- Lysocin E is a new antibiotic that targets menaquinone in the bacterial membrane（Nature Chemical Biology，2014/12/08）
- 微生物薬品化学教室の浜本洋助教、関水和久教授らが、新規抗生物質ライソシンの発見と作用機序の解明に成功（東京大学，2014/12/11）
- 浜本 洋・関水和久，『【解説】新規MRSA抗生物質ライソシンEの発見 ─カイコを用いる治療効果を指向したスクリーニング創薬』，化学，2015年7月号
- カイコ使って見つけた抗生物質が有望（ハフポ，2014/12/13）
- MRSA：１分で99.99％殺菌 新しい抗生物質発見（毎日，2014/12/09）
- 抗生物質含有画分、その抗生物質及びその抗生物質の製造方法（ekouhou.net，2012/01/12公開）
- 抗生物質・抗菌剤／耐性菌／院内感染（本サイト） ｜ 抗生物質データ集メニュー
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ライソシンE（lysocin E） 参考：メチシリン（methicillin） 参考： メナキノン-6 （menaquinone 6；メナキノン〈ビタミンK2〉の例） 参考（MRSA関連PDBデータ）：2iwd*（メチシリン耐性黄色ブドウ球菌〈MRSA〉の細胞外センサードメインMecR1の構造例） バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド（SOY）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
ライソシンE（lysocin E）
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●アミノ色表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO
●酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS
●極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP
●疎水性インデックス順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE
●有機概念図I/O値順（特性基 R）
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE
●等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP VAL GLY LEU ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG
アミノ酸および特性基の親水性・疎水性 ｜ Log Pをポケットに！
- The Structure and Regulation of Human Muscle α-Actinin（Cell，2014/12/04）
- Protein structure 'holds key to heart muscle disease（BBC News，2014/11/30）
- Scientists Reveal Important New Insights into Muscle Protein（Scicasts，2014/11/26）
- Facebookタイムライン画像（PDBe，2014/12/10）
- αアクチニン - 脳科学辞典
［Actinin - Wikipedia，Actinin, alpha 2 - Wikipedia］
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バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- Persistent Associations between Maternal Prenatal Exposure to Phthalates on Child IQ at Age 7 Years（PLOS ONE，2014/12/10）
- 環境水中の男性ホルモン、抗男性ホルモン作用を示す物質を検出するバイオモニタリングメダカの作出に成功（基礎生物学研究所，2014/12/05）
- 木村-黒田純子・黒田洋一郎，『自閉症・ADHDなど発達障害増加の原因としての環境化学物質 ─有機リン系，ネオニコチノイド系農薬の危険性（上・下）』，「科学」2013年6月号・7月号
- 環境ホルモン学会
- 内分泌攪乱物質 - Wikipedia ｜ フタル酸ジブチル ｜ フタル酸ジイソブチル
- 環境ホルモン情報（本サイト） ｜ 環境ホルモンとして疑われている化合物の例 ｜ 環境ホルモンとして疑われている化合物の例 ｜ 環境ホルモンの作用例／アゴニストとアンタゴニスト ｜ ビスフェノールAが結合したエストロゲン関連受容体γ ｜ 性ホルモン - ステロイドホルモンの生合成と代謝 ｜ 別トピック（他のフタル酸エステル記事）
［Dibutyl phthalate - Wikipedia，Diisobutyl phthalate - Wikipedia］
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フタル酸ジブチル（DBP，DnBP） フタル酸ジイソブチル（DIBP，DiBP） DBPとDIBPの同時表示 ※参考（DBPが結合したPDBデータ）：4g5i（ブタ膵臓のホスホリパーゼA2〈PLA2〉；フタル酸ジブチルが結合） 同PDBsumデータ4g5i_DB7$ ［ホスホリパーゼA2 - Wikipedia］ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］「GoogleドライブとChem3D for iPad／RCSB PDB Mobileで分子を見る」によるフタル酸ジブチルとフタル酸ジイソブチルの同時表示
［右］4g5iのPDBsumデータ（AFPBB News記事，PLOS ONE論文とは直接関係ありません）
- N-Terminal Domain of Bombyx mori Fibroin Mediates the Assembly of Silk in Response to pH Decrease（Journal of Molecular Biology，2012/05/04）
- タンパク質（啓林館）
- フィブロイン - Wikipedia ｜ ケラチン
- 2014年は世界結晶年！ ｜ 代表的な高分子
［Fibroin - Wikipedia］
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バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 Gly・Ala・Ser選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
3ua0の4量体（アミノ色表示；球表示はフィブロインに多いGly・Ala・Ser）
【参考】 羊毛ケラチンと絹フィブロインに含まれるアミノ酸の例（mol％）
※データ引用：森昇・中嶋哲生，「被服材料学」，さんえい出版(1986)
アミノ酸
羊毛ケラチン
絹フィブロイン
グリシン
10.12
44.46
アラニン
5.40
30.24
セリン
11.91
11.41
グルタミン酸
11.55
0.93
シスチン
11.59
－
模式的に描いたフィブロインの平行β鎖構造（CAMD-I plusほか旧プログラムによる）
- 免疫・神経難治疾患の治療薬開発を促進するインターロイキン18複合体立体構造を解明（京都大学，2014/12/16）
- The structural basis for receptor recognition of human interleukin-18（Nature Communications，2014/12/15）
- 岐阜大・京大、免疫誘導たんぱく質「インターロイキン18」の受容体との結合構造解明（日刊工業新聞，2014/12/17）
- インターロイキン - Wikipedia
- 糖タンパク質データ集（本サイト） ※インターロイキン-19・22掲載
［Interleukin 18 - Wikipedia，Interleukin-18 receptor - Wikipedia］
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3wo4$（受容体に結合したインターロイキン18） 3wo2のChain A（インターロイキン18） バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 A鎖（IL-18）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 糖鎖別着色（#印のみ）：Gal，α-Glc，β-Glc，Man，Fuc，Xyl，Sia，GalNAc，GlcNAc，GlcA 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- 【プリオン病】ヒトはスクレイピーにかかるのか（Nature Asia，2014/12/17）
- 急速に進むプリオン病 - ひょっとして認知症？ - アピタル（朝日，2014/11/06）
- プリオンタンパク質の凝集が出芽酵母の生存に有利に働くことを発見 -プリオンタンパク質の凝集と非凝集で、酵母は環境変化に迅速に対応-（JST，2014/04/20）
- プリオン - Wikipedia ｜ スクレイピー ｜ 牛海綿状脳症
- 狂牛病とプリオン／牛海綿状脳症（BSE）（本サイト） ｜ アルツハイマー病治療薬
［http://en.wikipedia.org/wiki/Prion - Wikipedia，Scrapie - Wikipedia］
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1xyuのModel 1（ヒツジのプリオンタンパク質例） 1qlzのModel 1（ヒトのプリオンタンパク質例） … 2002年ノーベル化学賞受賞のWuthrichらによる。 → 2002年度ノーベル化学賞 バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
ヒトの正常プリオンタンパク質例と異常プリオンタンパク質（データ詳細不詳）の比較
［Cefixime - Wikipedia］
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セフィキシム（cefixime） エノキサシン（enoxacin） シプロフロキサシン（ciprofloxacin） クロラムフェニコール（chloramphenicol） ネオマイシンの例としてネオマイシンB（neomycin B） ※参考（セフィキシムが結合したPDBデータ）：4kou（セフィキシムが結合したアセチルトランスフェラーゼ） 同PDBsumデータ4kou_C04$（硫酸イオン含む） C04（セフィキシム）選択 バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］セフィキシム（cefixime） ［右］セフィキシムが結合したアセチルトランスフェラーゼ 4kouとそのPDBsumデータ
- Thalidomide mimics uridine binding to an aromatic cage in cereblon（Journal of Structural Biology，2014/12）
- サリドマイドの標的タンパク質「セレブロン」の三次元構造を解明 ～免疫調整剤に関する研究の促進と新薬開発にむけて大いに期待～（奈良先端科学技術大学院大学，2014/08/12）
- セルジーン 多発性骨髄腫治療薬レナリドミド 国内P2で未治療患者の効果を確認 適応拡大申請へ（ミクスOnline，2014/12/11）
- 構造生物学：サリドマイドの二通りの作用機構（Nature ハイライト，2014/08/07）
- サリドマイドが手足や耳に奇形を引き起こすメカニズムを解明（東京工業大学，2019/10/08）
- レブラミド（レナリドミド）の作用機序：多発性骨髄腫治療薬（役に立つ薬の情報～専門薬学）
- サリドマイド - Wikipedia
- 参考（サリドマイド関連）：分子モデルで見るノーベル賞（本サイト） ｜ Jmol別トピック
［Lenalidomide - Wikipedia，Thalidomide - Wikipedia，Cereblon - Wikipedia］
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4v30（(S )-レナリドミドが結合したセレブロン） 同PDBsumデータ4v30_LVY [151(A)]$ PDBsumデータ4v2y_EF2$（(S )-サリドマイドが結合したセレブロン） (S )-サリドマイド ｜ (R )-サリドマイド ｜ 両分子同時表示 バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 A鎖（IL-18）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- Synthesis and biological activities of vitamin D3 derivatives with cyanoalkyl side chain at C-2 position（Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology，2014/12/10）
- 医療用医薬品 : ワンアルファ - KEGG（活性型ビタミンD3製剤の例）
- ビタミンD - Wikipedia
- 水溶性ビタミンと脂溶性ビタミン（本サイト） ｜ 別トピック（ビタミンD3受容体関連）
［Lenalidomide - Wikipedia，Vitamin D - Wikipedia，Calcitriol receptor - Wikipedia］
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3wwr（ビタミンD3誘導体が結合したビタミンD3受容体） 同PDBsumデータ3wwr_3AJ$ ※参考（活性型ビタミンD3が結合したビタミンD3受容体）：1ie9 同PDBsumデータ1ie9_VDX [151(A)]$ ビタミンD2（カルシフェロール，エルゴカルシフェロール） ｜ ビタミンD3｛コレカルシフェロール｝ 活性型ビタミンD3 バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 A鎖（IL-18）選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
- HIV-1 reverse transcriptase complex with DNA and nevirapine reveals non-nucleoside inhibition mechanism（Nature Structural & Molecular Biology，2012/01/22）
- Effect of Flap Mutations on Structure of HIV-1 Protease and Inhibition by Saquinavir and Darunavir（Journal of Molecular Biology，2008/08/01）
- ジドブジン - Wikipedia ｜ 抗ウイルス薬
- HIVとエイズ（本サイト） ｜ エイズ薬の例 ｜ 各種エイズ治療薬を含むHIVタンパク質のSITE比較
［Darunavir - Wikipedia］
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ダルナビル（darunabir；プロテアーゼ阻害薬） AZT（ジドブジン，zidovudine；核酸系逆転写酵素阻害薬） ［Zidovudine - Wikipedia］ ※参考（ダルナビルが結合したPDBデータ例）：3cyw（HIV-1プロテアーゼ） 同PDBsumデータ3cyw_017$ ※参考（AZTの活性体AZT3リン酸が結合したPDBデータ例）：3v4iのChain A・B・P・T（HIV-1逆転写酵素とDNA） 同PDBsumデータ3v4i_AZT（AZT1リン酸，Mgが結合）$ AZT選択 バックボーン 二次構造 DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 DNA/RNA選択 同backbone選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
AZTの活性体AZT3リン酸が結合したHIV-1逆転写酵素とDNAのPDBsumデータ3v4i_AZT（AZT1リン酸，Mgが結合）