 サイエンスアゴラ2014（2014/11/7-9，東京お台場地域）に出展する日本コンピュータ化学会＠サイエンスアゴラ2014のテーブル展示（11/8-9の2日間）が世界結晶年2014日本委員会の共催で催されました。 ※IYCr2014の国内イベント情報からもリンク。
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タンパク質構造解析の心臓部（中央が試料取付け・照射部で左はCCD検出器；SPring-8）
→ 日本コンピュータ化学会年会2007秋季年会参加記録
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【参考】
◎本サイト内：分子とは？ - もっと数を増やすと ｜ サイエンスカフェにいがた第6回『雪と氷の不思議な魅力』
中谷ダイアグラムと氷の結晶構造
Fascination of Snow Crystals －How are their beautiful patterns created?より
※中谷宇吉郎 - Wikipedia
「GoogleドライブとChem3D for iPad／RCSB PDB Mobileで分子を見る」によるNaCl結晶構造
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ダイヤモンド，石英（水晶），窒化ガリウム，塩化ナトリウムの結晶構造の同時表示 水（氷，雪）・塩化ナトリウムの結晶構造とスクロース・グルタミン酸ナトリウムの同時表示 水（氷，雪）の結晶構造のみ表示水素結合着色表示 炭素（C）の同素体：ダイヤモンド，グラファイト，フラーレン（C60），カーボンナノチューブ（アームチェア型の例） → フラーレン 金（Au）・銀（Ag）・銅（Cu）の結晶構造同時表示 ｜ 金（Au） 銀（Ag） 銅（Cu） 様々な結晶とタンパク質内の結晶もどき[1] [NEW!] ｜ 同[2] [NEW!] Mg，Si，Ca，Mn，Fe，Co，Cu，Ga，As，Mo，Te，W，Au，を球80％表示し元素記号表示 → 生命を知り生命に学ぶ 黄鉄鉱（pyrite；FeS2）部分構造 [NEW!] …Pyrite – Virtual Museum of Molecules and Mineralsのデータを加工 ｜ Fe2S2・Fe4S4・Fe3S4（以上2wqyより），Fe8S7（3minより），黄鉄鉱（pyrite）部分構造の同時表示 → 鉄硫黄クラスターを含む生体分子のSITE例 バックボーン 二次構造 空間充填 球棒 球40％ 球60％ スティック 針金 背景・黒 灰 白 紺  Jmol colors |
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バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 A鎖選択 リガンド選択 Mn4CaO5クラスター選択 （一方のMn4CaO5クラスターの近傍4分子のみ） 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
アミノ酸および特性基の親水性・疎水性 ｜ Log Pをポケットに！
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バックボーン 二次構造 ｜ DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択 DNA backbone選択 N選択 O選択 P選択 S選択 CPK色 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
DNA構造解明の歴史
Molecular Configuration in Sodium Thymonucleate - Nature [PDF]
Rosalind Franklin was so much more than the ‘wronged heroine’ of DNA（Nature E，2020/07/21） [NEW!]
高電位鉄イオウタンパク質（HiPIP）のPDBsumデータ3a38_SF4（H原子追加）
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3wg7 同PDBsumデータ 3wg7_PER（過酸化物イオン）$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 PER（過酸化物イオン）選択 HEA（ヘムa）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
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