◆ PFAS汚染問題 ◆
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2020/11/15-22オンライン開催のサイエンスアゴラに日本コンピュータ化学会動画(公開継続)でPFASについても言及しました。


同動画ロングバージョン(本間担当分):公開スライド


ジョン・ミッチェル/小泉昭夫/島袋夏子 著 , 阿部小涼 訳,「永遠の化学物質 水のPFAS汚染」,岩波ブックレット(2020) ほか参照 =

パーフルオロオクタンスルホン酸(perfluorooctanesulfonic acid,PFOS)
パーフルオロオクタンスルホン酸(perfluorooctanesulfonic acid,PFOS) ‖ PFOSを含むタンパク質のPDBsumデータ例: 4e99_P8S$(PFOSを含む血清アルブミン) [Serum albumin - Wikipedia] | 5jimのChain A(PFOSが結合したトランスサイレチン) 同PDBsumデータ5jim_P8S$ [Transthyretin - Wikipedia
パーフルオロオクタン酸(perfluorooctanoic acid,PFOA) ‖ PFOAを含むタンパク質例: 7AAI(PFOAが結合したヒト血清アルブミン) 8PF(PFOA)選択5jidのChain A(PFOAが結合したトランスサイレチン) 同PDBsumデータ5jid_8PF$
パーフルオロオクタンスルホン酸フルオリド(perfluorooctanesulfonyl fluoride,PFOSF)
パーフルオロヘキサンスルホン酸(perfluorohexanesulfonic acid,PFHxS)
パーフルオロノナン酸(perfluorononanoic acid,PFNA)
GenX(商品名;異性体あり) [GenX - Wikipedia

バックボーン 二次構造 DNA/RNA(ATGCUbackbone
全選択 タンパク質選択 DNA/RNA選択 同backbone選択 リガンド選択 HB選択($印のみ)
空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
水素結合表示
 
  
背景・黒 灰 白 

      



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