第１章　分子のかたち，分子の見方
　　　　　　どうして分子で考えるのだろう
　　　　　　身の回りの分子　－商品のラベルから
第２章　分子事典

• 基本分子
• 生体分子(1)…アミノ酸，糖類
• 生体分子(2)…脂質関連物質
• 生体分子(3)…ビタミン，その他
• 天然成分［植物由来］
• 天然成分［動物由来］
• 天然成分［微生物由来］
• 医薬・農薬
• においの成分
• 味覚の成分
• 色彩と分子
• 界面活性剤
• 高分子
• 環境ホルモン関連分子
• その他の環境問題関連分子
第３章　多彩なおもしろ分子の世界　－炭化水素を中心として
第４章　分子をよりよく知るために　－有機化学の基礎
　　　　　　有機化合物の成り立ち
　　　　　　有機化合物の分類とあらわし方
　　　　　　分子計算の概要
CD-ROM版分子事典の利用方法
※付録CD－ROMにはChemscapeChimeインストールプログラムと分子データ1200以上を収録！
（Windows95/98/NT，Macintoshで利用可能）

● 2006/11に日本語版がリリースされたIE7ではChime利用によりいくつかの問題があるようですので，IE7にChimeをインストールしないでください！（配布元で対応検討中とのことです）
　2007/01/30に発売されたWindows Vistaでは標準ブラウザがIE7ですので十分ご注意ください。

● 2006/04のInternet Explorer（IE）用修正パッチにより（関連情報），CD収録の一部コンテンツをIEで参照するとエラーになる場合がありますのでご注意ください（書籍用分子データリスト始め，筆者が再確認した範囲では問題ありませんでした）。本WebサイトのChime利用コンテンツの一部が影響を受けていますが，別ブラウザのFirefox（京都女子大・小波先生の情報，MolviZ.Orgの情報参照）やNC4.7Xではトラブルはありません。ただし，MDLではFirefoxでの動作は保障していませんのでご注意ください。

● 2006/01/20，9刷が発行されました。お詫びになりますが，今回の増刷でこれまで欠落していた分子データのリモニン（本文p.169；右の画像）を追加させていただき，CDラベルに目印として★★★★★★を付けました。８刷までを買われた方は申し訳ありませんが，データを以下に置きましたので，お手数ですがダウンロードしてご利用ください。

　また，現在書き込みを不可能にしてある，Ｑ＆Ａコーナー（読者との交流ページ）に代わって別の掲示板を公開しましたので，旧掲示板の過去ログもお読みになられた上で書籍とCDに関する問い合わせをお書き込みください。なお，本書記載内容と関係しない化学や分子に関する質問等には対応できませんのでご了承ください。

● Windows XP Service Pack2（以下 WinSP2）を導入すると，CD-ROMやHDにコピーした分子データ（ローカルファイル；ネット上のデータは問題なし）を閲覧するたびに，下図(a)の□で囲んだような警告が表示されることがあります。その場合はお手数ですが，下図(b)，(c)の○印の部分を続けてクリックして，分子を表示させてください。これはChimeだけでなく他のソフトウェア等でも見られる現象です。今後の対応についてはMDL社に問い合わせ中です。なお，次項で紹介のNC4.Xではこの症状は出ませんので，必要に応じてご利用ください。

(a)　WinSP2上のIEでChimeで分子をする際に表示される警告メッセージ。

(b)　警告バーをクリックして出てくるメニューの“コンテンツを許可”を左クリック。

(c)　続いて，“はい”を左クリックすれば分子が表示される。

【別法】 以下のようにすることで警告が表示されなくなりますが，Windowsのセキュリティを低下させる方法ですので，利用者の責任で行ってください。この方法でトラブルがあっても，筆者および出版社では責任を持てません。

(d)　IEの「ツール」の「インターネットオプション」を選択。

(e)　「詳細設定」タブをクリックし，「セキュリティ」項目ある「マイコンピューターのファイルでのアクティブコンテンツの実行を許可する」（→印；CDだけで使う場合はその上の→印でもよい）というボックスにチェックを入れて「適用」ボタンに続いて「OK」ボタンをクリックする。CD（HD）データ参照後は，「許可」のチェックを必ずはずすこと。

● 2003/08/18発行の「パソコンで見る動く分子事典」8刷の付録CD（★★★★★付き）には，Internet Explorer 6（IE6）に対応したChime2.6SP6を収録しました（サブフォルダにはSP3同梱；2006/11に日本語版がリリースされたIE7には未対応のようですのでChimeをインストールしないでください）。ただし書店に置かれている分子事典の中には7刷以前のものもありますので（CDの★の数が4以下），収録プログラムで分子が表示されない場合（または書籍を購入していない方）はChime最新版を以下の要領でダウンロードしてインストールしてください。WindowsやIEのバージョンによっては旧版のChimeが適している場合もありますので，ダウンロード時に確認してください（Macも同様）。
　なお，京都女子大学現代社会学部・小波先生のChimeの本格インストールをしよう！ [UPDATE!]（教材やChimeマニュアルも参照）にも，および，金沢大学・国本先生のChimeチュトリアルにも，ダウンロードとインストールの方法やChimeの利用方法が大変わかりやすく書かれています。
　また下記ダウンロードサイトでWindows版は2004年8月現在SP5・SP6だけが掲載されていますが，98SE/Me＋IE6， 98SE/Me＋NC4.7X でも動作することが確認できました。
　さらにMDLサイトにFAQのページ（What Are The Most Frequently Asked Question About MDL Chime and MDL Chime Pro?）が設けられた上に，FTPサーバで SP3 など旧バージョン がダウンロードできるようになりました（“MDL_Chime_Windows”に入って以下の対応表を参考に必要なzip形式のファイルを保存して解凍）。

[1] IE5.0以上のブラウザでChimeのページにアクセスして最初に○の 登録 をクリックして以下のように利用者登録をします。一度登録すればその後は ログイン で他のプログラムのダウンロード等も可能です。

[2] *印のある■色の欄に必要事項を書き込み，国名なども選択をします。ユーザー名（メールアドレスでもよい）は記入したメールID宛てに後で送られてくるパスワードとペアでログイン時に使うものです。■色の欄には必ずチェックを入れ，一番下の 続行 ボタンを押します。

[3] 該当する専門分野などにチェックを入れて 続行 ボタンを押します。登録したユーザー名と与えられたパスワードでログインができたらメニューでChimeのページを選択して該当の機種・OSを確認して先に進み， START DOWNLOAD ボタンのあるページでダウンロードして，そのままインストールプログラムを実行します。インストール方法は，本書p.316～をご参照ください。

　またNetscape Communicator（NC）の場合はバージョン4.7X（ダウンロードサイト）までに対応していて，それ以上のバージョン（6，7）での動作は正式には保障されていません（次項参照）。NC4.7Xを追加インストールする際（htm・htmlファイルの関連付け設定などにご注意），すでにChimeを使用していた場合はChimeをアンインストールし，NCインストール後にChimeを再インストールしてください。Chime Resourcesサイトの情報（英文）も参考になります。

●上記インストール方法でも紹介している京都女子大学の小波先生のページでは，IE（IE6以前；IE7にはインストール不可）にインストールした後であればFirefoxやNCの最近のバージョンでもChimeが利用できることを解説しています。ただし，MDL社が動作保障しているのはあくまで上表の環境ですので，他のブラウザでのChime利用は各自の責任でお願いします。

●国立科学博物館の展示で「動く分子事典」の分子データが活用されています。→ 国立科学博物館で分子と遊ぼう!!

●「動く分子事典」のある風景

2004/08/28-29と上京し，初めて書籍数が最大という池袋ジュンク堂書店へ（2003年は福岡・広島・神戸・京都のジュンク堂を踏破）。ブルーバックスのコーナーには7刷が縦積み（？）になっていました。	2004/09/14オープンの丸の内オアゾにできた丸善，写真はその開店の日に撮ってもらったものです。	2005/03/25，日本化学会年会の研究発表で上京して2004年開店の新宿ジュンク堂へ。開店直後に行く予定だったが，中越地震で断念していたもの。

●著者の一人である川端さんが，2000/10の『ビギナーズ有機化学』に続いて，2005/04には『ビギナーズ有機構造解析』（化学同人）を出版されました ＼(^^)／。

●2004/09/13，函館高専の長尾先生から，CDにも収録（chem8/c6a_c60.mol）しているカリックス[6]アレーン ＋ Ｃ60のデータから作成された3Dクリスタル（PDF資料参照）の写真が届きました。

●WPC-expo 2003（幕張メッセ，2003/09/17-20）およびCEATEC JAPAN 2003（幕張メッセ，2003/10/07-11）に参考出展されている，東芝の新しい3次元ディスプレイのデモデータとして，本書の分子モデルが採用されました（取材記事例）。以下が同社から提供していただいた会場の写真です（何頁に出ている分子でしょうか？；画像クリックで拡大）。

●本書が環境省が収録されている化学物質と環境に関する学習関連資料データベースが更新されました（2003/06/18公開の旧版）！ → 本書情報 [UPDATE!]

●2002年8月発行の6刷以降（CDに★マークが3個以上）には，広島大学・吉田弘先生のご厚意により，分子モデリングソフトウェエアMOLDAのインストールプログラム（Windows版）を同梱させていただくことができました。吉田先生に感謝し，ご報告させていただきます。
　なお，2002年にはMOLDAサイトで平成14年度情報処理振興事業協会未踏ソフトウェア創造事業『第一原理に基づいた分子言語による生命プログラミング』が実施され，MOLDA for Protein ModelingおよびMOLDA Qulisのダウンロードが可能になりました（関連講演[PDF]，および経済産業省資料・IPA資料参照）。
［続報］　2003年9月，MOLDA QuLiS の製品版〔15日間試用可〕がマックスネット社から提供開始になりました。

　2005/01/02，MOLDA開発者の吉田弘先生が突然ご逝去されました。これまで，本誌へのMOLDA搭載のほかにも，分子振動データ集，iモルダなど，数知れぬほどお世話になりました。ここに改めて御礼申し上げると同時に，謹んでご冥福をお祈りいたします。

●本書についてはいろいろなサイトで紹介等をしてもらっており，本当に感謝しています。以下にいくつか紹介させていただきます（2003/03時点）。

• 蔵書としている大学図書館一覧（NACSIS Webcat検索結果）
• ふしぎの国かがく：3Dグラフィッククイズ（夢・化学-21 キャンペーン事業）
• CBI学会の活動に関した参考文献
• 立花隆の本の世界 ｜ ネコビル1階（書棚21-4）　※「動く分子事典」の写真クリックでAmazonの書籍発注画面へ（現在リンク切れ）
• 独断と偏見のＳＦ&科学書評／書評
• MOLDA関連リンク集
• 市民のための環境学ガイド／アトピーはリノール酸の過剰摂取
• 高校生物教育の小箱／RasMolの使い方
• scilla／分子模型　１（基本）
• 有機化学美術館／抗生物質の危機（２）
• 天道虫の視点／でんぷんのらせん構造
• おしゃべり分子栄養学／飽和脂肪酸と不飽和脂肪酸

●「動く分子事典」CD-ROM収録分子（Web公開版も同様）のベンゼン環の表現は，下図のようにケクレ構造（単結合と二重結合が交互になっているもの；下図左上）とそうでないもの（3D表示ではすべて単結合に見えるもの；下図右上）があります。これは分子データを複数の計算ソフトで作成しており，各ソフトのデータファイル形式に依存しているためです。2D表示（Chimeマニュアル参照）するとそれぞれ下段の図のようになり，右側の分子も構造式で六角形に○の表示にする場合に準じていることがわかります。「動く分子事典」p.30もご参照ください。

ベンゼン環の異なった表示例（農薬の2,4,5-Tの場合；Chimeデータ→左，右）。
※参考：市販分子科学計算ソフトウェアの出力分子表示例

●Macで付録CD-ROMデータを閲覧する場合，利用環境によっては分子モデルが表示されずに構造データがテキストで表示される場合があります。このような場合の対処方法について，冨永研究室びじたー案内運営者の天羽さんが以下にお書き下さっていますのでご参照下さい。同氏にはこの場で深く感謝いたします。

●2001年2月，第4刷をご購入くださった北海道の読者の方から，お嬢さん（2000年11月で４歳半とのことです）と「動く分子事典」の分子データを見たりZome Toolという模型キットで分子モデルを組み立てたりしているということで，写真を添付で送っていただきました（読者交流掲示板にも書き込みをしていただいています）。おそらく本書の最年少読者ではないかと思いますので，ご一家の了解をいただいた上で以下に転載させていただきます。

●日本農芸化学会誌・2000年7月号の書評欄で，香川大学農学部の合谷祥一先生から，本書について過分な紹介とご推薦をしていただきました。ここに厚く御礼申し上げます m(_ _)m。

●2000年に，「動く分子事典」とMDLロゴ入り時計が当たる分子クイズを実施しました（解答編も公開）。

●Windows／Internet Explorerでご利用の方へ（★マークが1つもついていないCDについてのみ）

　CD-ROMの分子データを参照する際に，Windows上のInternet Explorerでmol形式のファイルを直接読み込むと（HTMLによってページ内の分子として表示されるときは問題ありません），ロングファイル名の分子データの場合，同じディレクトリにそれと近い名前の分子データがあると，そちらの方が表示されてしまうことがあります。そのようなときは，後述のようにHDにコピーするか（データ全量は約30MBです）ブラウザをNetscape Communicatorに変更してご覧ください。

例（本文，p.56参照）
・β-D-フルクトース（ピラノース型）　dic/natural/fructose.mol　　正常
・β-D-フルクトース（フラノース型）　dic/natural/fructose_f.mol　上と同じ分子が表示
・教材データ〔HTML〕・糖類　　dic/sugar1.html　　上の2つが正常に表示

［注］ロングファイル名とは上のfructose_f.molのfructose_fのようにファイル名が8文字（半角換算で）を超えるものです。これはWindowsのエクスプローラで確認できますが，疑問のある分子データについてHDにコピーする以外のやり方で正しく見る方法としては，その分子データをエクスプローラからデスクトップにドラッグしてコピーし，それをダブルクリックしてInternet Explorerで参照する手段もあります。
　ロングファイル名のデータをCD-ROMに焼き付ける際に生じた問題のために異なった分子が表示されるものは，以下のようになります（「分子モデル全リスト」bunsi_all.htmlで参照できる分子について；▲（異常）は△（正常）が表示されてしまう）。

chem3/fulgide_c.mol=フルギドの例［閉環体］ △
chem3/fulgide_n.mol=フルギドの例［開環体］ ▲
chem5/curcumin.mol=クルクミン △
chem5/curcumin1.mol=クルクミン［中・酸性：黄色］ ▲
chem5/curcumin3.mol=クルクミン［アルカリ性：赤色（推定構造）］ ▲
dic/natural/b_endorphin.mol=β-エンドルフィン(1) △
dic/natural/b_endorphin0.mol=β-エンドルフィン(2) ▲
dic/natural/chlorophyll_a.mol=クロロフィルa △
dic/natural/chlorophyll_b.mol=クロロフィルb ▲
dic/natural/fructose.mol=β-D-フルクトース（ピラノース型） △
dic/natural/fructose_f.mol=β-D-フルクトース（フラノース型） ▲
dic/natural/lecithin17a.mol=レシチンの例（ジステアロイルレシチン）(1) ▲
dic/natural/lecithin17b.mol=レシチンの例（ジステアロイルレシチン）(2) △
dic/natural/paraquat.mol=パラコート(1)〈農〉 △
dic/natural/paraquat_b.mol=パラコート(2)〈農〉 ▲
dic/natural/pyrethrin1.mol=ピレトリン △
dic/natural/pyrethrin2.mol=ピレトリン ▲
dic/natural/tetrodotoxin.mol=テトロドトキシン(1)〈毒〉 △
dic/natural/tetrodotoxin2.mol=テトロドトキシン(2)〈毒〉 ▲
dic/nioi/nootkatone1.mol=ヌートカトン／ノオトカトン △
dic/nioi/nootkatone2.mol=ヌートカトンの光学異性体 ▲
dic/oc_cd/borazine.mol=ボラジン(1) △
dic/oc_cd/borazine_s.mol=ボラジン(2) ▲
dic/polymer/melamine.mol=メラミン △
dic/polymer/melamine_r.mol=メラミン樹脂〈高〉 ▲
poly/pvc10iso.mol=ポリ塩化ビニル（PVC）［繰り返し単位×10；イソタクチック構造の例（直線構造）］〈高〉 △
poly/pvc10iso2.mol=ポリ塩化ビニル（PVC）［繰り返し単位×10；イソタクチック構造の例（ねじれ構造の例）］〈高〉 ▲

●化合物数

　p.238に知られている化合物数として15,863,548（1996年12月現在）という数字をあげましたが，CASによる以下のサイトで最新データを知ることができます（URLは時実象一さんのページで知りました）。

●“ChemscapeChimeマニュアル(2) 　－分子の表示形式の変更－”の改訂版

　CD-ROMのメインメニューから参照できる標記Chimeマニュアルを更新してWeb上に転載しました。HDにデータをコピーしてお使いの方は，以下のファイルをダウンロードして解凍される４つのファイルを，データの入っているフォルダ（ディレクトリ）の中の“dic”に上書きコピーすれば改訂版を利用できます。

●付録CD-ROMデータのハードディスクへのコピーについて

　学校における教育目的で，複数台のパソコンで本書付録CD-ROMのデータを利用したい場合は，その台数分だけ本書を購入していただく必要があり，ハードディスクにコピーして使う場合やLANの場合であっても同様です。これは，著作権で認められている複製（コピー）は私的な利用（それも限定的な範囲で）に限られているためです。
　ただし，本書CD-ROMのオリジナルデータは，CDのフォルダ（ディレクトリ）“dic”にすべて入っており，それ以外のフォルダのデータはWeb上で公開済みのものですので，複数のハードディスクにコピーして戴いても構いません。以下に，“dic”のデータを除いた分子データ一覧のHTMLを置きましたので，ダウンロードしてご利用してください（lzh形式で圧縮してあります）。
“dic”のデータを除いた分子一覧HTML（lzh形式で圧縮）

　また，上記リストの改訂最新版（オンライン版参照）と分子データ約800を一緒にまとめて圧縮したものをダウンロードすれば，同様にオフラインでの利用が可能になります（分子データが含まれるので，ファイルサイズが702,493bytesと大きくなっています）。

Web公開分子一覧HTML＋分子データ（lzh形式で圧縮）

●本文掲載のURLに直接接続（最新URL）

p.314　ブラウザ（Internet Explorer）のダウンロード
p.314　ブラウザ（Netscape Communicator）のダウンロード　〔Chime2.6はNC4.7X以下のバージョンが必要；詳細はMDLで確認〕
p.321　Chime最新版のダウンロード
p.324　構造式エディタISIS/Drawのダウンロード　〔2000/12，URL変更〕
p.332　Brookhaven Protein Data Bank
　　（URL変更ですが，旧URLからでも新URLにつながります；CDのデータからリンクしてあるものも同様）

●読者の方から，本誌付録のミニCD-ROM（8cmCD-ROM）を『8cmDISKは決していれてはいけません』と書かれているドライブに入れてトラブルになったとのご報告がありました。8cmCDの溝のあるドライブや中心の穴にはめるタイプは大丈夫だと思いますが，直接CDをドライブに差し込む形式のものでは使用不可能の場合があるかも知れません。パソコンまたはCD-ROMドライブのマニュアルをご確認の上ご利用ください。詳細は上記交流ページへ。

●本書は発行直前まで最新情報を盛り込む作業をしたこともあって，初版第１刷では若干のミスがありました。また読者の方々から，内容について疑問点などを指摘していただいています。本ページで随時修正情報・追加情報をお知らせし，より正確な情報提供を心がけたいと思いますので，よろしくご了承ください。
　2000/12発行の第４刷以降では以下の内容はすべて修正してあります。

※HDにCDのデータコピーしてお使いの方は（上記注意事項にご注意ください），以下の修正データ（以下の各最左欄にあるもの）をダウンロードして（各ファイル名をマウスで右クリックして表示されるメニューから『リンクを名前を付けて保存』を選んで任意のフォルダに保存〔Windowsの場合〕），指定フォルダにコピーすれば，そのまま最新データを利用できます。ただし，CDからHDにコピーしたデータは上書きできませんので，一旦古いデータを削除してから保存してください。