◆ 今週の分子 ◆
連載89(2005/06/02〜):
メタロチオネインの例(PDBデータ1DMDより)

 最近入手した本2冊に,植物を使って土壌中の有害重金属等を吸収・除去するファイトレメディエーションでも注目されているメタロチオネインが取り上げられていました。

 ポリペプチドになりますが,チオール基(-SH)をもつシステイン(Cys)が多く,以下ではそのS(硫黄,)原子が協力してカドミウム(Cd,)をしっかり捕まえていることがわかります。メタロチオネインはこのように有害な重金属を補足して生体への悪影響を防いだり,必要な微量重金属を運搬したりするタンパク質の一種になります。


メタロチオネインの部分データ例
1DMD(NMR, 18 Structures;アオガニCallinectes sapidus由来)から作成
※システイン(Cys)のチオール基の硫黄が有害なカドミウムを補足
    Model 1  Model 2  Model 3  Model 4 
    Model 5  Model 6  Model 7  Model 8 
    Model 9  Model 10 Model 11 Model 12
    Model 13 Model 14 Model 15 Model 16
    Model 17 Model 18
    Model〜18のアニメーション # アニメーション  OFF
全選択 タンパク質選択 Cd選択 S選択
空間充填 球棒 スティック OFF
原子球大き目
CPK色 アミノ色 | ラベル表示 OFF
ドット表面表示 OFF
静電ポテンシャル OFF
親油ポテンシャル OFF
光沢表示 OFF 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF 画像をクリップボードへコピー
#印データはアミノ色表示および以下の表示変更不可
水素結合(細) 同(太) OFF
S原子空間充填
タンパク質・バックボーン 同・二次構造
酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
hydropathy index順
等電点順

※amino表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO

= 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 =
酸性中性芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET
 PHE TYR TRP LYS ARG HIS

極性酸性塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG
HIS
 GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP

※hydropathy index順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY
 ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE

※等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP
VAL GLY LEU
 ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG


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