◆ 外膜デカヘムシトクロームc MtrFのSITE例 ◆
生命を知り生命に学ぶ
PDBsumのLigand-SITE情報と有機性・無機性金属原子を含む生体分子のSITEデータ集


3PMQRCSB PDBPDBsum

バックボーン 二次構造
全選択 タンパク質選択 リガンド選択
空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド#
水素結合(太) OFF
 
 
背景・黒 灰 白 



デカヘムとSITE部分: 3pmq_HEC 670(A)〜3pmq_HEC 679(A) を結合
I'/O'=1.1042(I'=8900,O'=8060)
全選択 タンパク質選択 リガンド選択
空間充填 球棒 球60% スティック スティック(太) 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド#
 
背景・黒 灰 白 



3pmq_HEC_670
I'/O'=0.6948
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 

3pmq_HEC_671
I'/O'=1.4358
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 

3pmq_HEC_672
I'/O'=0.9621
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 

3pmq_HEC_673
I'/O'=1.1783
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 

3pmq_HEC_674
I'/O'=1.2606
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 

3pmq_HEC_675
I'/O'=0.4927
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 

3pmq_HEC_676
I'/O'=1.3054
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 

3pmq_HEC_677
I'/O'=1.1678
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 

3pmq_HEC_678
I'/O'=1.5057
1 CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 

3pmq_HEC_679
I'/O'=1.4613
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順
背景・黒 灰 白 



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