- Structure of the human LAT1-4F2hc heteromeric amino acid transporter complex（Nature，2019/03/13）
- 他のアミノ酸トランスポーター研究
- Structural basis for the inhibition mechanism of LAT1-4F2hc complex by JPH203（Cell Discovery，2024/07/02） ※2024/07/17公開8xpuを下掲
- Structural basis of anticancer drug recognition and amino acid transport by LAT1（Nature Communications，2025/02/14） [NEW!] ※2025/02/12公開8kdd・8kdf（下掲）・8kdg・8kdh・8kdi・8kdj・8kdn・8kdo・8kdp
- Molecular Variability in Levodopa Absorption and Clinical Implications for the Management of Parkinson’s Disease（Journal of Parkinson's Disease，2024/08/31）
- パーキンソン病治療薬レボドパの吸収に影響を及ぼす要因と具体的な対策（Neurology 興味を持った「脳神経内科」論文，2024/09/22） ※レボドパはL-DOPA，L-DOPA結合LAT1-4F2hc構造8j8lを下掲 ［L-DOPA - Wikipedia］
［Amino acid transporter - Wikipedia］
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6irt（BCHが結合したヒトアミノ酸トランスポーターLAT1-4F2hc） AUU（BCH）選択 同PDBsumデータ6irt_AUU$ 8xpu（JPH203が結合したヒトアミノ酸トランスポーターLAT1-4F2hc） 同PDBsumデータ8xpu_VRW$ 8kdf（JPH203が結合したヒトアミノ酸トランスポーターLAT1-CD98hc） 同PDBsumデータ8kdf_VRW$ 8j8l（L-DOPAが結合したヒトアミノ酸トランスポーターLAT1-4F2hc） 同PDBsumデータ8j8l_DAH$ ※参考（レボドパ以外のパーキンソン病治療薬例）：アポモルフィン（apomorphine） → アルツハイマー病治療薬 バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 糖鎖別着色（#印のみ）：Gal，α-Glc，β-Glc，Man，Fuc，Xyl，Sia，GalNAc，GlcNAc，GlcA 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
BCHが結合したヒトアミノ酸トランスポーターLAT1-4F2hc 6irtとPDBsumデータ
JPH203が結合したヒトアミノ酸トランスポーターLAT1，8xpu（LAT1-4F2hc）8kdf（LAT1-CD98hc），およびそれぞれのPDBsumデータ
※JPH203情報例：LAT1高発現の胆道がん、肝外胆管がん・胆嚢がんに対して特に顕著な改善を示す（ジェイファーマ，2023/06/05）
L-DOPAが結合したヒトアミノ酸トランスポーターLAT1-4F2hc 8j8lとPDBsumデータ
※参考：パーキンソン病治療薬例のL-DOPA（レボドパ）とアポモルフィン（apomorphine）
→ 「亀-C-C-N」構造をもつ脳内物質のSITE例
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●アミノ色表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO
●酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS
●極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP
●疎水性インデックス順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE
●有機概念図I/O値順（特性基 R）
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE
●等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP VAL GLY LEU ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG
アミノ酸および特性基の親水性・疎水性 ｜ Log Pをポケットに！
- Crystal structure of a mammalian Wnt-frizzled complex（Nature Structural & Molecular Biology，2019/04/29）
- 多くの疾患に関与する「Wntタンパク質」の立体構造をついに解明!!（日本医療研究開発機構，2019/05/09）
- Wntシグナル経路 - Wikipedia
- Wnt - 脳科学辞典
［Wnt signaling pathway - Wikipedia，Frizzled - Wikipedia］
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6ahyのChain A・B（Wnt-frizzled複合体） MLY（L-ペプチド結合）選択 同PDBsumデータ6ahy_PAM$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 糖鎖別着色（#印のみ）：Gal，α-Glc，β-Glc，Man，Fuc，Xyl，Sia，GalNAc，GlcNAc，GlcA 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
Wnt-frizzled複合体 6ahyのChain A・BとそのPDBsumデータ
- Crystal Structure of the S-Nitroso Form of Liganded Human Hemoglobin（Biochemistry，1998/11/04） ※下掲1buwについて
- ヘモグロビン（本サイト）
［Hemoglobin - Wikipedia］
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1buw（S-ニトロシル化ヘモグロビン） NO選択 SNC（L-ペプチド架橋）選択 同-S-N=O部分選択 同PDBsumデータ1buw_HEM-NO[HEM 142(A) to NO 143(A)] $ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 ヘム選択 Fe選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
一酸化窒素が結合したS-ニトロシル化ヘモグロビン1buwとそのPDBsumデータ
- Serotonin transporter-ibogaine complexes illuminate mechanisms of inhibition and transport（Nature，2019/04/24） ※2019/04/24公開PDBデータ6dzw（パロキセチン結合）・6dzy（イボガイン結合）・6dzv（同；occluded conformation）・6dzz（同，inward conformation；下掲）
- Treating addiction: Cryo-EM technology enables the 'impossible'（Science Daily，2019/04/24）
- 抗うつ剤と神経伝達物質（本サイト）
［Serotonin transporter - Wikipedia，Ibogaine - Wikipedia］
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6dzz（イボガインと15B8 Fabが結合したセロトニン輸送体；inward conformation） HJM（イボガイン）選択 同PDBsumデータ6dzz_HJM$ ∥ PDBsumデータ6dzv_HJM$ PDBsumデータ6dzy_HJM$ PDBsumデータ6dzw_8PR$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］イボガイン（ibogaine）と15B8 Fabが結合したセロトニン輸送体6dzz
［中］セロトニン輸送体6dzz・6dzv・6dzy（以上イボガイン結合）・6dzw（パロキセチン結合）のPDBsumデータ
［右］イボガイン
- Limbic-predominant age-related TDP-43 encephalopathy (LATE): consensus working group report（Oxford University Press，2019/04/30）
- Atomic structures of TDP-43 LCD segments and insights into reversible or pathogenic aggregation（Nature Structural & Molecular Biology，2018/05/21） ※TDP-43構造例5whn・5whp・5wia・5wiq・5wkb・5wkd・6cb9・6cew・6cf4・6cfh（下掲）
- The N-terminal dimerization is required for TDP-43 splicing activity（Scientific Reports，2017/07/21） ※TDP-43溶液構造例5x4f（下掲）
- TDP-43タンパク質の安定化が神経難病ALSの発症時期のカギ -遺伝性ALS患者81人の臨床情報と生化学的特性の相関を解析-（理研，2012/12/18）
- TDP-43タンパク質による新タイプ認知症LATE - Togetter
- アルツハイマー病治療薬（本サイト） ｜ 別トピック（ALS関連TDP-43，本サイト）
［TARDBP - Wikipedia，Limbic-predominant age-related TDP-43 encephalopathy - Wikipedia］
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6cfhの20量体（Chain A・B×10；TDP-43のSWGMMGMLASQセグメント） 5x4fのModel 1（TDP-43のN末端ドメイン溶液構造） バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］TDP-43のSWGMMGMLASQセグメント 6cfhの20量体（Chain A・B×10） ［右］TDP-43のN末端ドメイン溶液構造例 5x4fのModel 1
- Creation of haemoglobin A1c direct oxidase from fructosyl peptide oxidase by combined structure-based site specific mutagenesis and random mutagenesis（Scientific Reports，2019/01/30）
- 糖尿病マーカー、ヘモグロビンA1cを直接酸化できる酵素の創製 －シンプルかつ短時間測定が可能な新規測定試薬開発に大きく前進－（京都大学，2019/01/31）
- 「HbA1c」を直接に酸化できる酵素を創製 シンプルで短時間の測定が可能に（糖尿病リソースガイド，2019/02/08）
- 酵素 臨床診断への応用 | キッコーマン
- ヘモグロビンA1c - Wikipedia
［Glycated hemoglobin - Wikipedia］
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6a6vのChain A（FADとチオ酢酸フルクトシルが結合したフルクトシルペプチドオキシダーゼ） FSA（チオ酢酸フルクトシル）選択 同PDBsumデータ6a6v_FSA$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
FADとチオ酢酸フルクトシルが結合したフルクトシルペプチドオキシダーゼ 6a6vのChain AとそのPDBsumデータ
- Effect of Sunscreen Application Under Maximal Use Conditions on Plasma Concentration of Sunscreen Active Ingredients（JAMA，2019/05/06） ※“the active ingredients (avobenzone, oxybenzone, octocrylene, and ecamsule)”
- 日焼け止めの血漿濃度はFDAの基準値を上回る 6種類の有効成分が体内に吸収され、長時間高い濃度を保つ（日経メディカル，2020/02/13） ※“6種類の有効成分（アボベンゾン、オキシベンゾン、オクトクリレン、ホモサラート、サリチル酸オクチル、オクチノキサート）”。
- Sunscreen Innovation Act (SIA)（FDA）
- Sunscreen enters bloodstream after just one day of use, study says（CNN，2019/05/06）
- パラオ、有害成分含む日焼け止めを全面禁止 世界初（BBCニュース，2018/11/02）
- Sunscreen - Wikipedia
- 別トピック（本サイト，難燃剤と紫外線吸収剤）
［Avobenzone - Wikipedia，Oxybenzone - Wikipedia，Octocrylene - Wikipedia，Ecamsule - Wikipedia］
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アヴォベンゾン（avobenzone），オキシベンゾン（oxybenzone），オクトクリレン（octocrylene；異性体あり），エカムシュル（ecamsule）の同時表示（左上から時計回りで） ※紫外線（UV）による発がん原因とされるチミン二量体を含むDNAの例：1t4i ［Pyrimidine dimer - Wikipedia，今月の分子 091: チミン2量体 (Thymine Dimers) （PDBj，2007/07）］ バックボーン 二次構造 DNA/RNA（ATGCU，backbone） 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 DNA/RNA選択 DNA/RNA backbone選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
［左］日焼け止め成分例（左上から時計回りで）：アヴォベンゾン（avobenzone），オキシベンゾン（oxybenzone），オクトクリレン（octocrylene），エカムシュル（ecamsule）
［中］紫外線（UV）による発がん原因とされるチミン二量体を含むDNAの構造例 1t4i
［右］参考図：紫外線の種類と紫外線カット製品の例
- The Structural Basis for the Binding of Repaglinide to the Pancreatic KATP Channel（Cell Reports，2019/05/07）
- カリウムチャネル - 脳科学辞典
- レパグリニド - Wikipedia
［ATP-sensitive potassium channel - Wikipedia，Repaglinide - Wikipedia］
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6jb1のChain A・B（レパグリニドが結合したATP 感受性 K（KATP）チャネル） BJX（レパグリニド）選択 同PDBsumデータ6jb1_BJX$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
レパグリニドが結合したATP感受性 K（KATP）チャネル 6jb1のChain A・BとそのPDBsumデータ（ジギトニンが共存）
- Transcription preinitiation complex structure and dynamics provide insight into genetic diseases（Nature Structural & Molecular Biology，2019/05/20）
- Researchers create most complete model of complex protein machinery（Phys.org，2019/05/21）
- 転写中のRNAポリメラーゼIIの構造を解明 －細胞内で働いている巨大複合体の姿を明らかに－（理研，2017/08/04）
- 構造生物学：遺伝子転写開始の構造基盤（Nature ハイライト，2016/05/19）
- 転写開始前複合体 - Wikipedia
［Transcription factor II H - Wikipedia，Transcription preinitiation complex - Wikipedia］
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バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 消去 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
ヒトの転写因子TFIIH 6o9m
- Structure of the MDM2 Oncoprotein Bound to the p53 Tumor Suppressor Transactivation Domain（Science，1996/11/08） ※下掲1ycrについて
- In Vivo Activation of the p53 Pathway by Small-Molecule Antagonists of MDM2（Science，2004/02/06） ※下掲1rv1について
- 他のMDM2関連研究例
- Mdm2 - Wikipedia
- 抗がん剤開発と標的タンパク質（本サイト）
［Mdm2 - Wikipedia］
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1ycr（p53に結合したMDM2） 1rv1（阻害剤ニュートリン-2〈nutlin-2〉が結合したMDM2） 同Chain A 同PDBsumデータ1rv1_IMZ$ ［Nutlin - Wikipedia，Nutlin-2 | C31H34Br2N4O4 - PubChem］ 8j81（ペプトイド〈ペプチド類似構造分子〉が結合したMDM2） 同PDBsumデータ8j81_UAC$ バックボーン 二次構造 全選択 タンパク質選択 リガンド選択 空間充填 球棒 球60％ スティック 針金 アミノ色 Chain色 CPK色 ∥ Jmol色 Rasmol色 酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順（特性基 R） 等電点順 コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド） 水素結合表示 背景・黒 灰 白 紺 |
p53に結合したMDM2 1ycrと阻害剤ニュートリン-2（nutlin-2）が結合したMDM2 1rv1のChain A，および後者のPDBsumデータ
ペプトイド（ペプチド類似構造分子）が結合したMDM2 8j81とそのPDBsumデータ