◆ 今週の分子 ◆
★連載39(2003/10/15〜):
正常プリオンタンパク質例(PDBデータ1QLZより)
 2003年9月に牛海綿状脳症と疑われた生後23ヶ月の牛の検査から,今までにないタイプとされる異常プリオンタンパク質が見つかりました。その後イタリアやフランスなどでも同じ型と思われるプリオンが見つかっていることがわかり,感染源や感染力などを共同で研究していくことになりました。
 以下は2002年度ノーベル化学賞を受賞したビュートリッヒ博士らのNMR分析による正常なヒトのプリオン構造例です。

狂牛病とプリオン/牛海綿状脳症(BSE)

正常なプリオンタンパク質例である1qlzのModel 1
(PDBのオリジナルデータ


※amino表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO

= 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 =
酸性中性芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET
 PHE TYR TRP LYS ARG HIS

※hydropathy index順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY
 ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE

※log P値順
ARG ASP ASN GLU GLN HIS GLY SER LYS THR
ALA PRO
 CYS VAL TYR MET ILE LEU PHE TRP

※有機概念図I/O値順(特性基 R
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS
TYR TRP
 CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE

※同上(アミノ酸)
GLY SER ASN ASP GLN THR GLU ALA ARG HIS
VAL LYS
 CYS PRO LEU TYR ILE MET TRP PHE
Backbone 2oStructure Termini
DNA/RNA(ATGCU
Ligands表示 OFF
Water表示  OFF

Protein選択 DNA/RNA選択
Ligand選択 全選択
空間充填 球棒 スティック OFF
CPK amino | ラベル表示 OFF
酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
hydropathy index順(Protein)
log P値順(Protein)
有機概念図I/O値順(Protein特性基 R)| 同(アミノ酸)
Dot Surface表示 OFF
水素結合(細) 同(太) OFF
S-S結合(太) OFF
S原子(Protein中)空間充填
静電ポテンシャル 同(透明) OFF
親油ポテンシャル 同(透明) OFF
Specular OFF 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF
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