◆ 抗生物質を含むPDBデータ(Jmol版) ◆
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※初期表示はバンコマイシンを含む1pnvのChain B

PDBデータ抗生物質(英名,系統)
1ei2のModel 1 ネオマイシン(neomycin B,アミノグリコシド系)
1m4iのChain A カナマイシン(kanamycin A,アミノグリコシド系)
1byj ゲンタマイシン(gentamicin,アミノグリコシド系)
1ll5のChain A イミペネム(imipenem,カルバペネム系)
1pnvのChain B バンコマイシン(vancomycin,グリコペプチド系)
1mrlのChain A ダルホプリスチン(dalfopristin,ストレプトグラミン系)
1fxvのChain B ペニシリン(penicillin G,β-ラクタム系/ペニシリン系)
1cla クロラムフェニコール(chloramphenicol,クロラムフェニコール系)
1m1kのChain A 《注:約3MB》 アジスロマイシン(azithromycin,マクロライド系)
1nwyのChain C・Q・Z 《α炭素のみ》
同上
○ 略(オリジナル1p9x《注:約4MB》 テリスロマイシン(telithromycin,ケトライド系)
2z2p キヌプリスチン(quinupristin,ストレプトグラミン系)
3bfgのChain A メロペネム(meropenem,カルバペネム系)
キノロン系参考データ 1kse ニューキノロン系の例;シプロフロキサシン(ciprofloxacin)
エリスロマイシン参考データ 1oxa
 (前駆体の6-deoxyerythronolide B 含む)
エリスロマイシン(erythromycin,マクロライド系)
1dsrのModel 1 [Peptide Antibiotic]
1mqzのModel 1 [Lantibiotic]
1o83のChain B・D* [Peptide Antibiotic]


バックボーン 二次構造 | DNA/RNA(ATGCUbackbone
全選択 タンパク質選択 DNA/RNA選択 リガンド選択 (*印のみ)
空間充填 球棒 同(球大き目) スティック 針金
アミノ色 CPK色 | Jmol色 Rasmol色 | 濃赤 濃青
酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 等電点順 コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド#
水素結合(太) OFF 
 背景・黒 背景・灰 背景・白


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