染料の種類（Jmol版）

染料の種類（初期表示は C.I.Acid Orange 7；Orange II）

分類と染料名（C.I.Nameほか）	分子式
●直接染料
C.I.Direct Red 2	C₃₄H₂₆N₆Na₂O₆S₂
C.I.Direct Red 28	C₃₂H₂₂N₆Na₂O₆S₂
●酸性染料
C.I.Acid Orange 7（Orange II）	C₁₆H₁₁N₂NaO₄S
●塩基性染料
C.I.Basic Blue 9（Methylene Blue）	C₁₆H₁₈N₃S⁺Cl^-
●媒染染料
C.I.Mordant Red 11（Alizarine）	C₁₄H₈O₄
●酸性媒染染料
C.I.Mordant Black 3	C₂₀H₁₃N₂NaO₅S
●建染染料（バット染料）
C.I.Vat Blue 1（Indigo）	C₁₆H₁₀N₂O₂
●分散染料
C.I.Disperse Yellow 7	C₁₉H₁₆N₄O
C.I.Disperse Orange 3	C₁₂H₁₀N₄O₂
C.I.Disperse Red 17	C₁₇H₂₀N₄O₄
C.I.Disperse Violet 1（1,4-diaminoanthraquinone）	C₁₄H₁₀N₂O₂
●反応染料
C.I.Reactive Red 1	C₁₉H₉N₆Na₃O₁₀S₃Cl₂
■蛍光増白染料
C.I. Fluorescent Brightener 162	C₁₄H₁₁NO₃
DAS1（CAS 16090-02-1）* 《分子計算未了》	C₄₀H₃₈N₁₂Na₂O₈S₂
■pH指示薬の例
メチルオレンジ（C.I.Acid Orange 52）	C₁₄H₁₄N₃NaO₃S
メチルレッド（C.I. Acid Red 2）	C₁₅H₁₅N₃O₂
◆参考：染料の代表的な基本構造例
アゾ基	-N=N-
アントラキノン	─

空間充填　球棒　針金
Jmol色　Rasmol色
ドット表面表示　OFF
回転　OFF
背景・黒　灰　白　紺

β-カロテンとメチルレッドで見る共役系

【参考】染料分子を含むPDBデータ例（染料のタンパク質繊維への結合を考えるモデルとして）

PDBsumのLigand-SITE情報と有機性・無機性

C.I.Basic Blue 9（メチレンブルー）を含むPDBsumデータ2yve - Ligand MBTより（SITEにはアミノ酸以外にグリセリン含む）
※参考：Log Pをポケットに！

C.I. Acid Red 2（メチルレッド）を含むPDBsumデータ2v9c - Ligand MREより（SITEにはアミノ酸以外にフラビンモノヌクレオチド含む）

C.I.Reactive Red 6の誘導体を含むPDBsumデータ1qd0 - Ligand RR6より（SITEにはアミノ酸以外にCu含む）
※参考：Image:CI Reactive Red 6 structure.png - Wikimedia Commons（Cu含む）

参考文献・Webページ