◆ 水溶性ビタミンと脂溶性ビタミン(Jmol版) ◆
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■ビタミン
●水溶性ビタミン
ビタミンC〈L-アスコルビン酸〉
ビタミンB1〈チアミン〉 ※2008/03/02,データを差替えました。
ビタミンB2〈リボフラビン〉
ビタミンB6〈ピリドキシン〉
ビタミンM〈葉酸〉
ナイアシン〈ニコチン酸〉
※ナイアシンアミド〈ニコチン酸アミド〉
パントテン酸 ※以前はビタミンB5という名称も。
●脂溶性ビタミン
ビタミンA〈all-trans-ビタミンA〉 11-cis-ビタミンA
※all-trans-レチナール 11-cis-レチナール ※β-カロテン(β-カロチン)
ビタミンD2〈カルシフェロール,エルゴカルシフェロール〉
ビタミンD3〈コレカルシフェロール〉 活性型
ビタミンE〈トコフェロール〉
ビタミンK2〈メナキノン〉の例;メナキノン-6
◆参考:新しい酵素の報告例(未確定)
PQQ(ビタミンB群) ※理研記事1・2(PQQはビタミンか?),ChemFinder参照
◆参考:補酵素の例
コエンザイム A(CoA)
コエンザイム Q10(CoQ10)〈ユビデカレノン,ユビキノン 10〉
◆ビタミンAとビタミンCの同時表示(原子球白色表示;塗り絵用)
ビタミンA〈all-trans-ビタミンA〉+ビタミンC
■ビタミン関連分子を含んだタンパク質例
※〈 〉内はLigandとして含むビタミン関連分子(または補酵素), →でオリジナルPDBデータ表示(詳細はSummary Informationに記載)
1E0PのModel 1(基底状態)〈Vit.A(レチナール)〉 → 1E0P(Photoreceptor)
1F88のChain A〈Vit.A(レチナール)〉 → 1F88(Signaling Protein)
1IG0〈Vit.B1〉 → 1IG0(Transferase)
1BU5のChain A〈Vit.B2〉 → 1BU5(Electron Transport)
1BJNのChain A〈Vit.B6〉 → 1BJN(Aminotransferase)
1N2ZのChain A〈Vit.B12〉 → 1N2Z(Transport Protein)
1C9UのChain A〈PQQ;上掲記事とは無関係〉 → 1C9U(Oxidoreductase)
1J78のChain B〈Vit.D〉 → 1J78 ※eF-siteデータ
3czhのChain A〈Vit.D2〉 [NEW!] → 3czh(P450 2R1) ※P450データ集
1IE9〈活性型Vit.D3〉 → 1IE9 ※活性化経路
3C6GのChain B*〈Vit.D3〉 → 3c6g(P450 2R1) ※P450データ集
1FE7のChain A〈Vit.E〉 → 1FE7(1KPMに変更)
■ビタミン関連タンパク質例
2YXUのChain A(ピリドキサールキナーゼ;Vit.B6活性化酵素) → 2YXU
◆参考:補酵素を含んだPDBデータ例
1cm0のChain B〈CoA〉 → 1CM0(Signaling Protein)
7reqのChain A〈CoB12〉 → 7REQ(Isomerase)
1ezvのChain C〈CoQ6〉 → 1EZV(Oxidoreductase/Electron Transport)
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