP1 gene prevent its interaction with the spliceosomal protein U5-15kD（Nature Communications，2014/04/30）
- 知的障害の原因解明 富大などのグループ（北國新聞，2014/05/01）
- ヒトゲノムマップに見るタンパク質（本サイト）
※上掲研究で他に，4bwqがPQBP1・U5-15kDの複合体，4cdoがスプライセオソーマルU5-15kDに結合するPQBP1
|
|
バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 A鎖（U5-15kD）選択 B鎖（PQBP1）選択 C鎖（U5-52K）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［Aldosterone - Wikipedia］
|
|
アルドステロン（aldosterone） 参考（アルドステロンを含むPDBデータ例）： 2aa2（ミネラルコルチコイド受容体；アルドステロンが結合） 同PDBsumデータ 2aa2_AS4$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 AS4（アルドステロン）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
アルドステロン（aldosterone）と同分子結合PDBデータ例ミネラルコルチコイド受容体2aa2のPDBsumデータ