- Structure-Based Virtual Screening Protocol for in Silico Identification of Potential Thyroid Disrupting Chemicals Targeting Transthyretin（Environmental Science & Technology，2016/09/26）
- PFAS汚染問題（本サイト） ｜ ビスフェノールAが結合したエストロゲン関連受容体γ ｜ はっ水剤・難燃剤の生物体内蓄積性（PFOS類，PBDE類，HBCD，リン系難燃剤） ｜ 新規POPs有害物質リスト ｜ 別トピック
［Transthyretin - Wikipedia，Bisphenol S - Wikipedia］
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5l4jのChain A（ビスフェノールSが結合したトランスサイレチン） 同PDBsumデータ5l4j_6JD$ ｜ ビスフェノールS（bisphenol S） 5jidのChain A（PFOAが結合したトランスサイレチン） 同PDBsumデータ5jid_8PF$ ｜ PFOA（パーフルオロオクタン酸） ［Perfluorooctanoic acid - Wikipedia］ 5jimのChain A（PFOSが結合したトランスサイレチン） 同PDBsumデータ5jim_P8S$ ｜ PFOS（パーフルオロオクタンスルホン酸） ［Perfluorooctanesulfonic acid - Wikipedia］ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］ビスフェノールSが結合したトランスサイレチン5l4jのChain A ［右］5l4j・5jid（PFOA結合トランスサイレチン）・5jim（PFOS結合トランスサイレチン）のPDBsumデータ
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●アミノ色表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO
●酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS
●極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP
●疎水性インデックス順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE
●有機概念図I/O値順（特性基 R）
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE
●等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP VAL GLY LEU ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG
アミノ酸および特性基の親水性・疎水性 ｜ Log Pをポケットに！
- Crystal Structure of Silkworm PIWI-Clade Argonaute Siwi Bound to piRNA（Cell，2016/09/29）
- 小さなRNAが生殖細胞を守るメカニズムの一端を解明（SPring-8，2016/09/30）
［Piwi - Wikipedia，Piwi-interacting RNA - Wikipedia］
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バックボーン 二次構造 DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 DNA/RNA選択 同backbone選択 空間充填 球棒 球30％ 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
piRNAが結合したカイコ由来のPIWIタンパク質Siwi5guh
- Gas-sensitive biological crystals processed in pressurized oxygen and krypton atmospheres: deciphering gas channels in proteins using a novel `soak-and-freeze' methodology（J.Appl.Crystallogr.，2016/08/16）
- リゾチーム - Wikipedia
- 009: リゾチーム (Lysozyme) - 今月の分子 - PDBj
- 生体分子の構成元素（本サイト）
- 以下はKr（クリプトン）に関する話のタネ
［Lysozyme - Wikipedia，Krypton - Wikipedia］
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バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球30％ 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
Kr，Na，Clが結合したリゾチーム5fst
- Crystal Structure of the Human Cannabinoid Receptor CB1（Cell，2016/10/20）
- Structure of primary cannabinoid receptor is revealed（National Institutes of Health，2016/10/20）
- A look at the 'marijuana' receptor（Phys.org，2016/10/20）
- 以下は別のカンナビノイド受容体CB1データ
- 危険ドラッグ（本サイト） ｜ GPCR - 2012年ノーベル化学賞
［Cannabinoid receptor - Wikipedia］
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5tgz（AM6538が結合したカンナビノイド受容体CB1） ZDG（AM6538）選択 同PDBsumデータ5tgz_ZDG$ 5u09（カンナビノイド受容体CB1） 7DY（taranabant）選択 同PDBsumデータ5u09_7DY$ → Nature ハイライト（2016/12/21） 9erxのChain R（カンナビノイド受容体CB1；HU-210が結合，cif→pdb変換） 同PDBsumデータ9erx_lp$ テトラヒドロカンナビノール〔tetrahydrocannabinol〕／Δ9-THC（幻覚作用） ｜ JWH-018（naphthoylindole誘導体） バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］5tgz（AM6538が結合したカンナビノイド受容体CB1）とそのPDBsumデータ ［右］5u09（taranabantが結合したCB1）とそのPDBsumデータ
［左］9erx（THCアナログのHU-210が結合したカンナビノイド受容体CB1）のChain RとそのPDBsumデータ
［右］Δ9THC（テトラヒドロカンナビノール）ほか様々な危険ドラッグ
- Structural basis of checkpoint blockade by monoclonal antibodies in cancer immunotherapy（Nature Communications，2016/10/31）
- 日本発のがん新薬、オプジーボ 24年前発見の分子から（朝日，2016/09/25）
- 小野薬品、純利益2.2倍に がん治療薬オプジーボ好調（朝日，2017/05/11）
- 非小細胞肺がん1次治療、ニボルマブ単剤と化学療法の比較（CareNet.com，2016/10/24）
- がんの究極薬が開く､新しい治療法の可能性 新薬｢オプジーボ｣はいかに生まれたのか（東洋経済オンライン，2015/07/14）
- ニボルマブ - Wikipedia ｜ PD-1 ｜ プログラム細胞死
- 話題の制がん剤・抗がん剤（本サイト） ｜ 抗がん剤開発と標的タンパク質
［Nivolumab - Wikipedia，Programmed cell death protein 1 - Wikipedia］
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5ggrのChain A・B・Y（ニボルマブのFabが結合したPD-1） Chain Y（PD-1））選択 5ggq（ニボルマブのFab） バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
5ggr（ニボルマブのFabが結合したPD-1） → 別トピック（本庶佑さん2018年ノーベル医学生理学賞受賞）
- がん疼痛の薬物療法に関するガイドライン 2010年版（日本緩和医療学会）
- トラマール、ワントラム（トラマドール）の作用機序：疼痛治療薬 - 役に立つ薬の情報～専門薬学
- オピオイド関連別記事
- 新たな強力合成オピオイドに警告 過剰摂取死が増加 国連（AFPBB News，2024/06/26） [NEW!] ※“合成オピオイドの一種「ニタゼン（Nitazenes）」”のニタゼン例メトデスニタゼン（metodesnitazene）を以下に。 ［List of benzimidazole opioids - Wikipedia］
- トラマドール - Wikipedia
- 危険ドラッグ（本サイト）
［Tramadol - Wikipedia］
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(1R,2R)-トラマドールと(1S,2S)-トラマドールの同時表示 (1R,2R)-トラマドール (1S,2S)-トラマドール オキシコドン（oxycodone） → Jmolトピック フェンタニル（fentanyl） メトデスニタゼン（metodesnitazene；nitazenes基本骨格のニトロ基は含まない） nitazenes基本骨格以外の分子を黄色で表示（基本骨格のニトロ基は含まない） ［Metodesnitazene - Wikipedia］ 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 背景・黒 灰 白 紺 |
(1R,2R)-トラマドールと(1S,2S)-トラマドール（アニメgif）
ニタゼン（nitazenes）例のメトデスニタゼン（metodesnitazene）
- Structural Basis for Receptor-Mediated Selective Autophagy of Aminopeptidase I Aggregates（Cell Reports，2016/06/16）
- オートファジー - Wikipedia
- 分子モデルで見るノーベル賞（本サイト） ｜ 別トピック
［Aminopeptidase - Wikipedia，Autophagy - Wikipedia］
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バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
5jh9の12量体（Chain A-D×3；アミノペプチダーゼ1））
- Crystal structure of bacterial haem importer complex in the inward-facing conformation（Nature Communications，2016/11/10）
- 病原菌が鉄を細胞内に取り込む仕組み －細胞膜で働くヘム輸送体タンパク質の立体構造を解明－（理研，2016/11/10）
- 病原菌が効率的に鉄を細胞内へと輸送する仕組み明らかに－理研（QLifePro医療ニュース，2016/11/14）
- ヘモグロビン（本サイト） ｜ P450データ集メニュー ｜ テトラピロール - 窒素から見る生命の世界
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バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
5b57（ヘムトランスポーター）
- 結核新薬の早期普及を要請（47NEWS，2016/11/15）
- 結核：国境なき医師団（MSF）が日本の大手製薬企業に結核治療薬の提供拡大を要請（PR TIMES，2016/10/28）
- 結核：半世紀ぶりの新薬の登場から3年たつも、普及は必要な人の2％にとどまる（PR TIMES，2015/12/07）
- 結核に40年ぶりの新薬登場！ 根治難しい「多剤耐性結核」に光？（週刊朝日，2015/09/01）
- 多剤耐性肺結核治療薬「デラマニド」の超多剤耐性結核に対する有効性データを発表－大塚製薬（QLifePro医療ニュース，2015/07/21）
- 【新薬】デラマニド デルティバ：約40年ぶりの新規結核治療薬（日経メディカル，2014/08/08）
- デルティバ（デラマニド）の作用機序：抗結核薬（役に立つ薬の情報～専門薬学）
- デラマニド - Wikipedia
- 抗生物質分子データ集（本サイト） ｜ 抗生物質・抗菌剤／耐性菌／院内感染
［Delamanid - Wikipedia］
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デラマニド（delamanid） ※参考（上掲記事に出てくる他の抗生物質例）：リファンピシン（rifampicin） ｜ イソニアジド（isoniazid） 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 背景・黒 灰 白 紺 |
デラマニド（delamanid）
- 洗濯表示（平成28年12月1日以降） - 家庭用品品質表示法 | 消費者庁
- 衣類の洗濯表示が12月1日から変更。「タンブル乾燥」マークなどを追加（家電 Watch，2016/11/25）
- 新しい洗濯表示が分かりにくい！ 覚え方を「洗濯王子」に相談してみた（エキサイトニュース，2016/11/14）
- 新しい取扱い表示（花王）
- ICSC_0076（テトラクロロエチレン）
- テトラクロロエチレン - EICネット
- テトラクロロエチレン - Wikipedia ｜ ドライクリーニング
- 温室効果ガス（本サイト；旧前のドライクリーニング溶剤含む） ｜ 界面活性剤の種類 ｜ PRTR／新潟県のデータから
洗濯表示（消費者庁）よりドライクリーニング処理の記号
テトラクロロエチレン（パークロロエチレン，パークレン，PCE）
［Tetrachloroethylene - Wikipedia］
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テトラクロロエチレン（tetrachloroethylene） ※参考（石油系溶剤の成分例）：n-ノナン ｜ n-デカン ｜ n-ウンデカン → 有機化合物の名前・基礎の基礎 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 背景・黒 灰 白 紺 |
テトラクロロエチレン（tetrachloroethylene）