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エストロゲンレセプター1ere_EST(17β-エストラジオール) I'/O' = 0.693,I/O = 0.681 エストロゲンレセプターα1x7r_GEN(ゲニステイン;大豆イソフラボン) I'/O' = 0.703,I/O = 1.423 レチノイン酸レセプター RXR-α3kwy_T9T(トリフェニルスズ) I'/O' = 0.238,I/O = 0.257 エストロゲンレセプターα3erd_DES(ジエチルスチルベストロール,DES) I'/O' = 0.591,I/O = 0.644 エストロゲンレセプター1err_RAL_A(ラロキシフェン) I'/O' = 0.626,I/O = 0.742 エストロゲンレセプターα3ert_OHT(4-ヒドロキシタモキシフェン) I'/O' = 0.841,I/O = 0.456 エストロゲン関連レセプターγ2e2r_2OH(ビスフェノールA) I'/O' = 0.793,I/O = 0.767 エストロゲン関連レセプターγ2zkc_BPZ(ビスフェノールZ) I'/O' = 0.698,I/O = 0.667 エストロゲン関連レセプターβ6lit_2OH(ビスフェノールA) I'/O' = 0.583,I/O = 0.767 ∥ Journal of Molecular Biology誌論文 エストロゲン関連レセプターγ6k3n_CW6(BPA-monoF) I'/O' = 0.734,I/O = 0.770 ∥ Chemical Research in Toxicology誌論文 エストロゲンレセプターα9bpx_lp(T6I-29) [NEW!] I'/O' = 0.537,I/O = 0.628 | 9bpxのChain A(cif→pdb変換) 残基番号537スティック表示/α炭素ラベル表示(Y537S) ∥ Breast Cancer Research誌論文 バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60% スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順 コンホメーション選択性(αヘリックス・βストランド) ヒトの必須・非必須区別 水素結合(太) OFF 背景・黒 灰 白 紺 |
[左]エストロゲン受容体および関連受容体中のビスフェノール類 → Jmolトピック(ビスフェノールを含むPDBsumデータ例)・別トピック
[中]ビスフェノールAが結合したエストロゲン受容体γ(PDB 2E2R)のPDBsumデータとその川上モデル
[右]AlphaFill構造 P08684から得たPDBsumデータ(LigPlot v.2.2による) → PDBsumサイトで入手したAlphaFold構造
T6I-29が結合したエストロゲンレセプターα 9bpxのChain AとPDBsumデータ
→ Breast Cancer Research誌論文 [NEW!]
[左]BPAが結合したエストロゲン関連レセプターβ 6litのPDBsumデータ(Journal of Molecular Biology誌論文)
[右]BPA-monoFが結合したエストロゲン関連レセプターγ 6k3nのPDBsumデータ(Chemical Research in Toxicology誌論文)
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バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60% スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順 コンホメーション選択性(αヘリックス・βストランド) ヒトの必須・非必須区別 水素結合(太) OFF 背景・黒 灰 白 紺 |
1ere,3erd,1err,3ertの比較(SITEは上掲データと異なる;Chime版ページ参照)
アミノ色で見る2e2r,1ere,3erdのアミノ酸配列(作成ページ)
ビスフェノールAが結合したエストロゲン受容体γより
DESを含む3erdのSITE(PDBsum)(左)とSITE(右)の同時表示のアニメーション
17β-estradiolとDES(濃色表示)の重ね合わせデータ(Chime版ページで作成)