抗生物質関連PDBデータ例
※初期表示は1ei2のModel 1

PDBデータ 抗生物質（英名，系統） 1ei2のModel 1 ネオマイシン（neomycin B，アミノグリコシド系） 1m4iのChain A カナマイシン（kanamycin A，アミノグリコシド系） 1byj ゲンタマイシン（gentamicin，アミノグリコシド系） 1ll5のChain A イミペネム（imipenem，カルバペネム系） 1pnvのChain B バンコマイシン（vancomycin，グリコペプチド系） 1mrlのChain A ダルホプリスチン（dalfopristin，ストレプトグラミン系） 1fxvのChain B ペニシリン（penicillin G，β-ラクタム系／ペニシリン系） 1cla クロラムフェニコール（chloramphenicol，クロラムフェニコール系） 1m1kのChain A 《注：約3MB》 アジスロマイシン（azithromycin，マクロライド系） 1nwyのChain C・Q・Z 《α炭素のみ》 同上 略（オリジナル1p9x） 《注：約4MB》 テリスロマイシン（telithromycin，ケトライド系） キノロン系参考データ 1kse ニューキノロン系の例；シプロフロキサシン（ciprofloxacin） エリスロマイシン参考データ 1oxa 　（前駆体の6-deoxyerythronolide B 含む） エリスロマイシン（erythromycin，マクロライド系） 1dsrのModel 1　[Peptide Antibiotic] 1mqzのModel 1　[Lantibiotic] 1o83のChain B・D*　[Peptide Antibiotic]

Backbone 2nd Structure Termini DNA/RNA（ATGCU） Ligands表示 OFF Water表示（*印データのみ）　 OFF 全選択 Ligand選択 Protein選択 DNA/RNA全選択 同backbone選択 空間充填 球棒 スティック OFF CPK amino ｜ ラベル表示 OFF 酸性・中性・塩基性アミノ酸区別 極性・非極性区別 有機概念図I/O値順（特性基 R）| 同（アミノ酸） 等電点順 Dot Surface表示 OFF ※エラーに注！→ 静電ポテンシャル 親油ポテンシャル OFF 水素結合（細） 同（太） OFF 光沢表示 OFF ｜ 光量30% OFF 背景・黒 背景・灰 背景・白 回転 OFF ｜ 画像をクリップボードへコピー ※amino表示の凡例 ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO ＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝ ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS ※極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別 SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP ※有機概念図I/O値順（特性基 R） ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE ※同上（アミノ酸） GLY　SER　ASN　ASP　GLN　THR　GLU　ALA　ARG　HIS VAL　LYS　CYS　PRO　LEU　TYR　ILE　MET　TRP　PHE ※等電点順 ASP　GLU　CYS　ASN　PHE　GLN　TYR　SER　MET　TRP VAL　GLY　LEU　ALA　ILE　THR　PRO　HIS　LYS　ARG

※バンコマイシンを含む1pnvの部分構造から作成した画像例

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