今週の分子

◆ 今週の分子 ◆
連載95（2005/09/01～）：DNAのG-四重らせん構造の例（PDBデータ2A5Rより；Chime版）
＝テロメアと『テロメアの帽子』の話題を含めて＝
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　今年6月に創刊されたNature Chemical Biologyの最新トピック（無料の利用者登録が必要）の中に，

という記事が出ていたのを参考に，見慣れている二重らせん構造とは異なったDNAの一面を表現してみた。なお，四重らせん構造（四重鎖構造）は，テロメア（telomere）DNAでも見ることができ，こちらではG-四量体の中央にK⁺イオンが存在する。

DNAのG-四重らせん構造の例　

初期表示（1組のG-四量体の強調）

2A5RのModel 1（初期表示；ポルフィリン含む）
※1組のG-四量体を空間充填表示，ポルフィリン（ポルフィン）誘導体をスティック表示

2A5PのModel 1（ポルフィリンなし）
　G-四量体例選択（2A5R・2A5P共通）
　　

その１（6,15,19,24），

その２（5,9,14,18），

その３（4,8,13,17），

１～３

参考（ヒトのテロメアDNAの例；ヒトのテロメア反復配列はTTAGGG）

1KF1*　

“テロメアの帽子”表示（話の種参照）
　G-四量体例選択（1KF1）
　　

その１（4,10,16,22），

その２（3,9,15,21），

その３（2,8,14,20），

１～３
　テロメア配列TTAGGG選択（1KF1）
　　

その１（5-10），

その２（11-16），

その３（17-22），

１～３

1K8P*
　G-四量体例選択（1K8P）
　　

その１（5,11,17,23），

その２（4,10,16,22），

その３（3,9,15,21），

１～３

バックボーン

DNA/RNA（ATGCU）

リガンド表示

OFF

Water表示（*印データのみ）　

OFF

DNA全選択同backbone選択
リガンド選択全選択
空間充填球棒スティック OFF
CPK色 DNA/RNA色（ATGCU）
ドット表面表示 OFF
光沢表示 OFF ｜光量30% OFF
背景・黒背景・灰背景・白
回転 OFF
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【話の種】

〔左〕絵本「テロメアの帽子」のサイト
〔右〕1KF1データで作成したテロメアの“帽子”（テロメアの繰り返しTTAGGG×3を球棒表示，G-四量体×3とK⁺イオンを空間充填表示）